定量分析ChIP-qPCR數(shù)據(jù)的方法：Percent Input法和富集倍數(shù)法步驟介紹

瀏覽次數(shù)：3124　發(fā)布日期：2023-2-22　來源：本站　僅供參考，謝絕轉(zhuǎn)載，否則責(zé)任自負(fù)

ChIP-qPCR 數(shù)據(jù)需要針對(duì)可變性來源進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化，包括染色質(zhì)數(shù)量、免疫沉淀的效率（富集效率）和 DNA 回收率。

兩種常用的標(biāo)準(zhǔn)化 ChIP-qPCR 數(shù)據(jù)方法——Percent Input法和富集倍數(shù)法（Fold Enrichmen）。與input相關(guān)的ChIP-qPCR數(shù)據(jù)包括ChIP的背景水平和input染色質(zhì)的標(biāo)準(zhǔn)化。建議ChIP 實(shí)驗(yàn)重復(fù)，盡可能將結(jié)果與背景信號(hào)和標(biāo)準(zhǔn)誤差一起顯示。

Percent Input法
使用這種方法，從ChIP獲得的信號(hào)除以從input樣本中獲得的信號(hào)。input樣本代表ChIP中使用的染色質(zhì)數(shù)量。通常1%的起始染色質(zhì)用作input。

示例：計(jì)算input百分比

注意：如果起始input為1%，則從稀釋input的Ct值中減去100或6.644 cycles（100的log2）的稀釋因子（DF）。

富集倍數(shù)法
這種標(biāo)準(zhǔn)化方法也稱為“背景信號(hào)”或“相對(duì)無抗體對(duì)照”。該方法將ChIP 信號(hào)除以無抗體信號(hào)，將ChIP信號(hào)表示為信號(hào)相對(duì)于背景信號(hào)的倍數(shù)增加。該方法建立在背景信號(hào)的水平在不同的引物組、樣品和重復(fù)實(shí)驗(yàn)間可重復(fù)的假設(shè)上。背景信號(hào)水平在引物組、樣品和實(shí)驗(yàn)之間有所不同。

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標(biāo)簽： ChIP Percent Input法富集倍數(shù)法

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