BMC Genomics: Let-7b調(diào)控矮腳雞的骨骼肌生長和脂肪沉積
瀏覽次數(shù):2372 發(fā)布日期:2012-11-22
來源:聯(lián)川生物
生長激素受體(Growth Hormone Receptor, GHR)基因的一個缺失突變將抑制矮腳雞的骨骼肌生長和脂肪沉積。華南農(nóng)業(yè)大學(xué)李玉谷教授和張細權(quán)教授領(lǐng)銜的課題組從miRNA角度入手,分析了miRNA調(diào)控GHR表達進而影響骨骼肌生長和脂肪沉積的機制。這一研究成果于近期發(fā)表于BMC Genomics*。
課題組利用miRNA微流體芯片(聯(lián)川生物提供技術(shù)服務(wù))和基因芯片篩選分析了同一發(fā)育階段和不同發(fā)育階段矮腳雞的差異表達miRNA和基因。在相同發(fā)育階段,相比于正常雞,矮腳雞骨骼肌中有4個miRNA存在差異表達(miR-1623,miR-181b,let-7b,和miR-128)。而在不同發(fā)育階段,則有更多差異表達的miRNA。相比于14天齡胚胎,7周齡矮腳雞中有11個miRNA表達上調(diào),18個表達下調(diào),而在7周齡正常雞中則有7個miRNA表達上調(diào),9個表達下調(diào)。在骨骼肌中,相比于7周齡矮腳雞,14天齡胚胎中有22個基因表達上調(diào),33個表達下調(diào),而相比于7周齡正常雞,卻有65個基因表達上調(diào)和108個表達下調(diào)。進一步對34個差異表達miRNA根據(jù)重疊種子區(qū)域和靶標(biāo)序列分為18個類別。只有l(wèi)et-7b作用的靶點位于GHR基因的3'非編碼區(qū),并能抑制其表達。通過KEGG Pathway分析和qPCR實驗發(fā)現(xiàn)有三個主要的信號通路調(diào)節(jié)雞的骨骼肌生長和脂肪沉積。而這些通路都受let-7b調(diào)控的GHR影響。研究還發(fā)現(xiàn)抑制細胞因子信號3(Suppression Of the Cytokine Signaling 3 , SOCS3)基因參與了脂肪細胞因子信號通路。
*Lin SM, Li HM, Mu HP,et al. (2012) Let-7b regulates the expression of the growth hormone receptor gene in deletion-type dwarf chickens. BMC Genomics 13: 306.
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