近日,在美國(guó)FDA召開(kāi)的專(zhuān)家咨詢會(huì)議中,針對(duì)Sarepta Therapeutics和羅氏(Roche)聯(lián)合開(kāi)發(fā)的SRP-9001這一基因療法,F(xiàn)DA細(xì)胞、組織和基因治療咨詢委員會(huì)(CTGTAC)以8:6的微弱投票優(yōu)勢(shì)對(duì)其通過(guò)加速審批通道上市予以支持。作為一款特異性靶向治療杜氏肌營(yíng)養(yǎng)不良癥(DMD)的新型療法,SRP-9001通過(guò)AAV遞送編碼基因,促使微肌營(yíng)養(yǎng)不良蛋白增加以改善患者的肌肉功能。
盡管SRP-9001已獲得委員會(huì)的支持,但最終審查結(jié)果猶未可知。FDA可能存在的顧慮在哪里?其安全性和有效性到底能否得到認(rèn)可?
這里我們從臨床前研究的角度出發(fā),圍繞以下幾個(gè)要點(diǎn),一起走近DMD基因治療及其相關(guān)疾病模型:
1.關(guān)于杜氏肌營(yíng)養(yǎng)不良癥
2.代表性基因療法及相關(guān)模型:AAV補(bǔ)充mini基因、ASO跳躍外顯子、CRISPR基因編輯
3.針對(duì)疾病模型短板可采用怎樣的創(chuàng)新策略
關(guān)于杜氏肌營(yíng)養(yǎng)不良癥
杜氏肌營(yíng)養(yǎng)不良癥是由DMD突變導(dǎo)致的抗肌萎縮蛋白功能異常,最終造成肌肉進(jìn)行性壞死的X染色體隱性遺傳性罕見(jiàn)病。其發(fā)病率約為36/10萬(wàn),中國(guó)約有6-10萬(wàn)患者,屬于罕見(jiàn)病中的常見(jiàn)病,是全球最常見(jiàn)的肌營(yíng)養(yǎng)不良類(lèi)型。
DMD代表性基因療法及相關(guān)模型
DMD的基因治療主要分為三個(gè)類(lèi)型:通過(guò)AAV補(bǔ)充mini dystrophin或micro-dystrophin;ASO跳躍外顯子療法;CRISPR基因編輯。
通過(guò)AAV補(bǔ)充mini dystrophin或micro-dystrophin
如果能起到作用的話,這種療法所適用的患者范圍有可能是最廣的,因?yàn)檠a(bǔ)充療法對(duì)不同突變情況的患者都可能起作用。Sarepta、Roche、Solid等公司正在布局這類(lèi)AAV遞送mini dystrophin或micro-dystrophin療法,其中屬SRP-9001進(jìn)展最快。
該管線的臨床前動(dòng)物實(shí)驗(yàn)用到的是DMD疾病研究經(jīng)典模型mdx[1],mdx小鼠23號(hào)外顯子的CAA密碼子突變?yōu)門(mén)AA終止密碼子進(jìn)而導(dǎo)致基因表達(dá)異常。mdx小鼠雖然出現(xiàn)了DMD的疾病表型,但相對(duì)于患者的實(shí)際情況來(lái)說(shuō):
(1)mdx小鼠表型更輕微,特別是在纖維肌溶解、肌肉萎縮方面;
(2)mdx小鼠的壽命大概是正常小鼠的80%,而DMD患者的壽命平均只有健康人群的1/3;
(3)mdx小鼠突變位點(diǎn)在E23,并非熱點(diǎn)突變位置,不太符合疾病同源性。
另外,mdx小鼠的不同背景表型還存在有些許不同的情況,這使得在mdx小鼠上進(jìn)行研究需要考慮更多因素。
ASO跳躍外顯子療法
作為DMD相關(guān)基因治療管線中數(shù)量最多的一種,ASO跳躍外顯子療法得益于ASO的靶向性強(qiáng)、易于合成等優(yōu)勢(shì),Sarepta、Nippon、DYNE等藥企都有所布局,靶向跳躍的外顯子有44、45、50、51、53等,且文獻(xiàn)中也出現(xiàn)多個(gè)外顯子跳躍療法。
Nippon的管線NS-065/NCNP-01通過(guò)ASO靶向跳躍外顯子53,臨床前動(dòng)物實(shí)驗(yàn)使用了mdx52小鼠[2],該小鼠Dmd基因的52號(hào)外顯子缺失,導(dǎo)致在E53上終止翻譯。mdx52小鼠相對(duì)于mdx小鼠來(lái)說(shuō),雖然突變位點(diǎn)更接近于患者的熱點(diǎn)突變位置,更適合ASO基因治療,但在鼠源Dmd基因上篩選用于靶向人DMD基因的特異性ASO是存在一定風(fēng)險(xiǎn)的,因?yàn)槿撕托∈笾g存在一定的DMD基因序列差異。
而mdx小鼠非常不適合用于ASO跳躍療法,特別是ASO藥物特異性跳躍23號(hào)之后的外顯子的情況下,因?yàn)閙dx小鼠在E23上已經(jīng)有終止子,而跳躍其后的外顯子無(wú)法帶來(lái)行為學(xué)方面的藥效反應(yīng),僅通過(guò)mRNA表達(dá)水平來(lái)評(píng)估藥效是匱乏的。
有的文獻(xiàn)還使用了hDMDΔ52/mdx模型檢測(cè)ASO跳躍療法的藥效[3],該模型是通過(guò)TG轉(zhuǎn)入人全長(zhǎng)DMD并敲除E52導(dǎo)致閱讀框破壞,然后與mdx小鼠進(jìn)行雜交而構(gòu)建的。hDMDΔ52/mdx模型雖然具有人DMD全長(zhǎng)蛋白,但其DMD基因插入位置未知,不是X染色體,且需要進(jìn)一步與mdx小鼠雜交,模型構(gòu)建比較復(fù)雜。
CRISPR基因編輯療法
該療法在DMD疾病上的進(jìn)展比較緩慢,其中一個(gè)原因是由于缺乏可以滿足特異性藥物靶點(diǎn)篩選及藥物預(yù)見(jiàn)性的DMD疾病模型。CRD-TMH-001是第一個(gè)基于CRISPR治療DMD的管線,目前已獲批IND。
在文獻(xiàn)中也出現(xiàn)不少CRISPR治療DMD的成功案例,如通過(guò)CBE胞嘧啶編輯器去除終止子,使得Dmd基因可以繼續(xù)翻譯,該實(shí)驗(yàn)使用了Δ50;h51KI模型[4]。該模型是將小鼠Dmd的E51進(jìn)行人源化,敲除E50并在E51上引入終止子。相對(duì)于mdx52,CRISPR編輯療法使用的模型Δ50;h51KI對(duì)藥物靶向序列的人源化要求程度更高,這也是CRISPR基因編輯療法所必須要考慮的重要因素,因?yàn)槊摪薪o患者帶來(lái)的負(fù)面影響是不可估量的。但同時(shí),與hDMDΔ52/mdx相比,Δ50;h51KI模型具有人源化區(qū)域不足的缺點(diǎn)。
強(qiáng)勢(shì)破局的人源化小鼠
鑒于DMD基因的突變特點(diǎn)及現(xiàn)有模型的缺點(diǎn),如構(gòu)建復(fù)雜、Tg導(dǎo)致基因插入位點(diǎn)不確定、人源化區(qū)域不足和突變非熱點(diǎn)突變等問(wèn)題,賽業(yè)生物自主研發(fā)了DMD疾病模型,除了經(jīng)典模型mdx小鼠,還有DMD(hE8-30)、DMD(hE44-45)、DMD(hE49-53)等DMD熱點(diǎn)突變區(qū)域人源化小鼠。另外,我們可以通過(guò)在野生型人源化小鼠的基礎(chǔ)上進(jìn)行基因再修飾,進(jìn)一步構(gòu)建熱點(diǎn)突變?nèi)嗽椿膊∧P,為研究提供更理想的?duì)照組和實(shí)驗(yàn)組。
賽業(yè)生物hDMD小鼠特點(diǎn):
● 擁有熱點(diǎn)突變區(qū)域的野生型及在此基礎(chǔ)上構(gòu)建的點(diǎn)突變?nèi)嗽椿膊∧P?/strong>;
● 可以直接在已有的野生型人源化基礎(chǔ)上定制不同的點(diǎn)突變,提高效率及成功率;
● 人源化區(qū)域包括大部分藥物靶向區(qū)域,更適合可用于藥物篩選及藥效研究,特別是ASO、CRISPR、siRNA等基因治療相關(guān)藥物;
●人DMD基因原位插入,拷貝數(shù)確定,可穩(wěn)定遺傳。
不僅是DMD,針對(duì)視網(wǎng)膜色素變性(RP)、黃斑變性(AMD)、帕金森病(PD)等多種疾病類(lèi)型,如果要深入研究其致病機(jī)理,長(zhǎng)片段甚至全基因組人源化小鼠是更好的選擇。但全基因組替換所需的技術(shù)難度高,大規(guī)模引入的外源序列可能會(huì)影響原本基因的表達(dá)調(diào)控。
為此,賽業(yè)生物啟動(dòng)了HUGO-GTTM計(jì)劃,基于自主研發(fā)的TurboKnockout-Pro技術(shù),對(duì)鼠源基因?qū)崿F(xiàn)原位替換,成功構(gòu)建了涵蓋更豐富干預(yù)靶點(diǎn)的全基因組人源化小鼠。HUGO-GTTM小鼠搭載了更高效的大片段載體融合技術(shù),可以作為萬(wàn)能模板進(jìn)行針對(duì)性的突變定制服務(wù),是更貼近真實(shí)世界生物機(jī)制的藥物臨床前研究模型。
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[1] Ryder-Cook AS, Sicinski P, Thomas K, et al. Localization of the mdx mutation within the mouse dystrophin gene. [J]. EMBO,1988.
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[3] Hoen P A C ' , Meijer E J D , Boer J M , et al. Generation and Characterization of Transgenic Mice with the Full-length Human DMD Gene[J]. Journal of Biological Chemistry, 2008, 283.
[4]Zhang Y, Li H, Nishiyama T, McAnally JR , et al. A humanized knockin mouse model of Duchenne muscular dystrophy and its correction by CRISPR-Cas9 therapeutic gene editing[J]. Mol Ther Nucleic Acids. 2022.