當(dāng)前位置 > 技術(shù)服務(wù) > 生物研發(fā)服務(wù)> 分子與細(xì)胞 > 微生物分子分型實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)分析技術(shù)服務(wù)
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BioNumerics或Ridom SeqSphere+生物信息數(shù)據(jù)管理與分析一體化平臺數(shù)據(jù)分析服務(wù)
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PFGE 以其重復(fù)性好，分辨力強(qiáng)而被譽(yù)為細(xì)菌分子分型技術(shù)的“金標(biāo)準(zhǔn)”。它可以用于大分子DNA的分離，其分辨范圍達(dá)到10 Mb。PFGE選用識別低頻率酶切位點(diǎn)的內(nèi)切酶切割基因組DNA，獲得的DNA大片段在外加脈沖電場的低濃度瓊脂糖凝膠中分離，產(chǎn)生數(shù)量有限的DNA條帶，在凝膠上按染色體片段長度的不同而呈現(xiàn)出電泳帶型，從而實(shí)現(xiàn)對菌株分型以檢測菌株的基因多態(tài)性。
MLST 是基于細(xì)菌核苷酸序列比對的一種分子分型方法，其原理是通過比較細(xì)菌個(gè)體7個(gè)或者更多管家基因的核苷酸序列的多態(tài)性，確定其基因多態(tài)性，同時(shí)通過劃分序列群和構(gòu)建最小生成樹來揭示細(xì)菌群體遺傳結(jié)構(gòu)。
MLVA 是基于細(xì)菌基因組中多個(gè)位點(diǎn)的數(shù)目可變化的串聯(lián)重復(fù)序列核心序列的拷貝數(shù)的差異來對不同細(xì)菌個(gè)體進(jìn)行分型的一種技術(shù)。MLVA具有快速高通量易于操作等優(yōu)點(diǎn)，不僅能確定基因多態(tài)性，而且能揭示細(xì)菌群體遺傳結(jié)構(gòu)特征。
使用PFGE、MLST、MLVA中的一種或者綜合使用多種分型方法，可以揭示細(xì)菌的基因多態(tài)性和群體遺傳結(jié)構(gòu)，結(jié)合細(xì)菌的三間分布信息以及其他生物學(xué)信息（如耐藥特征、特殊表型、毒力基因檢測）等可以進(jìn)行細(xì)菌的流行特征、傳播機(jī)制、變異特征分析，以及特殊意義克隆群的甄別等研究；另外還可以為后續(xù)的研究，如全基因組測序、致病機(jī)制研究等項(xiàng)目篩選具有基因組代表性的測試菌株。
另外，我司還提供其它分子分型服務(wù)，例如ERIC-PCR、RAPD等，以及宏基因組、耐藥基因譜、毒力基因譜檢測和數(shù)據(jù)分析等技術(shù)服務(wù)。
數(shù)據(jù)分析服務(wù)內(nèi)容：
MLST 是基于細(xì)菌核苷酸序列比對的一種分子分型方法，其原理是通過比較細(xì)菌個(gè)體7個(gè)或者更多管家基因的核苷酸序列的多態(tài)性，確定其基因多態(tài)性，同時(shí)通過劃分序列群和構(gòu)建最小生成樹來揭示細(xì)菌群體遺傳結(jié)構(gòu)。
MLVA 是基于細(xì)菌基因組中多個(gè)位點(diǎn)的數(shù)目可變化的串聯(lián)重復(fù)序列核心序列的拷貝數(shù)的差異來對不同細(xì)菌個(gè)體進(jìn)行分型的一種技術(shù)。MLVA具有快速高通量易于操作等優(yōu)點(diǎn)，不僅能確定基因多態(tài)性，而且能揭示細(xì)菌群體遺傳結(jié)構(gòu)特征。
使用PFGE、MLST、MLVA中的一種或者綜合使用多種分型方法，可以揭示細(xì)菌的基因多態(tài)性和群體遺傳結(jié)構(gòu)，結(jié)合細(xì)菌的三間分布信息以及其他生物學(xué)信息（如耐藥特征、特殊表型、毒力基因檢測）等可以進(jìn)行細(xì)菌的流行特征、傳播機(jī)制、變異特征分析，以及特殊意義克隆群的甄別等研究；另外還可以為后續(xù)的研究，如全基因組測序、致病機(jī)制研究等項(xiàng)目篩選具有基因組代表性的測試菌株。
另外，我司還提供其它分子分型服務(wù)，例如ERIC-PCR、RAPD等，以及宏基因組、耐藥基因譜、毒力基因譜檢測和數(shù)據(jù)分析等技術(shù)服務(wù)。
數(shù)據(jù)分析服務(wù)內(nèi)容：
- PFGE typing
- RiboPrinter typing
- MLST analysis、MLVA typing
- MALDI、AFLP、RFLP、RAPD
- REP-PCR、ARDRA、DGGE、TGGE
- Whole genome MLST
- Antibiotic resistance profiling
- Community fingerprinting
- Hetero-Duplex Analysis (HDA)
- HIV drugresistance prediction
- ISSR-PCR using QIAxcel
- ITS typing
- MIRU-VNTR typing
- MLPA analysis
- Molecular surveillance
- Sequence-based typing
- Sequence repeat typing
- spa-typing
- Taqman-based SNP genotyping
BioNumerics生物信息軟件（BN分析軟件）/Ridom SeqSphere+細(xì)菌全基因分型數(shù)據(jù)分析軟件的安裝、培訓(xùn)，歡迎致電
聯(lián)系方式：梁小姐13556932919
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