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動植物基因組重測序
根據(jù)高通量測序技術對生物體不同個體或群體的基因組進行測序,并與已知的參考基因組比對進行差異分析,獲得大量遺傳變異信息
服務類別:測序/合成總訪問:695
最后更新:2019-8-29半年訪問:2
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 動植物基因組重測序

  動植物全基因組重測序主要是根據(jù)高通量測序技術對生物體不同個體或群體的基因組進行測序,并與已知的參考基因組比對進行差異分析,獲得大量遺傳變異信息,應用于種群遺傳多態(tài)性分析、進化分析、功能基因挖掘、育種等研究領域。

 

產(chǎn)品優(yōu)勢

檢測區(qū)域大:全面獲得基因組的變異信息。                    ◇ 精準度高:二代測序保證了更準確的測序結果。

效率更高:基于二代測序技術平臺,更高速、高效。       ◇ 檢測范圍廣:可一次性獲得SNV、InDel、SV、CNV等變異信息。

  技術路線

動植物基因組重測序
技術參數(shù)

 

樣本要求

DNA≥3 μg(濃度≥25 ng/μL)

測序策略

Illumina PE150,數(shù)據(jù)量根據(jù)檢測項目決定

服務周期

14個自然日

 

文獻案例

 案例一 汗蜂社會性行為的遺傳基礎

 發(fā)表雜志:Nature Communications       IF:12.4      發(fā)表年份:2018

  法國的汗蜂有兩種生活模式,一種是生活在較冷地區(qū)的汗蜂,雌蜂沒有助手;另一種是生活在較暖地區(qū)的汗蜂,雌蜂有一個助手。為了研究這種行為模式的差異,作者首先從頭組裝了一只雌蜂的基因組,然后對150個個體進行全基因組重測序。通過關聯(lián)分析,發(fā)現(xiàn)8個區(qū)域的194個SNP存在基因組水平上的顯著差異。其中,最顯著差異的7個SNP富集在ASD相關的基因Syx1a上。該基因已經(jīng)被證明和突觸融合蛋白有關,并且在其他物種中已經(jīng)發(fā)現(xiàn)和社會性行為密切相關。從而證明該基因是汗蜂的社會性行為的重要遺傳因素。

 動植物基因組重測序

圖1 社會行為及其基因組位置相關的SNP

 動植物基因組重測序

圖2 syx1a 位點調(diào)控SNPs的功能效應

 參考文獻

Kocher S D, Mallarino R, Rubin B E R, et al. The genetic basis of a social polymorphism in halictid bees[J]. Nature communications, 2018, 9(1): 4338.

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