采用高通量虛擬篩選方法可從大型化合物庫(如約20萬個化合物的SPECS庫,超過1億個可購買化合物的ZINC庫)中迅速篩選出有潛在活性的藥物分子,陽性率一般在5%~20%。
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我們理解大多數(shù)研究者對虛擬篩選準(zhǔn)確率低、假陽性率高的詬病,這些問題通常來自于傻瓜式的操作和對研究體系缺乏充分了解。盡管針對藥物設(shè)計的軟件和策略層出不窮,但被運用來尋找到有效的苗頭化合物,進(jìn)而發(fā)展成先導(dǎo)化合物,是極其艱難的一件事情。在整個藥物發(fā)現(xiàn)的過程中,布滿了各種陷阱,不少是非常隱秘的。因此,不難理解,由于各種問題導(dǎo)致糟糕的結(jié)果是司空見慣的事情了。對一個全新的體系采用單一方法進(jìn)行虛擬篩選,其準(zhǔn)確率往往遠(yuǎn)低于文獻(xiàn)報道的研究結(jié)果。我們深諳每種方法都有其固有的缺陷,因此,在充分了解研究體系的情況下,我們通常采用多模型方案與平行和(或)串行的篩選策略,并根據(jù)先驗的成功概率和后驗的命中率仔細(xì)挑選策略和設(shè)計方案,借助統(tǒng)計學(xué)這一強(qiáng)有力的工具,提高我們對篩選策略的成敗把握。值得注意的是,我們的專家知識在提高命中率上給了很大幫助,這歸功于我們由多年積累的豐富經(jīng)驗轉(zhuǎn)化而來的敏銳直覺。
殷賦科技在藥物的虛擬篩選方面進(jìn)行過大量研究,有著豐富的實踐經(jīng)驗和核心技術(shù)。根據(jù)具體的研究項目,我們將為客戶提供有針對性的高性價比的篩選方案。同時,還可提供特定數(shù)據(jù)庫的處理等服務(wù)。歡迎垂詢!