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                                高通量測序服務(wù)- circRNAs(環(huán)形RNA分子)
                                circRNAs(circular RNAs,環(huán)形RNA分子)是一類不具有5''末端帽子和3''末端poly(A)尾巴、并以共價(jià)鍵形成環(huán)形結(jié)構(gòu)的非編碼RNA分子。
                                服務(wù)類別:測序/合成總訪問:1131
                                最后更新:2016-10-18半年訪問:3
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                                服務(wù)商: 南京世和基因生物技術(shù)有限公司 查看該公司所有服務(wù) >>
                                • 服務(wù)介紹
                                • 公司簡介

                                世和基因--高通量測序服務(wù)專家

                                             

                                   2016年,世和基因引進(jìn)HiSeq X “超級” 測序平臺,致力于成為全球領(lǐng)先的基因組學(xué)研究解決方案提供者,專注于動植物生命科學(xué),臨床轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué),人類健康,及藥物研發(fā)等領(lǐng)域的開發(fā)應(yīng)用。現(xiàn)在公司高通量測序平臺包括 10 臺 HiSeq X、HiSeq 4000、MiSeq、NextSeq 500等平臺,可滿足臨床診療業(yè)務(wù)及科研業(yè)務(wù)不同需求,是基因組學(xué)的首選合作伙伴。HiSeq X Ten是Illumina公司推出的最高通量,最高效率,最低成本的測序系統(tǒng),首次實(shí)現(xiàn)了將人類基因組重測序成本降低到了1000美金以下。HiSeq X Ten由10臺超高通量測序儀HiSeq X組成,系統(tǒng)單臺儀器每次運(yùn)行可產(chǎn)出高達(dá)1.8Tb的數(shù)據(jù),測序讀長為2×150b,運(yùn)行時(shí)間為三天以內(nèi)。10臺儀器同時(shí)運(yùn)行時(shí),每年可完成可超過18000個(gè)人類基因組重測序(30×覆蓋度)。因此,HiSeq X Ten系統(tǒng)將使研究人員更易于開展大規(guī)模人類基因組測序,并將有利于深入挖掘與癌癥及復(fù)雜疾病相關(guān)的遺傳變異。

                                   circRNAs(circular RNAs,環(huán)形RNA分子)是一類不具有5'末端帽子和3'末端poly(A)尾巴、并以共價(jià)鍵形成環(huán)形結(jié)構(gòu)的非編碼RNA分子。circRNA主要來源于內(nèi)含子或外顯子,在mRNA前體分子可變剪接加工過程中通過反向拼接或套索內(nèi)含子的方式產(chǎn)生,具有進(jìn)化上保守、結(jié)構(gòu)穩(wěn)定以及組織表達(dá)特異性等特征。circRNA在真核細(xì)胞中大量存在,相比于線性RNA分子,環(huán)狀circRNA對RNase不敏感,穩(wěn)定性更高,進(jìn)化上高度保守且有組織表達(dá)特異性。近年研究發(fā)現(xiàn),circRNA具有很多重要的調(diào)控功能,例如,circRNA可以作為競爭性內(nèi)源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)結(jié)合胞內(nèi)miRNA,阻斷miRNA對其靶基因的抑制作用。除此以外,circRNA也具有調(diào)控其他類型RNA、調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)活性等功能。目前circRNA的研究還處于前期階段,nature、cell等頂尖期刊發(fā)表的研究成果顯示circRNA在疾病診斷和治療方面具有巨大潛力,研究意義重大。

                                                         

                                服務(wù)相關(guān)-樣品要求:

                                樣品類型

                                總RNA樣品。

                                樣品量

                                20μg以上的總RNA。

                                樣品質(zhì)量

                                RNA無明顯降解,提取的總RNA,OD260/280值在1.8~2.2之間,濃度≥500 ng/μL,28S:18S ≥ 1.5,RIN ≥ 7。

                                樣品保存

                                RNA樣品可溶于乙醇或RNA-free的超純水中,-80℃保存。樣品保存期間避免反復(fù)凍融。

                                樣品運(yùn)輸

                                置于1.5 mL管中,封口膜封好,干冰運(yùn)輸。

                                 

                                生物信息學(xué)分析內(nèi)容:

                                1. 數(shù)據(jù)質(zhì)量評估及過濾
                                2. 基因組比對與統(tǒng)計(jì)
                                3. 環(huán)狀 RNA鑒定與預(yù)測
                                4. 環(huán)狀RNA 注釋
                                5. 環(huán)狀RNA分布統(tǒng)計(jì)(長度、在基因組染色體上的分布等)
                                6. 環(huán)狀RNA表達(dá)定量
                                7. 樣品間環(huán)狀RNA表達(dá)差異分析
                                8. 差異基因GO分析和Pathway富集分析
                                9. circRNA-miRNA-mRNA關(guān)聯(lián)分析

                                 

                                 

                                公司簡介:

                                世和基因是癌癥個(gè)體化醫(yī)療診斷及高通量測序行業(yè)的先行者與領(lǐng)航者,2008年末一批在生物醫(yī)藥領(lǐng)域有突出貢獻(xiàn)的北美華人科學(xué)家開始致力于高通量全景癌癥基因測序的研究。世和基因生物技術(shù)團(tuán)隊(duì)由多名多倫多大學(xué),哈佛大學(xué),斯坦福大學(xué),新加坡國立大學(xué),北京大學(xué)及NIH博士和專家組成,專注于高通量測序、癌癥生物學(xué)、生物信息學(xué)領(lǐng)域并擁有豐富的分子遺傳研究及臨床轉(zhuǎn)化經(jīng)驗(yàn)。 世和基因依托雄厚的技術(shù)實(shí)力與世界頂級綜合性醫(yī)院、大學(xué)、研究所攜手生命科學(xué)領(lǐng)域研究,共同推進(jìn)基礎(chǔ)研究向臨床成果轉(zhuǎn)化。同時(shí),世和基因科研團(tuán)隊(duì)在科研立項(xiàng)、投稿、溝通、修改上處于國際領(lǐng)先水平,至今已發(fā)表高影響因子文獻(xiàn)(20分以上)近10篇,并擁有數(shù)項(xiàng)核心專利。 

                                 

                                世和優(yōu)勢:

                                1. 嚴(yán)格的質(zhì)量把控

                                世和基因的測序流程在符合國際標(biāo)準(zhǔn)的臨床實(shí)驗(yàn)室開展,執(zhí)行最嚴(yán)格的質(zhì)量監(jiān)控,完善的實(shí)驗(yàn)流程管理,智能化LIMS報(bào)告系統(tǒng)。

                                2. 高穩(wěn)定的數(shù)據(jù)輸出

                                使用illumina原廠進(jìn)口測序試劑,配備了高通量測序所需的全套分子生物學(xué)設(shè)備。世和基因在堿基準(zhǔn)確度、測序均一性、可用數(shù)據(jù)比例等方面的質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)均全球遙遙領(lǐng)先。我們不僅承諾lane/flow cell/run 的總數(shù)據(jù)量,還承諾測序數(shù)據(jù)的Q30。

                                 3. 多樣化的測序平臺

                                世和基因擁有HiSeq X, HiSeq 4000, MiSeq, NextSeq 500等測序儀,多種測序平臺保證了項(xiàng)目的快速進(jìn)行及靈活性。

                                4. 強(qiáng)大的技術(shù)支持與生物信息分析團(tuán)隊(duì)

                                豐富的基因組項(xiàng)目及處理不同樣品的經(jīng)驗(yàn),技術(shù)支持由國際名校的博士團(tuán)隊(duì)承擔(dān),強(qiáng)大的生物信息團(tuán)隊(duì)可針對不同項(xiàng)目進(jìn)行深入分析與數(shù)據(jù)挖掘,保證提供最優(yōu)最新最全的解決方案。

                                5. 價(jià)格優(yōu)勢及短周期

                                世和基因致力于不斷降低顧客的測序成本,縮短測序周期。我們承諾提供優(yōu)于同行的測序價(jià)格和測序周期。

                                世和基因中國總部

                                南京世和基因生物技術(shù)有限公司

                                南京高新技術(shù)產(chǎn)業(yè)開發(fā)區(qū)新錦湖路3號-1

                                中丹生態(tài)生命科學(xué)產(chǎn)業(yè)園02棟18樓

                                郵編:210061

                                電話: 400-636-2325

                                信息咨詢: info@geneseeq.com

                                業(yè)務(wù)咨詢: tony.wang@geneseeq.com

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