翻譯組學(xué)主要研究mRNA,tRNA,microRNA,核糖體,新生肽鏈等物質(zhì)的種類與豐度,動態(tài)與動力學(xué)性質(zhì),以及它們所擔(dān)負(fù)的生物學(xué)功能。
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翻譯組學(xué)主要研究mRNA,tRNA,microRNA,核糖體,新生肽鏈等物質(zhì)的種類與豐度,動態(tài)與動力學(xué)性質(zhì),以及它們所擔(dān)負(fù)的生物學(xué)功能。編碼在DNA上的信息要經(jīng)過轉(zhuǎn)錄和翻譯,最終生成蛋白質(zhì),才能執(zhí)行生物學(xué)功能。翻譯控制在生物抗逆、病毒侵襲、腫瘤發(fā)生與發(fā)展等宏觀過程都有著緊密的聯(lián)系。此外,翻譯組學(xué)的研究對生化工程、合成生物學(xué)等應(yīng)用科學(xué)也具有直接的指導(dǎo)意義。翻譯組學(xué)被國際人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃(HPP)列為四大支柱之一。
研究方法
mRNA經(jīng)過轉(zhuǎn)錄加工為成熟的mRNA后,還需要翻譯為蛋白才能發(fā)揮其功能。翻譯過程中會形成核糖體-新生肽鏈復(fù)合物(RNC,Ribosome Nascent-chain Complex),復(fù)合物中的mRNA即為能翻譯成蛋白的mRNA。翻譯組測序用超速離心的方法分離出RNC并進(jìn)一步分離其中的mRNA進(jìn)行測序,可得到正在翻譯的mRNA信息。
生物信息分析內(nèi)容
1、數(shù)據(jù)質(zhì)控
2、基因表達(dá)水平分析
3、差異基因篩選
4、GO/KEGG富集分析
5、蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析
6、與轉(zhuǎn)錄組測序或蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)聯(lián)合分析
7、可視化結(jié)果展示
應(yīng)用方向
1、發(fā)現(xiàn)和鑒定新蛋白
2、蛋白質(zhì)差異表達(dá)分析
3、非編碼RNA(miRNA、LncRNA、cirRNA)作用機(jī)制研究
技術(shù)參數(shù)
樣本類型:組織或細(xì)胞。承啟生物可提供RNC分離及mRNA提取。客戶采集樣本,需采用公司提供RNC-mRNA測序?qū)S脴颖颈4嬉骸?/p>
測序策略:HiSeq PE150,推薦數(shù)據(jù)量:3G clean data
項(xiàng)目周期:35個(gè)工作日
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