多重PCR概述
多重PCR(multiplex PCR),又稱多重引物PCR或復合PCR,它是在同一PCR反應體系里加上二對以上引物,同時擴增出多個核酸片段的PCR反應,其基本原理與常規(guī)PCR相同,區(qū)別在于多重PCR反應體系加入一對以上引物,各對引物分別結合在模板相對應部位,最終擴增出一條以上目的DNA片段。
多重PCR的特點
•高效性:在同一PCR反應管內同時檢出多種基因,或對有多個型別的目的基因進行分型,特別是微量樣本的多基因檢測。
•系統(tǒng)性:多重PCR適宜于成組病原體的檢測,如肝炎病毒,腸道致病性細菌,性病,無芽胞厭氧菌,戰(zhàn)傷感染細菌及細菌戰(zhàn)劑的同時偵檢。
•經濟簡便性:多種病原體在同一反應管內同時檢出,將大大的節(jié)省時間,節(jié)省試劑,節(jié)約經費開支。
多重PCR應用
•基因診斷、腫瘤診斷、病原微生物的檢測。
•基因分型、連鎖分析。
•植物分子育種、基因表達檢測、病蟲害檢測。
•病原菌污染檢測。
•區(qū)域捕獲測序。
多重PCR之難
多重PCR并不是單純的將多對特異性引物混合成一個體系。多重PCR之所以難,在于多個靶點之間擴增條件不兼容,每個靶點都需要旁邊其他的引物配合。
就像是三人兩足游戲一樣,每個靶點成功擴增都是需要綁在一起的兩個人(一對引物)默契配合。而多重PCR就需要所有的選手同時起跑又同時到達,并且所有的選手都達到最優(yōu)發(fā)揮。
多重PCR優(yōu)化
為了達到更好的擴增效果,一般可以通過以下幾個方面進行優(yōu)化。
◆引物的優(yōu)化:
◆反應體系:
◆反應條件:
◆常見問題解決辦法:
多重PCR要求在同一反應體系內對多個位點進行特異性擴增。因而引物間的配對與競爭性擴增均會影響擴增效果。如果能選擇合適的反應體系、反應條件以及更合適的PCR儀,則有望提高多重PCR的擴增效果。所以在進行多重PCR的時候,不應墨守成規(guī),要根據自身實驗情況對實驗條件進行不斷優(yōu)化,達到最佳擴增效果。