盤古定量PCR在種質(zhì)資源基因組學(xué)研究的應(yīng)用
瀏覽次數(shù):1130 發(fā)布日期:2024-4-17
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了解種質(zhì)資源
種質(zhì)資源,也稱為遺傳資源或基因資源,指的是那些對(duì)人類具有實(shí)際或潛在利用價(jià)值的遺傳材料。如農(nóng)作物遺傳改良和品種改良的種子、種苗和組織等植物資源,品種優(yōu)良的動(dòng)物資源都屬于種質(zhì)資源的范圍。
種質(zhì)資源保護(hù)
我國(guó)幅員遼闊,種質(zhì)資源極其豐富,位居世界首列。作物、畜禽、水產(chǎn)、農(nóng)業(yè)微生物等農(nóng)業(yè)種質(zhì)資源是新品種選育的基礎(chǔ),遺傳信息由上一代傳給下一代的載體,種質(zhì)資源是人類生存不可或缺的重要資源之一。
因此,我國(guó)一直致力于采取多維度措施,保護(hù)和開(kāi)發(fā)種質(zhì)資源,實(shí)現(xiàn)農(nóng)業(yè)現(xiàn)代化。
2024年1月1日,農(nóng)業(yè)部一號(hào)文件 《關(guān)于學(xué)習(xí)運(yùn)用“千村示范、萬(wàn)村整治”工程經(jīng)驗(yàn)有力有效推進(jìn)鄉(xiāng)村全面振興工作的實(shí)施意見(jiàn)》
文件提出“種業(yè)振興行動(dòng)”,其內(nèi)容包含如下:
1.強(qiáng)化種質(zhì)資源保護(hù)利用,篩選挖掘大豆、玉米等優(yōu)異種質(zhì)和基因資源,推進(jìn)育種創(chuàng)新攻關(guān)。
2.生物育種產(chǎn)業(yè)化提速,加快選育推廣高油高產(chǎn)大豆、短生育期油菜、耐鹽堿作物等生產(chǎn)急需的自主優(yōu)良品種。
種質(zhì)資源學(xué)和基因組學(xué)
生物種質(zhì)資源的保護(hù)通常離不開(kāi)現(xiàn)代科技基礎(chǔ)設(shè)施,包括種子庫(kù)、植物離體庫(kù)、DNA庫(kù)、微生物庫(kù)和動(dòng)物種質(zhì)資源庫(kù),現(xiàn)代分子檢測(cè)方法可以為種質(zhì)資源建立先進(jìn)的植物基因組學(xué)和種子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)研究平臺(tái)。
定量PCR(Quantitative Polymerase Chain Reaction)在種質(zhì)資源研究中有著廣泛的應(yīng)用,定量PCR在這一領(lǐng)域的應(yīng)用主要包括以下幾個(gè)方面:
1、基因型鑒定:定量PCR可以用于快速、準(zhǔn)確地鑒定種質(zhì)資源中的基因型。通過(guò)PCR反應(yīng)檢測(cè)目標(biāo)基因的存在與否以及其表達(dá)水平,可以幫助研究人員確定種質(zhì)資源中所含有的有用基因型,為后續(xù)的遺傳改良工作提供重要信息。
2、基因表達(dá)分析:定量PCR可以定量檢測(cè)種質(zhì)資源中特定基因的表達(dá)水平。通過(guò)比較不同種質(zhì)資源或不同處理?xiàng)l件下目標(biāo)基因的表達(dá)情況,可以揭示基因在生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中的調(diào)控機(jī)制,為選擇優(yōu)良基因型提供依據(jù)。
3、遺傳改良:熒光實(shí)時(shí)定量PCR技術(shù)可以用于分子育種。通過(guò)分析動(dòng)植物的基因組序列和遺傳特征,可以預(yù)測(cè)它們的生長(zhǎng)、繁殖等性狀,幫助養(yǎng)殖者選擇優(yōu)良的個(gè)體進(jìn)行繁殖和培育
4、遺傳多樣性評(píng)估:定量PCR可以用于評(píng)估種質(zhì)資源的遺傳多樣性。通過(guò)分析種質(zhì)資源中多個(gè)基因座的遺傳變異情況,可以確定種質(zhì)資源的遺傳背景和多樣性水平,為種質(zhì)資源的保護(hù)和合理利用提供科學(xué)依據(jù)。
5、抗性鑒定:定量PCR可以用于檢測(cè)種質(zhì)資源中對(duì)病蟲(chóng)害等脅迫因子的抗性。通過(guò)PCR反應(yīng)檢測(cè)與抗性相關(guān)的基因或標(biāo)記物,可以篩選出具有抗性特點(diǎn)的種質(zhì)資源,為抗性育種提供候選材料。
艾普拜為科研用戶開(kāi)發(fā)了國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)級(jí)qPCR系統(tǒng)——盤古快速定量PCR系統(tǒng),遵循國(guó)際MIQE原則,性能出眾,非常適合種質(zhì)資源研究。
•升溫速度可達(dá)8.5℃/s,一次快速完成96孔檢測(cè)并出具結(jié)果,產(chǎn)物得率高,特異性好
•溫控精度±0.1℃滿足敏感樣品對(duì)擴(kuò)增溫度的嚴(yán)苛要求,保證陽(yáng)性靶標(biāo)的正常擴(kuò)增
•支持12列溫度梯度功能,便于快速優(yōu)化擴(kuò)增所需條件
•光波導(dǎo)頂部檢測(cè),無(wú)邊緣效應(yīng)和光程差,無(wú)需校準(zhǔn)
•6色檢測(cè)通道,支持各種常用熒光標(biāo)記,兼容各種商業(yè)化qPCR試劑盒
•具備基因表達(dá)和基因分型強(qiáng)大的軟件功能,適合SNP/KASP等等位基因分型
總的來(lái)說(shuō),定量PCR在種質(zhì)資源研究中的應(yīng)用可以幫助研究人員更全面、深入地了解種質(zhì)資源的遺傳特征、基因表達(dá)情況以及抗性等重要信息,為農(nóng)作物遺傳改良和種質(zhì)資源的合理利用提供技術(shù)支持。