小鼠基礎知識系列一:如何選擇對照小鼠
瀏覽次數(shù):2941 發(fā)布日期:2022-7-1
來源:杰克森實驗室
設置合適的對照對于實驗生物學的研究至關重要,而小鼠實驗的對照選擇往往更加復雜。在本文中,J博士將為大家介紹常見的小鼠對照選擇的要點:
一、近交系小鼠的對照設置
▲ 對于近交系小鼠疾病模型的基線對照,可以考慮使用無相關疾病的,同時遺傳背景最接近的品系或者是亞系作為對照。比如I型糖尿病模型NOD/ShiLtJ(001976), 如果需要無疾病對照,可以考慮NOR/LtJ(002050),這個品系和NOD品系MHC相同,基因組相似度有88%,且沒有胰腺炎和糖尿病癥狀。
▲ 有時也可考慮經(jīng)過實驗處理,或者是遺傳改造,消除了疾病表型的品系作為對照。還是以NOD/ShiLtJ(001976)I型糖尿病模型對照選擇為例,NOD.CB17-Prkdcscid/J(001303)由于Prkdc突變,沒有T細胞,同時也沒有胰腺炎表型和糖尿病表型,也可以用來作為在NOD上研究I型糖尿病的對照。
▲ 使用近交系小鼠開展實驗時,更常見的場景是實驗處理的對照,比如給藥組和不給藥組,感染組和不感染組等。這種情況,最好使用同窩或同品系小鼠開展實驗,以盡可能保證除了處理不同,他們的遺傳背景、生長環(huán)境等均一致。因此需要將這些小鼠打散并隨機分配到不同的實驗組,以避免偏差。
二、同源近交系突變小鼠的對照設置
▲ 最理想的對照是同性別同窩的野生型小鼠作為對照——這需要親本處于雜合狀態(tài)。
▲ 當無法使用同窩野生型作為對照的時候,比如純合品系。可以使用同背景的近交系小鼠作為對照。這種情況需要注意的是,該近交系小鼠和突變小鼠之間的差異有除突變基因外還潛在背景的遺傳漂變,尤其是當兩個群分開繁育的代數(shù)越多,風險就越大。而如果擔心此類風險影響研究結(jié)果,希望實驗結(jié)論更加嚴謹,可以將純合突變近交系與背景品系配繁得到雜合F1代,F(xiàn)1代繼續(xù)配繁,在F2代中就可以得到同窩野生型小鼠對照。
三、混合遺傳背景突變小鼠的對照設置
▲ 混合遺傳背景下突變小鼠是雜合狀態(tài),最好的對照也是同窩野生型小鼠。
▲ 如果是混合遺傳背景下的純合突變品系,可能就需要專門繁育一個種群來作為對照,即背景品系野生型的雜交F2代。
最常見的一個例子
早年很多靶向突變都是在一個129品系的ES細胞系上構(gòu)建。篩選出來的突變ES細胞被注射到C57BL/6J囊胚中,從而得到B6和129的嵌合體。這些嵌合體通常會拿來與B6J回交得到后代。如果發(fā)生靶向突變的細胞發(fā)育成生殖細胞,這些后代相當于是B6和129的雜交個體。它們之間進一步配繁,可以獲得目標突變。這個種群即是B6和129混合遺傳背景。這種情況下,最合適的對照是B6和129野生型雜交的F2代。雜交F1代擁有父本和母本各自50%的遺傳物質(zhì),因此個體之間是一致的;而雜交F2代中,親本的基因型開始分離,不同個體之間開始出現(xiàn)差異。
四、盡可能減少對照小鼠與實驗小鼠之間的差異
為了盡可能減少亞系之間的遺傳差異,最好是從同一個供應商那里購買對照和實驗小鼠。而為了盡可能減少環(huán)境、健康狀況等差異帶來的實驗偏差,最好是將實驗小鼠和對照小鼠飼養(yǎng)在盡可能一致的環(huán)境中;如果能很輕易區(qū)分,甚至可以考慮放在相同籠盒中飼養(yǎng)。同時,在實驗中,也盡可能保證不同組別的小鼠處理步驟一致。
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