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大組織成像技術(shù)新突破:信號改進型超快光片顯微鏡(SIFT)

瀏覽次數(shù):49 發(fā)布日期:2025-1-14  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負

在生物醫(yī)學(xué)研究領(lǐng)域,對大組織進行高分辨率、快速且精確的成像一直是科學(xué)家們追求的目標。傳統(tǒng)的成像技術(shù)在面對這一挑戰(zhàn)時,往往存在諸多局限性。共聚焦顯微鏡和雙光子顯微鏡雖然在細胞成像方面表現(xiàn)出色,但在處理大組織成像時,速度慢、光劑量高、穿透深度淺以及分辨率各向異性等問題逐漸凸顯。這些問題使得它們難以滿足對大組織進行全面、細致成像的需求。

近年來,光片顯微鏡(LSM)與組織透明化技術(shù)的結(jié)合為大組織成像帶來了新的希望。組織透明化技術(shù)通過改善組織內(nèi)部折射率(RI)的不匹配,減少了光的散射,使得光能夠更深入地穿透組織。這一技術(shù)突破使得更多實驗室能夠?qū)⒖焖偃S成像和組織學(xué)研究應(yīng)用于各種生物樣本,從小鼠、大鼠、兔子到果蠅,甚至人類組織。然而,即使在LSM技術(shù)不斷發(fā)展的今天,高分辨率成像大組織仍然面臨著諸多挑戰(zhàn)。

在這樣的背景下,一種名為信號改進型超快光片顯微鏡(SIFT)的新型成像技術(shù)應(yīng)運而生,展示了成像平臺在各種透明化組織樣本上的性能,并描述了其在各種透明化方案中的穩(wěn)健性,為大組織成像研究提供了新的解決方案。

研究內(nèi)容:SIFT技術(shù)的創(chuàng)新設(shè)計與原理
1、SIFT的光學(xué)設(shè)計
雙光片同步掃描:SIFT將傳統(tǒng)遠程聚焦設(shè)置分為兩個相同的遠程聚焦臂,通過精確透鏡對組合實現(xiàn)瞳孔匹配,保持光路長度相同,利用透鏡的線性運動范圍實現(xiàn)焦點的亞像素級運動,兩個焦點對稱放置且間距固定,由線性聚焦actuator(LFA)同步移動,通過檢測物鏡成像在相機上,實現(xiàn)了在整個視野(FOV)內(nèi)的均勻分辨率和高質(zhì)量同步。

提高成像速度和信號強度:SIFT在特定幀率下,通過雙光片掃描,每個光片覆蓋FOV的一半,使有效曝光時間翻倍,從而提高信號強度。對于熒光信號強的樣本,可在相同檢測光子預(yù)算和照明功率下,將幀率提高四倍,且在多種組織成像中表現(xiàn)出色,如小鼠前爪和胃的成像實驗中,成像速度顯著提升。

2、深度學(xué)習(xí)輔助組織邊界評估
為了進一步提高成像效率,SIFT引入了深度學(xué)習(xí)(DL)技術(shù)。研究人員精心設(shè)計了DL分類算法,這一算法就像一位智能的助手,能夠幫助SIFT智能地執(zhí)行中尺度結(jié)構(gòu)評估任務(wù)?梢詼蚀_地區(qū)分有信息和無信息的圖像塊,就像在一堆雜亂無章的拼圖碎片中,迅速挑選出有用的部分。通過生成組織邊界坐標圖,SIFT能夠精準地定位到組織中真正需要高分辨率成像的區(qū)域,避免了對無信息區(qū)域的不必要成像,從而大大減少了高分辨率成像的體積。

在實際應(yīng)用中,這一技術(shù)的優(yōu)勢體現(xiàn)得淋漓盡致。例如,在對復(fù)雜形狀的組織進行成像時,傳統(tǒng)方法可能需要對整個組織進行高分辨率掃描,耗費大量的時間和存儲空間。而SIFT結(jié)合DL算法,能夠快速篩選出包含組織信息的區(qū)域,只對這些關(guān)鍵區(qū)域進行高分辨率成像,大大提高了成像效率。值得一提的是,這個分類器具有很強的通用性,它與標本類型無關(guān),無論面對何種生物樣本,都能發(fā)揮出色的分類作用。這意味著研究人員在研究不同類型的組織時,無需針對新樣本類型進行繁瑣的訓(xùn)練,就像一把萬能鑰匙,能夠輕松打開各種組織成像的大門。

實驗結(jié)果:多維度驗證SIFT的卓越性能
1、顯微鏡性能量化
空間分辨率:為了準確評估SIFT的空間分辨率性能,研究人員采用了一種嚴謹?shù)膶嶒灧椒。他們?00nm的熒光珠嵌入2%的瓊脂糖中,制備成實驗樣本。隨后,將瓊脂糖樣本安裝在定制的支架上,并使用線性壓電平臺精確地軸向移動樣本。在成像過程中,SIFT展現(xiàn)出了令人矚目的性能,圖像的分辨率得到了進一步提升。意味著SIFT能夠清晰地分辨出組織內(nèi)部微小結(jié)構(gòu)的細節(jié),為精準的組織形態(tài)學(xué)研究提供了有力支持。與傳統(tǒng)的成像技術(shù)相比,SIFT在空間分辨率上的優(yōu)勢使其能夠更準確地揭示組織內(nèi)部的微觀結(jié)構(gòu)和細胞分布。

時間分辨率:時間分辨率是衡量顯微鏡成像速度的關(guān)鍵指標。SIFT在這方面表現(xiàn)出色,其定義為在最大視野(FOV)下獲取一幀圖像所需的時間。實驗結(jié)果表明,SIFT能夠在25ms內(nèi)獲取一幀覆蓋整個FOV的圖像,而傳統(tǒng)的則需要100ms。這一顯著的速度提升得益于SIFT獨特的光學(xué)設(shè)計,使得兩個焦點能夠同步移動,有效減少了成像過程中的延遲。通過對比可以清晰地看出,SIFT的幀獲取時間相比傳統(tǒng)ASLM提高了四倍。這一速度優(yōu)勢在實際應(yīng)用中具有重要意義,特別是在對動態(tài)過程進行成像時,SIFT能夠更及時、準確地捕捉到組織內(nèi)部的變化。

2、多組織成像驗證
小鼠前爪和胃成像:研究人員運用SIFT和傳統(tǒng)ASLM對小鼠前爪和胃進行了成像實驗,以對比兩種技術(shù)的性能。在對小鼠前爪的成像中,樣本經(jīng)過了組織透明化處理,標記了外周神經(jīng)、相關(guān)細胞以及組織的自發(fā)熒光信號(用于顯示大體結(jié)構(gòu),在綠色熒光發(fā)射通道成像)。SIFT在成像速度上展現(xiàn)出了巨大的優(yōu)勢,對于雙色清除小鼠前爪,SIFT的總幀獲取時間僅為4.93小時,而傳統(tǒng)ASLM則需要長達19.73小時。在對小鼠胃的成像實驗中,同樣使用了SIFT和傳統(tǒng)ASLM進行對比。SIFT在成像過程中,通過深度學(xué)習(xí)(DL)算法,從5054個低分辨率圖像塊中篩選出了2171個包含組織信息的圖像塊進行高分辨率成像。SIFT的總幀獲取時間為6.40小時,而傳統(tǒng)ASLM則需要25.63小時。

多透明成像:SIFT的多透明物鏡是其另一大亮點,使其能夠?qū)M織透明化處理并浸于不同折射率介質(zhì)中的樣本進行成像。在對斑馬魚幼蟲的成像實驗中,研究人員選擇了3天受精后的斑馬魚幼蟲,將其麻醉后嵌入1.5%瓊脂糖中,并安裝在氟乙烯丙烯(FEP)管中(其折射率與水匹配)。SIFT能夠清晰地觀察到斑馬魚幼蟲在尾損傷后的炎癥反應(yīng),以及穩(wěn)態(tài)條件下細胞在整個幼蟲體內(nèi)的發(fā)育變化。在對小鼠結(jié)腸的成像中,經(jīng)過整體組織透明技術(shù)處理,并進行免疫染色。SIFT的各向同性分辨率使得研究人員能夠清晰地觀察到結(jié)腸組織中神經(jīng)元的樹突和突起,以及神經(jīng)元之間的連接。在對小鼠腦的成像實驗中,分別使用了整體組織透明小鼠腦。SIFT能夠?qū)Υ竽X進行高分辨率成像,清晰地顯示出神經(jīng)元的活動和細胞結(jié)構(gòu),為神經(jīng)科學(xué)研究提供了有力的工具。

研究結(jié)論:SIFT推動大組織成像技術(shù)邁向新高度
這一創(chuàng)新技術(shù)通過獨特的雙焦點成像方案和深度學(xué)習(xí)分類網(wǎng)絡(luò),顯著提升了大組織成像的速度和效率。在多種樣本成像實驗中,SIFT均表現(xiàn)出卓越的性能,無論是小鼠前爪、胃,還是斑馬魚幼蟲、小鼠結(jié)腸和大腦等組織,SIFT都能以更快的速度獲取高質(zhì)量的圖像。其在空間分辨率和時間分辨率方面的優(yōu)勢,使得研究人員能夠更清晰地觀察組織內(nèi)部結(jié)構(gòu),更及時地捕捉動態(tài)變化。

SIFT對不同組織透明化方法適應(yīng)性強,在生物醫(yī)學(xué)成像領(lǐng)域應(yīng)用潛力大。雖目前成像速度受相機等限制,但為ASLM技術(shù)發(fā)展提供重要思路。未來,靠改進相機、采用更快LFA或優(yōu)化控制信號等,有望提升其性能,為生物醫(yī)學(xué)研究開拓更多可能,助力探索生命奧秘、攻克疾病難題。

聲明:本文僅用作學(xué)術(shù)目的。文章來源于:Prince, M.N.H., Garcia, B., Henn, C. et al. Signal improved ultra-fast light-sheet microscope for large tissue imaging. Commun Eng 3, 59 (2024). https://doi.org/10.1038/s44172-024-00205-4.

來源:羅輯技術(shù)(武漢)有限公司
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