引言
表面等離子體共振儀器可以提供例如動(dòng)力學(xué)、親和力和濃度等豐富的信息。P4SPR分子互作儀具有兩種不同類型的設(shè)置,可以進(jìn)行靜態(tài)和動(dòng)力學(xué) SPR 分析。在靜態(tài)系統(tǒng)中,樣品溶液通過注射器手動(dòng)引入流動(dòng)池并通過擴(kuò)散與表面發(fā)生相互作用。在動(dòng)力學(xué)系統(tǒng)中,(通過手動(dòng)注射器或自動(dòng)進(jìn)樣器)將樣品溶液先裝入樣品環(huán),然后通過注射泵將運(yùn)行緩沖液流過樣品環(huán),將樣品引入流動(dòng)池中。
本文描述了固定化多克隆鼠抗人 IgG (MAH IgG) 與全人 IgG (Hm IgG) 在靜態(tài)和動(dòng)態(tài) Affinite Instruments SPR 設(shè)備之間的生物分子相互作用。
讓我們首先定義基本的親和力和動(dòng)力學(xué)參數(shù)。使用基本的 Langmuir 結(jié)合模型假設(shè)固定配體 (L) 與分析物 (A) 相互作用的比例為 1:1。
A+L⇌AL (1)
速率常數(shù) (kon 和 koff) 分別表示正向 (結(jié)合) 和反向 (解離) 反應(yīng)。解離平衡常數(shù) KD 表示一半表面固定配體與分析物結(jié)合的時(shí)間,可以用游離分析物 [A]、配體 [L] 和分析物-配體復(fù)合物 [AL] 的濃度來表示 (等式 2);蛘撸琄D 可以使用速率常數(shù) kon 和 koff(或者 ka 和 kd)來定義 (等式 2):
KD 通常是作為求解參數(shù)的首選,因?yàn)樗阅枬舛?(M) 表示,而締合平衡常數(shù) KA 以 M-1 表示。
P4SPR分子互作儀靜態(tài)與動(dòng)態(tài)SPR分析
動(dòng)力學(xué)分析和靜態(tài)分析均以不同的方式提供有價(jià)值的信息。
動(dòng)力學(xué)分析使我們能夠了解分子相互作用的動(dòng)態(tài),因?yàn)樗梢远聪そY(jié)合的速度和強(qiáng)度。它有助于研究生物過程的機(jī)制并開發(fā)靶向療法。通過實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)相互作用,我們可以評(píng)估結(jié)合率和解離率并得出親和常數(shù)。
另一方面,靜態(tài)分析非常適合分析物的篩選和定量。它提供了特定時(shí)間點(diǎn)的結(jié)合快照,允許快速分析大量樣本集。由于簡(jiǎn)化的樣品引入過程、更快的基線建立和高效的系統(tǒng)沖洗,靜態(tài) SPR 中的檢測(cè)時(shí)間最多可以是動(dòng)態(tài) SPR 的一半。這使得靜態(tài) SPR 成為特異性篩選、分析物定量和基本親和力表征的省時(shí)選擇。
通過利用動(dòng)力學(xué)和靜態(tài)分析,我們可以全面了解分子相互作用。動(dòng)力學(xué)分析有助于我們揭示結(jié)合的動(dòng)態(tài)方面,而靜態(tài)分析則可以進(jìn)行有效的篩選和量化。它們共同提供了結(jié)合過程的整體視圖,從初始關(guān)聯(lián)到穩(wěn)態(tài)結(jié)合水平。
表 1 靜態(tài)和動(dòng)態(tài)SPR 實(shí)驗(yàn)?zāi)J街g的特征比較
SPR應(yīng)用 |
靜態(tài)分析 |
動(dòng)力學(xué)分析 |
實(shí)時(shí)結(jié)合數(shù)據(jù) |
√ |
√ |
特異性篩選/排序 |
√ |
√ |
濃度分析 |
√ |
√ |
親和力表征(KD) |
√ |
√ |
動(dòng)力學(xué)表征(kon/koff) |
_
|
√ |
同時(shí)分析四個(gè)樣品 |
√ |
_
|
單周期和多周期分析 |
√ |
√ |
圖 2 P4PRO圖
試驗(yàn)設(shè)計(jì)
結(jié)果
在靜態(tài) SPR 中,只能觀察到結(jié)合階段。圖 4 中顯示了典型的圖形疊加。隨著分析物與固定在表面上的配體結(jié)合,信號(hào)逐漸增加。一旦大多數(shù)可用的配體位點(diǎn)被占據(jù),信號(hào)就會(huì)達(dá)到稱為穩(wěn)定狀態(tài)的平臺(tái),此時(shí)配體和分析物結(jié)合和解離之間達(dá)到平衡。曲線的形狀和動(dòng)力學(xué)還可以提供有關(guān)結(jié)合親和力、結(jié)合速率和分析物-配體相互作用的化學(xué)計(jì)量的定性信息。圖 5 中繪制了 SPR 偏移值與濃度的關(guān)系,并通過 Affinité 的 ezControl 軟件獲得了曲線擬合。
圖 4 編制不同濃度 (0、0.89、2.7、8.0、24、72nM) 的 Hm IgG 與參考通道調(diào)整后的固定化 MAH IgG 結(jié)合的靜態(tài) SPR 傳感圖
圖 5 通過繪制 RU 中的 SPR 偏移與納摩爾濃度的關(guān)系圖,可以對(duì) ezControl 軟件中的 KD 進(jìn)行靜態(tài)評(píng)估
通過此曲線擬合,在 63RU 處評(píng)估 Rmax,在 ½ Rmax (KD) 處評(píng)估濃度為 4.9nM。
在動(dòng)力學(xué) SPR 中,結(jié)合和解離階段都是可觀察到的。圖 6 顯示了 Hm IgG 動(dòng)力學(xué)注射的圖形疊加。在結(jié)合階段,分析物被注入并允許其與固定在表面上的配體結(jié)合。隨著結(jié)合的發(fā)生,SPR 傳感圖上的信號(hào)逐漸增加。信號(hào)增加的速率反映了結(jié)合速率常數(shù) (ka),這表明結(jié)合發(fā)生的速度。結(jié)合階段使我們能夠?qū)崟r(shí)監(jiān)測(cè)分析物-配體復(fù)合物的形成。
結(jié)合階段之后,解離階段開始。在此階段,分析物被運(yùn)行緩沖液取代,傳感圖上的信號(hào)開始減弱。信號(hào)減弱的速率反映了解離速率常數(shù) (kd),這表明分析物-配體復(fù)合物解離的速度。解離階段使我們能夠觀察結(jié)合的穩(wěn)定性并測(cè)量解離速率。
SPR 中的曲線形狀取決于結(jié)合動(dòng)力學(xué)和分析物與配體之間的親和力。在典型的結(jié)合場(chǎng)景中,在結(jié)合階段,傳感圖上的信號(hào)迅速增加,直到達(dá)到穩(wěn)定狀態(tài),這表明大多數(shù)可用的配體位點(diǎn)已被占用。信號(hào)達(dá)到穩(wěn)定狀態(tài)的速率取決于結(jié)合速率常數(shù) (ka) 和分析物的濃度。
圖 6 編制不同濃度 (0、0.89、2.7、8.0、24、72nM) 的 Hm IgG 與用參考通道和空白調(diào)整的固定化 MAH IgG 結(jié)合的動(dòng)力學(xué) SPR 傳感圖
圖 7 顯示了動(dòng)力學(xué)數(shù)據(jù)的描跡擬合:它表示兩個(gè)連接段,分別代表結(jié)合速率和解離速率。結(jié)合速率斜率相對(duì)較陡表明結(jié)合速度較快,而解離速率斜率較平緩表明解離速率較慢,表明抗體結(jié)合強(qiáng)。相反,斜率越陡,解離速率越快,抗體結(jié)合越弱。
圖 7 通過 TraceDrawer 評(píng)估動(dòng)力學(xué)參數(shù)
表 2 提供了靜態(tài) SPR 和動(dòng)態(tài) SPR 之間各種參數(shù)的比較。在動(dòng)態(tài) SPR 中,分析物-配體相互作用的結(jié)合速率 (kon) 為 3.42 x 10^5 M-1*s-1,解離速率 (koff) 為 3.10 x 10^-4 s-1,親和力 (KD) 值為 1 nM,最大結(jié)合響應(yīng) (Rmax) 為 83。在靜態(tài) SPR 中,kon 和 koff 速率不可觀察,Rmax 在 63RU 處評(píng)估,KD 評(píng)估為 5nM。靜態(tài)系統(tǒng)中分析物的停留時(shí)間越長(zhǎng),Rmax 投影就越高,因此與動(dòng)態(tài)分析相比,KD 值越低,相關(guān)性越高。
表 2 通過 TraceDrawer 評(píng)估動(dòng)力學(xué)參數(shù)(NA:不適用)
參數(shù) |
靜態(tài)SPR |
動(dòng)態(tài)SPR |
KD(nM) |
5 |
1 |
kon(M-1*s-1) |
NA |
3.42×105 |
Koff(s-1) |
NA |
3.10×10-4 |
Rmax(RU) |
63 |
83 |
概括
從動(dòng)態(tài) SPR 獲得的這些參數(shù)為生物分子相互作用提供了寶貴的見解。另一方面,靜態(tài) SPR 提供了一種更簡(jiǎn)單、更具成本效益的方法來篩選和量化分析物。
雖然靜態(tài) SPR 與動(dòng)態(tài) SPR 相比提供的參數(shù)較少,但它仍然可以在更短的時(shí)間內(nèi)產(chǎn)生類似的結(jié)果。靜態(tài) SPR 中簡(jiǎn)化的樣品引入過程、更快的基線建立和高效的系統(tǒng)沖洗有助于提高其時(shí)間效率。此外,靜態(tài) SPR 儀器的簡(jiǎn)化系統(tǒng)設(shè)計(jì)和較低成本使它們對(duì)許多研究人員來說更容易獲得和負(fù)擔(dān)得起.
總之,動(dòng)態(tài) SPR 提供了一套全面的參數(shù)來表征生物分子相互作用,包括親和力、結(jié)合速率、解離速率和最大結(jié)合響應(yīng)。另一方面,靜態(tài) SPR 可以提供其中一些參數(shù),例如親和力,并在更快、更簡(jiǎn)單、更實(shí)惠的系統(tǒng)中提供類似的結(jié)果。動(dòng)態(tài)和靜態(tài) SPR 之間的選擇取決于特定的實(shí)驗(yàn)要求和從分析中尋求的信息。
關(guān)于 Affinity 儀器
加拿大Affinité Instruments是一家專注于分子互作研究的公司,基于無標(biāo)記、高靈敏、表面等離子共振技術(shù)(SRP技術(shù))開發(fā)了性價(jià)比極高的個(gè)人型分子互作儀,旨在讓每位科研工作者和實(shí)驗(yàn)室都能夠順利的把分子互作相關(guān)實(shí)驗(yàn)開展起來,助力生物科學(xué)發(fā)展。
P4PRO是Affinité Instruments最暢銷的一款分子互作儀,其特點(diǎn)是:
①基于SPR原理,實(shí)時(shí)、無標(biāo)記、檢測(cè)相互作用;
②搭配先進(jìn)的微流控技術(shù),實(shí)現(xiàn)高性能和高準(zhǔn)確性;
③10分鐘內(nèi)完成1個(gè)樣本測(cè)試;
④一組實(shí)驗(yàn)可獲得結(jié)合特異性、親和力、動(dòng)力學(xué)等數(shù)據(jù);
⑤四通道檢測(cè),結(jié)合參照通道信號(hào),可進(jìn)行背景扣除,獲得可信數(shù)據(jù);
⑥儀器穩(wěn)定,操作簡(jiǎn)單,維護(hù)簡(jiǎn)便;
⑦采用注射泵組件,控制精準(zhǔn),信號(hào)穩(wěn)定;
⑧儀器性價(jià)比高,單個(gè)實(shí)驗(yàn)室即可負(fù)擔(dān);
⑨AfficoatTM芯片可減少SPR試驗(yàn)中的非特異性結(jié)合;
⑩芯片耗材成本低,大大降低儀器運(yùn)行成本。