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如何確保Cre-lox小鼠能夠刪除正確的基因

瀏覽次數(shù):1535 發(fā)布日期:2022-3-9  來(lái)源:杰克森實(shí)驗(yàn)室
許多表達(dá)Cre的品系在構(gòu)建小鼠模型時(shí)均有著不明顯或未表征的表型。
 
而其中的一些表型(包括意外表達(dá)模式和不可預(yù)測(cè)的刪除效率)可能會(huì)讓實(shí)驗(yàn)人員很難對(duì)實(shí)驗(yàn)作出解釋,由此導(dǎo)致Cre-lox神話破滅。
 
那么,要如何解決這些問(wèn)題呢?
 
 
 
脫靶Cre表達(dá)

當(dāng)Cre不在驅(qū)動(dòng)Cre表達(dá)的啟動(dòng)子直接支配下表達(dá)在其他組織或器官中時(shí),就會(huì)發(fā)生脫靶Cre表達(dá)。 
 
如果Cre品系發(fā)生這種情況,而實(shí)驗(yàn)人員又無(wú)法發(fā)現(xiàn),那么floxed小鼠基因可能會(huì)在意想不到的組織中被刪除。 
 
因此:需要充分了解cre品系的表達(dá)模式
 
首先,查閱已發(fā)表的文獻(xiàn),了解業(yè)界就Cre表達(dá)已檢查了哪些組織和器官。當(dāng)研究人員創(chuàng)建新的Cre品系時(shí),勢(shì)必會(huì)在啟動(dòng)子驅(qū)動(dòng)Cre表達(dá)所在的組織中尋找Cre表達(dá),但他們通常不會(huì)驗(yàn)證其他非靶組織中是否不存在Cre表達(dá)。 
 
如果您的品系沒(méi)有已知的Cre表達(dá)信息,則應(yīng)在表達(dá)可見(jiàn)標(biāo)志物(例如:β-半乳糖苷酶、堿性磷酸酶、熒光素酶、GFP或其他熒光蛋白)的眾多Cre報(bào)告基因品系中選擇一個(gè)品系,并將您的cre品系與之進(jìn)行雜交。  
 
只需一次雜交就能產(chǎn)生攜帶Cre轉(zhuǎn)基因和Cre報(bào)告基因的小鼠,這樣,您就可以檢查您所希望的細(xì)胞中是否表達(dá)Cre。
 
 
生殖系中的脫靶Cre表達(dá)
 
生殖系中的脫靶Cre表達(dá)可能會(huì)特別棘手,因?yàn)槟氖笕褐锌赡軙?huì)出現(xiàn)所有細(xì)胞中都有完全重組的敲除等位基因的小鼠。
 
通常,生殖系表達(dá)Cre是因?yàn)闇p數(shù)分裂后卵母細(xì)胞中持續(xù)存在Cre RNA或蛋白質(zhì)。
 
對(duì)于許多Cre品系(不是全部)
 
使用Cre陽(yáng)性雄性小鼠進(jìn)行育種可以避免刪除生殖系中l(wèi)oxP等位基因。  
 
可以設(shè)計(jì)在floxed小鼠外顯子上游和下游區(qū)域退火的引物,通過(guò)PCR輕松監(jiān)測(cè)鼠群的生殖系Cre表達(dá)。  
 
這樣,如果產(chǎn)生了完整重組敲除等位基因,則可擴(kuò)增較小產(chǎn)物(圖1)。  對(duì)所有繁育小鼠進(jìn)行基因分型,從鼠群中剔除已刪除等位基因的所有小鼠。
 

(圖1:位于兩個(gè)loxP位點(diǎn)兩側(cè)的引物(綠色)將會(huì)在刪除等位基因后擴(kuò)增獲得較小產(chǎn)物)
 
 
LoxP位點(diǎn)重組效率低下

Cre重組loxP位點(diǎn)的效率受loxP位點(diǎn)在基因組內(nèi)的位置以及它們之間距離的影響。因此,相同Cre轉(zhuǎn)基因切割不同loxP等位基因的效率可能不同。
 
如果您發(fā)現(xiàn)loxP基因沒(méi)有被有效切割(也就是您的floxed 鼠靶標(biāo)的基因表達(dá)水平?jīng)]有被充分降低),這可能會(huì)非常令人沮喪,那該怎么做呢?
 
1  步驟一
如果您發(fā)現(xiàn)自己遇到了這種情況,應(yīng)重新對(duì)小鼠進(jìn)行基因分型(使用新DNA樣本),確認(rèn)您的小鼠是loxP等位基因純合子并攜帶Cre轉(zhuǎn)基因。 
 
2  步驟二
接下來(lái),檢查您測(cè)試刪除效率/基因表達(dá)所用的方法,確保其適用于您的特異性loxP等位基因。
 
比如,如果條件性等位基因使loxP位點(diǎn)位于目標(biāo)基因外顯子5的位置,則在重組后,外顯子5會(huì)被刪除,但外顯子1-4和啟動(dòng)子會(huì)保持完整,并且仍可產(chǎn)生重組基因座的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物。
 
如果監(jiān)測(cè)mRNA表達(dá)的引物落在外顯子5的上游區(qū)域,您可能看不到表達(dá)水平顯著下降。 
 
3  步驟三
如果您確認(rèn)Cre未有效切割您的loxP基因,應(yīng)嘗試將目標(biāo)基因的完整敲除等位基因引入鼠群,獲得攜帶目標(biāo)基因復(fù)合雜合子(一個(gè)loxP側(cè)翼等位基因和一個(gè)敲除等位基因)及Cre轉(zhuǎn)基因的小鼠。
 
在這些小鼠中,Cre只需重組一個(gè)loxP等位基因即可,而不是兩個(gè),這樣可以提高其重組效率。
 
 
他莫昔芬誘導(dǎo)的Cre品系

如果您的Cre品系是他莫昔芬誘導(dǎo)的Cre品系,則按照上述步驟1和2操作。
 
接下來(lái),將他莫昔芬誘導(dǎo)的Cre品系與Cre報(bào)告基因品系進(jìn)行雜交。  在Cre陽(yáng)性、報(bào)告基因陽(yáng)性小鼠中測(cè)試您的他莫昔芬給藥方案,確認(rèn)他莫昔芬能否到達(dá)目標(biāo)組織/器官并有效誘導(dǎo)重組。
 
事實(shí)上,最好在實(shí)驗(yàn)開(kāi)始時(shí)就這樣做,以便提前制定他莫昔芬誘導(dǎo)方案。
 
訪問(wèn)以下鏈接,了解幾種不同的他莫昔芬給藥途徑,包括每種途徑的優(yōu)缺點(diǎn):
http://openwetware.org/wiki/Tamoxifen_administration_to_mice 
 
如果清楚了解所有這些步驟,則如上所述(步驟3)引入完整敲除等位基因或許可以提高他莫昔芬依賴性重組效率。
 
 
自發(fā)性Cre表型

Cre可能會(huì)自行產(chǎn)生表型,這會(huì)使數(shù)據(jù)解釋變得更加困難。
 
造成這種情況的原因可能是Cre轉(zhuǎn)基因插入位點(diǎn)對(duì)附近內(nèi)源基因有影響。
 
另外,由于小鼠基因組中的隱性半同源loxP位點(diǎn)之間重組會(huì)造成“Cre 毒性”,因此,Cre高表達(dá)的小鼠可能會(huì)出現(xiàn)突變表型或死亡。  
 
為了確保您觀察到的所有表型是由于目標(biāo)基因被刪除而不是Cre轉(zhuǎn)基因引起的,您需要在實(shí)驗(yàn)中納入攜帶相應(yīng)loxP等位基因的野生型Cre陽(yáng)性小鼠作為對(duì)照小鼠。
 
在創(chuàng)建下一個(gè)條件性敲除模型之前,您應(yīng)該熟悉要使用的品系中Cre的表達(dá)模式。

杰克森實(shí)驗(yàn)室Cre資源
 
杰克森實(shí)驗(yàn)室Cre資源對(duì)JAX®小鼠資源庫(kù)中眾多Cre表達(dá)品系的Cre表達(dá)模式進(jìn)行了表征,詳細(xì)信息請(qǐng)?jiān)L問(wèn)以下鏈接: 
Https://www.jax.org/research-and-faculty/resources/cre-repository/characterized-cre-lines-jax-cre-resource
 
來(lái)源:杰克森醫(yī)療科技(上海)有限公司
聯(lián)系電話:400-693-5700
E-mail:marketing@jax.org.cn

標(biāo)簽: 小鼠 基因敲除 修飾
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