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細(xì)胞實(shí)驗(yàn)中的對(duì)照給藥介紹

瀏覽次數(shù):2133 發(fā)布日期:2021-10-8  來(lái)源:MedChemExpress

 
細(xì)胞對(duì)照給藥
 
對(duì)照實(shí)驗(yàn) (Control experiments) 是在實(shí)驗(yàn)中設(shè)置比較對(duì)象 (對(duì)照組) 的一種科學(xué)方法,進(jìn)行對(duì)照實(shí)驗(yàn)可評(píng)估實(shí)驗(yàn)條件改變對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果產(chǎn)生的影響。設(shè)置對(duì)照實(shí)驗(yàn)可以增強(qiáng)實(shí)驗(yàn)的可信度。細(xì)胞實(shí)驗(yàn)中的對(duì)照實(shí)驗(yàn)一般可分為空白對(duì)照,陽(yáng)性對(duì)照和陰性對(duì)照。

 

空白對(duì)照

空白對(duì)照 (Blank control) 是指不給予任何處理的對(duì)照。在細(xì)胞實(shí)驗(yàn)中,常用以評(píng)價(jià)及觀察細(xì)胞是否處于正常狀態(tài)。


如在 The role of ferroptosis in ionizing radiation-induced cell death and tumor suppression 一文中,觀察到 H460、A549 和 H1299 細(xì)胞系在沒(méi)有任何處理的情況下,脂質(zhì)過(guò)氧化水平?jīng)]有任何變化,而暴露于 6 Gy IR 24 小時(shí)后,脂質(zhì)過(guò)氧化相對(duì)水平升高。

 

圖 1. 電離輻射誘導(dǎo)癌細(xì)胞中的鐵死亡[1]

 

陽(yáng)性對(duì)照

陽(yáng)性對(duì)照 (Positive control) 是指按照當(dāng)前實(shí)驗(yàn)方案一定能得到陽(yáng)性結(jié)果的對(duì)照實(shí)驗(yàn)。因此,陽(yáng)性對(duì)照具有質(zhì)控的意義。另一方面,陽(yáng)性對(duì)照還可以證明試驗(yàn)藥和對(duì)照藥之間的差別:優(yōu)效性或等效性。

 

例如,為了研究 H. richardsonii 提取物 PP-360A 對(duì)癌細(xì)胞的有絲分裂的影響,研究者選用諾考達(dá)唑,紫杉醇作為陽(yáng)性對(duì)照,這兩種藥物可以誘導(dǎo)有絲分裂停滯。陽(yáng)性對(duì)照組表明:PP-360A 可以有效地誘導(dǎo)由有絲分裂停滯引起的細(xì)胞形態(tài)改變。如圖 2A 所示,三種細(xì)胞系 (HT-29、M059K、WI-38) 用 PP-360A 處理后的細(xì)胞形態(tài)變圓,與諾考達(dá)唑處理組類似。免疫熒光染色結(jié)果 (圖 2B) 顯示細(xì)胞用 PP-360A 處理后,磷酸組蛋白 H3 (PH3) 和微管蛋白陽(yáng)性細(xì)胞比率升高。

 

圖 2. A: 用諾考達(dá)唑 (Noco) 或不同濃度 PP-360A 處理的人類癌細(xì)胞形態(tài);B: 用諾考達(dá)唑等以及 PP-360A 處理 HT-29 細(xì)胞的免疫熒光染色[2]

 

陰性對(duì)照
陰性對(duì)照 (Negative control),和陽(yáng)性對(duì)照相反,是指按照當(dāng)前的實(shí)驗(yàn)方案一定不會(huì)得到陽(yáng)性結(jié)果的對(duì)照實(shí)驗(yàn)。
 

溶劑對(duì)照 (Vehicle control) 是最常見(jiàn)的陰性對(duì)照,一些化合物水溶性不好的化合物,需要用有機(jī)溶劑 DMSO、乙醇等配制儲(chǔ)備液。如果溶劑在最終給藥體系中占比較高,可能會(huì)對(duì)細(xì)胞本身狀態(tài)有較大影響,這時(shí),就會(huì)出現(xiàn)這樣一個(gè)疑問(wèn):是藥物的作用還是溶劑的毒性導(dǎo)致呢?

在鑒定具有抗黑色素瘤活性的檸檬苦素類天然產(chǎn)物的研究中,DMSO 溶劑對(duì)照組的設(shè)置很好地證明了 Haperforin G 在 MELHO 中誘導(dǎo) G1 細(xì)胞周期阻滯和增殖停滯。
 

圖 3. Haperforin G 對(duì)黑色素瘤細(xì)胞增殖和細(xì)胞周期的影響[4]

 
除此之外,在 siRNA 轉(zhuǎn)染,腺病毒轉(zhuǎn)染等實(shí)驗(yàn)過(guò)程中,常會(huì)出現(xiàn) NC siRNA,NC shRNA 等陰性對(duì)照。如在 CYP27A1-dependent anti-melanoma activity of limonoid natural products targets mitochondrial metabolism 一文中,Harpernoid D 的抗黑色素瘤活性依賴于 CYP27A1 (圖 4A)。為了研究 CYP27A1 表達(dá)與化合物敏感性的相關(guān)性,利用 siRNA 瞬時(shí)下調(diào) CYP27A1 的表達(dá),并且證明 CYP27A1 的瞬時(shí)下調(diào)可使細(xì)胞免受 Harpernoid D 介導(dǎo)的細(xì)胞增殖抑制 (圖 4B)。
 

圖 4. 細(xì)胞用 NC siRNA 或 CYP27A1 siRNA 轉(zhuǎn)染處理 24 小時(shí)[4]

 

在一些涉及免疫學(xué)的實(shí)驗(yàn)時(shí),往往需要用到同型抗體設(shè)置同型對(duì)照 (Isotype control),同型抗體是指和實(shí)驗(yàn)組具有同源性和相同抗體類別的非特異抗體,如圖 5 所示,同型對(duì)照可以很好的證實(shí)實(shí)驗(yàn)組抗體的特異性。 
 

圖 5. MITF 與黑素瘤細(xì)胞系中內(nèi)源性 CYP27A1 啟動(dòng)子區(qū)域的結(jié)合[5]

 

小對(duì)照,大學(xué)問(wèn)。一個(gè)科學(xué)系統(tǒng)的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)中必然少不了對(duì)照的身影。對(duì)照不僅能幫我們佐證實(shí)驗(yàn)結(jié)果的可靠性,也能在實(shí)驗(yàn)失敗時(shí)幫助我們排查導(dǎo)致失敗的原因。怎么樣,現(xiàn)在你學(xué)廢了嗎?

 

相關(guān)產(chǎn)品

Nocodazole

一種快速可逆的 microtubule 抑制劑,抑制有絲分裂并誘導(dǎo)腫瘤細(xì)胞凋亡。

Paclitaxel

抗腫瘤劑,可導(dǎo)致有絲分裂停滯和誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡。

BODIPY 581/591 C11

脂質(zhì)氧化的熒光比值探針,常用于鐵死亡研究。

抗腫瘤化合物庫(kù)

共收錄了 4, 800+ 抗腫瘤化合物,主要靶向激酶、細(xì)胞周期調(diào)控的關(guān)鍵蛋白,腫瘤發(fā)生相關(guān)的信號(hào)通路等。

MCE 的所有產(chǎn)品僅用作科學(xué)研究或藥證申報(bào),我們不為任何個(gè)人用途提供產(chǎn)品和服務(wù)。

 

參考文獻(xiàn)

1. Callaway E. DeepMind's AI for protein structure is coming to the masses[J]. Nature, 2021.

2. Jumper J, Evans R, Pritzel A, et al. Highly accurate protein structure prediction with AlphaFold[J]. Nature, 2021:1-11.

3. Baek M, Dimaio F, Anishchenko I, et al. Accurate prediction of protein structures and interactions using a three-track neural network [J]. Science.

4. Hyelim Cho, Qiong ShenLydia H ZhangMikiko OkumuraAkinori Kawakami, et al. CYP27A1-dependent anti-melanoma activity of limonoid natural products targets mitochondrial metabolism. Cell Chem Biol. 2021 Mar 30;S2451-9456(21)00143-4.

5. JIrwin J J, Tang K G, Young J, et al. ZINC20-A Free Ultralarge-Scale Chemical Database for Ligand Discovery [J]. Journal of Chemical Information and Modeling, 2020, 60, 12, 6065–6073.

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