■ 空白對(duì)照
空白對(duì)照 (Blank control) 是指不給予任何處理的對(duì)照。在細(xì)胞實(shí)驗(yàn)中,常用以評(píng)價(jià)及觀察細(xì)胞是否處于正常狀態(tài)。
如在 The role of ferroptosis in ionizing radiation-induced cell death and tumor suppression 一文中,觀察到 H460、A549 和 H1299 細(xì)胞系在沒(méi)有任何處理的情況下,脂質(zhì)過(guò)氧化水平?jīng)]有任何變化,而暴露于 6 Gy IR 24 小時(shí)后,脂質(zhì)過(guò)氧化相對(duì)水平升高。
圖 1. 電離輻射誘導(dǎo)癌細(xì)胞中的鐵死亡[1]
■ 陽(yáng)性對(duì)照
陽(yáng)性對(duì)照 (Positive control) 是指按照當(dāng)前實(shí)驗(yàn)方案一定能得到陽(yáng)性結(jié)果的對(duì)照實(shí)驗(yàn)。因此,陽(yáng)性對(duì)照具有質(zhì)控的意義。另一方面,陽(yáng)性對(duì)照還可以證明試驗(yàn)藥和對(duì)照藥之間的差別:優(yōu)效性或等效性。
例如,為了研究 H. richardsonii 提取物 PP-360A 對(duì)癌細(xì)胞的有絲分裂的影響,研究者選用諾考達(dá)唑,紫杉醇作為陽(yáng)性對(duì)照,這兩種藥物可以誘導(dǎo)有絲分裂停滯。陽(yáng)性對(duì)照組表明:PP-360A 可以有效地誘導(dǎo)由有絲分裂停滯引起的細(xì)胞形態(tài)改變。如圖 2A 所示,三種細(xì)胞系 (HT-29、M059K、WI-38) 用 PP-360A 處理后的細(xì)胞形態(tài)變圓,與諾考達(dá)唑處理組類似。免疫熒光染色結(jié)果 (圖 2B) 顯示細(xì)胞用 PP-360A 處理后,磷酸組蛋白 H3 (PH3) 和微管蛋白陽(yáng)性細(xì)胞比率升高。
圖 2. A: 用諾考達(dá)唑 (Noco) 或不同濃度 PP-360A 處理的人類癌細(xì)胞形態(tài);B: 用諾考達(dá)唑等以及 PP-360A 處理 HT-29 細(xì)胞的免疫熒光染色[2]■ 陰性對(duì)照
溶劑對(duì)照 (Vehicle control) 是最常見(jiàn)的陰性對(duì)照,一些化合物水溶性不好的化合物,需要用有機(jī)溶劑 DMSO、乙醇等配制儲(chǔ)備液。如果溶劑在最終給藥體系中占比較高,可能會(huì)對(duì)細(xì)胞本身狀態(tài)有較大影響,這時(shí),就會(huì)出現(xiàn)這樣一個(gè)疑問(wèn):是藥物的作用還是溶劑的毒性導(dǎo)致呢?
在鑒定具有抗黑色素瘤活性的檸檬苦素類天然產(chǎn)物的研究中,DMSO 溶劑對(duì)照組的設(shè)置很好地證明了 Haperforin G 在 MELHO 中誘導(dǎo) G1 細(xì)胞周期阻滯和增殖停滯。圖 3. Haperforin G 對(duì)黑色素瘤細(xì)胞增殖和細(xì)胞周期的影響[4]
圖 4. 細(xì)胞用 NC siRNA 或 CYP27A1 siRNA 轉(zhuǎn)染處理 24 小時(shí)[4]
在一些涉及免疫學(xué)的實(shí)驗(yàn)時(shí),往往需要用到同型抗體設(shè)置同型對(duì)照 (Isotype control),同型抗體是指和實(shí)驗(yàn)組具有同源性和相同抗體類別的非特異抗體,如圖 5 所示,同型對(duì)照可以很好的證實(shí)實(shí)驗(yàn)組抗體的特異性。
圖 5. MITF 與黑素瘤細(xì)胞系中內(nèi)源性 CYP27A1 啟動(dòng)子區(qū)域的結(jié)合[5]
小對(duì)照,大學(xué)問(wèn)。一個(gè)科學(xué)系統(tǒng)的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)中必然少不了對(duì)照的身影。對(duì)照不僅能幫我們佐證實(shí)驗(yàn)結(jié)果的可靠性,也能在實(shí)驗(yàn)失敗時(shí)幫助我們排查導(dǎo)致失敗的原因。怎么樣,現(xiàn)在你學(xué)廢了嗎?
相關(guān)產(chǎn)品 |
一種快速可逆的 microtubule 抑制劑,抑制有絲分裂并誘導(dǎo)腫瘤細(xì)胞凋亡。 |
抗腫瘤劑,可導(dǎo)致有絲分裂停滯和誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡。 |
脂質(zhì)氧化的熒光比值探針,常用于鐵死亡研究。 |
共收錄了 4, 800+ 抗腫瘤化合物,主要靶向激酶、細(xì)胞周期調(diào)控的關(guān)鍵蛋白,腫瘤發(fā)生相關(guān)的信號(hào)通路等。 |
MCE 的所有產(chǎn)品僅用作科學(xué)研究或藥證申報(bào),我們不為任何個(gè)人用途提供產(chǎn)品和服務(wù)。
參考文獻(xiàn)
1. Callaway E. DeepMind's AI for protein structure is coming to the masses[J]. Nature, 2021.2. Jumper J, Evans R, Pritzel A, et al. Highly accurate protein structure prediction with AlphaFold[J]. Nature, 2021:1-11.
3. Baek M, Dimaio F, Anishchenko I, et al. Accurate prediction of protein structures and interactions using a three-track neural network [J]. Science.
4. Hyelim Cho, Qiong Shen, Lydia H Zhang, Mikiko Okumura, Akinori Kawakami, et al. CYP27A1-dependent anti-melanoma activity of limonoid natural products targets mitochondrial metabolism. Cell Chem Biol. 2021 Mar 30;S2451-9456(21)00143-4.
5. JIrwin J J, Tang K G, Young J, et al. ZINC20-A Free Ultralarge-Scale Chemical Database for Ligand Discovery [J]. Journal of Chemical Information and Modeling, 2020, 60, 12, 6065–6073.