大家好,我又來啦~~今天給大家放送的是表觀遺傳之組蛋白修飾相關(guān)的內(nèi)容噢,組蛋白修飾也是一個比較復(fù)雜的過程,今天呢,我們就給大家講講組蛋白乙;跋嚓P(guān)的產(chǎn)品。
一 組蛋白修飾
真核生物染色質(zhì)的基本結(jié)構(gòu)單位是核小體,它由約 146 bp DNA 纏繞組蛋白八聚體組成,其中組蛋白八聚體包含 2 (H2A-H2B)二聚體和 1 個 (H3-H4)2四聚體。相鄰的核小體之間由連接 DNA (linker DNA) 及 連 接 組 蛋 白 H1 相 連 。
組 蛋 白 H2A/H2B/H3/H4 屬于核心組蛋白,它們均具有典 型的球狀組蛋白折疊結(jié)構(gòu)域(histone fold),組成了 核小體的核心部分。而它們 N 端和 C 端的柔性帶電的尾巴則從核心區(qū)域伸出來,能夠被各種修飾酶共價修飾。組蛋白翻譯后修飾(post-translational modifications, PTMs) 主要包括乙; (賴氨酸上)、 甲基化 (賴氨酸和精氨酸上)、磷酸化(絲氨酸上)、泛素化、SUMO 化和 ADP 核糖基化修飾等。組蛋白可以在翻譯后對其進行修飾,以改變組蛋白與DNA和核蛋白的相互作用,導(dǎo)致表觀遺傳變化,從而調(diào)節(jié)了許多正常的和與疾病相關(guān)的過程。今天我們給大家說說組蛋白乙;
二 組蛋白乙;揎
蛋白乙酰化:在乙;D(zhuǎn)移酶的作用下,在蛋白質(zhì)賴氨酸殘基上添加乙;倪^程。
組蛋白乙;菏且环N翻譯后修飾,多發(fā)生在核心組蛋白N一端堿性氨基酸集中區(qū)的特定賴氨酸殘基,將乙酰輔酶A的乙;D(zhuǎn)移到賴氨酸的sNH3+中和掉1個正電荷。由組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶(HATs)和組蛋白去乙;D(zhuǎn)移酶(histone deacetylase,HDACs)共同決定。
HDAC四個主要類別:I類,II類,III類和IV類。這些分類基于它們與酵母蛋白質(zhì)的同源性。
I類:HDAC1,HDAC2,HDAC3和HDAC8
II類:HDAC4,HDAC5,HDAC6,HDAC7,HDAC9和HDAC10
III類:包括SIRT1至SIRT7在內(nèi)的7個sirtuin。
IV類:僅包含HDAC11。
重要性:通過研究組蛋白乙酰化和組蛋白脫乙;芯咳藛T可以對“組蛋白密碼”有更多的了解,可以研發(fā)HDAC的藥物,組蛋白脫乙;敢种苿℉DACi)通常用作情緒穩(wěn)定劑和抗癲癇藥,最近已被用作可能的癌癥,神經(jīng)退行性疾病和炎性疾病的治療方法。
接下來,帶來今天的主菜,也是大家最喜歡的產(chǎn)品推薦啦~~
三 組蛋白乙;嚓P(guān)產(chǎn)品
組蛋白乙酰化和組蛋白去乙;ㄔ诮M蛋白蛋白質(zhì)的N末端尾部和核小體核心表面的賴氨酸殘基上添加或去除乙酰基。
組蛋白提取試劑盒
俗話說,磨刀不費砍柴功,在我們進行某項實驗之前首先需要做很多的準備工作,比如組蛋白修飾實驗,我們需要準備的是組蛋白。那么我們怎么來準備適合我們實驗需要的組蛋白呢?想必有不少同學(xué)會疑問我該買什么樣的提取試劑盒。不用擔(dān)心,Epigentek可為大家提供組蛋白提取試劑盒:
OP-0006 EpiQuik Total Histone Extraction Kit(100):
適合從哺乳動物的細胞或者組織中提取總核心組蛋白(H2A, H2B, H3, and H4),組蛋白提取物中的翻譯后修飾(PTM)保持完整,因此可與Epigentek的組蛋白修飾測定試劑盒一起使用,或用于組蛋白甲基化,乙;,磷酸化,SUMO化,泛素化,瓜氨酸化和ADP-核糖基化研究。
OP-0007 piQuik Total Histone Extraction HT Kit:
該試劑盒提供了一種簡單,高通量的酶標(biāo)板方法,用于提取用于各種應(yīng)用的組蛋白,包括組蛋白修飾,例如乙;,甲基化和磺酰化等,可用于直接從96孔板中培養(yǎng)的哺乳動物細胞中提取組蛋白。
參考文獻:
Jang K et. al. (August 2020). Effects of mineral methionine hydroxy analogue chelate in sow diets on epigenetic modification and growth of progeny.J Anim Sci.
Lee JE et. al. (September 2020). Regulation of a long noncoding RNA MALAT1 by aryl hydrocarbon receptor in pancreatic cancer cells and tissues. Biochem Biophys Res Commun.
組蛋白乙;吭噭┖
組蛋白乙;ńM蛋白H3和組蛋白H4,參與染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的調(diào)節(jié)和轉(zhuǎn)錄因子向基因啟動子的募集。量化乙;M蛋白的總水平或特定賴氨酸的水平將有助于闡明基因激活的表觀遺傳調(diào)控,并有助于開發(fā)針對HAT或HDAC的藥物。
參考文獻:
Fouad M et. al. (July 2020). Epigenetic Immunomodulatory Effect of Eugenol and Astaxanthin on Doxorubicin Cytotoxicity in Hormonal Positive Breast Cancer Cells BMC Pharmacology & Toxicology.
Oliveira GS et. al. (August 2020). Effect of exercise and grape juice on epigenetic modulation and functional outcomes in PD: a randomized clinical trial. Physiol Behav. :113135.
組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶(HAT)測定
組蛋白乙;D(zhuǎn)移酶(HAT)是在基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)中起關(guān)鍵作用的酶,通過選擇性地乙酰化位于核心組蛋白蛋白質(zhì)氨基末端附近的賴氨酸的ε-氨基而直接對應(yīng)于轉(zhuǎn)錄。確定HAT的活性及其抑制劑的功效有助于發(fā)現(xiàn)藥物和開發(fā)抗癌藥,以及更好地理解基因轉(zhuǎn)錄。
P-4003 EpiQuik HAT Activity/Inhibition Assay Kit:
用于測量總的組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶活性或抑制率,活性HAT與組蛋白底物結(jié)合并使其乙;。輸入樣本為核提取物或者純化的酶,核提取物可搭配核提取試劑盒(op-0002或者op-0022)。可以用高親和力的抗乙;M蛋白抗體識別乙酰化底物。 直接與HAT酶活性成正比的乙;M蛋白的比例或數(shù)量可以通過ELISA樣反應(yīng)進行比色定量。
參考文獻:
Wijenayake S et. al. (July 2020). Dynamic regulation of histone H3 lysine (K) acetylation and deacetylation during prolonged oxygen deprivation in a champion anaerobe. Mol Cell Biochem.
Cantacorps L et. al. (February 2020). Curcumin treatment attenuates alcohol-induced alterations in a mouse model of foetal alcohol spectrum disorders. Prog Neuropsychopharmacol Biol Psychiatry. :109899.
組蛋白脫乙酰基酶(HDAC)測定
組蛋白脫乙;福℉DAC),也稱為賴氨酸脫乙酰基酶(KDAC),是一類從核心組蛋白(H2A,H2B,H3和H4)除去乙;鶑亩{(diào)節(jié)基因表達的酶。通過研究HDAC的活性和抑制作用,研究人員可以更好地了解組蛋白脫乙酰基對疾病和各種細胞過程的影響。
前面我們介紹了HDAC分四大類有HDAC1~HDAC11和SIRT1~7,因此,我們的產(chǎn)品有針對這些HDAC的活性/抑制分析試劑盒。
參考文獻:
Chelladurai P et. al. (July 2020). Isoform-specific characterization of class I histone deacetylases and their therapeutic modulation in pulmonary hypertension.Sci Rep. 10(1):12864.
Pasquereau S et. al. (July 2020). Impact of glucocorticoids on systemic sirtuin 1 expression and activity in rats with adjuvant-induced arthritis. Epigenetics. :1-12.
下期預(yù)告:表觀遺傳之組蛋白修飾—組蛋白甲基化/磷酸化
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