近日,中南大學(xué)湘雅醫(yī)學(xué)院羅湘杭團(tuán)隊(duì)的研究成果在國(guó)際頂級(jí)代謝期刊Cell Metabolism(IF = 22.415)刊登,文章標(biāo)題為《Reducing Hypothalamic Stem Cell Senescence Protects against Aging-Associated Physiological Decline》。該研究在下丘腦的神經(jīng)干細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)一種名為Hnscr(htNSCs-related)的長(zhǎng)非編碼RNA(lncRNA)能夠與YB-1(Y-box Protein 1)蛋白結(jié)合,并抑制YB-1蛋白的降解。而YB-1又能抑制衰老相關(guān)的蛋白的表達(dá),而且還能恢復(fù)衰老小鼠的記憶認(rèn)知和肌肉平衡等功能。并且通過(guò)對(duì)YB-1蛋白與Hnscr結(jié)合區(qū)域的結(jié)構(gòu)分析,篩選到了一種叫做TF2A的天然化合物,該化合物能夠模擬Hnscr的功能,通過(guò)抑制YB-1的降解,從而降低衰老相關(guān)蛋白的表達(dá),也能起到對(duì)小鼠衰老表型的恢復(fù)作用。
研究背景
衰老是生物界的法則,任何有生命的個(gè)體都無(wú)法逃脫從一誕生就走向衰老,直至死亡這一過(guò)程。人類從古至今孜孜不倦地尋找長(zhǎng)生不老之法,中國(guó)古代從秦皇漢武,到明清的嘉靖雍正,為此無(wú)不耗費(fèi)了巨大財(cái)力和人力。即便是在現(xiàn)在,人們依然在尋找長(zhǎng)壽的秘訣。但目前能做到的只能想方設(shè)法將這一過(guò)程延緩,提高衰老過(guò)程中的人類的生活質(zhì)量。因此對(duì)衰老的深層生物學(xué)機(jī)制的研究可以幫助我們更好地有的放矢,尋找能夠幫助人類延緩衰老的方案。
目前引起衰老的9大原因:
1. 基因組不穩(wěn)定性增加(genomic instability)
2. 端�?s短(telomere attrition)
3. 表觀遺傳學(xué)改變(epigenetic alterations)
4. 蛋白內(nèi)穩(wěn)態(tài)喪失(loss of proteostasis)
5. 營(yíng)養(yǎng)感應(yīng)失調(diào)(deregulated nutrient sensing)
6. 線粒體功能異常(mitochondrial dysfunction)
7.細(xì)胞間信息傳遞改變(altered intercellular communication)
8. 干細(xì)胞枯竭(stem cell exhaustion)
9. 細(xì)胞衰老(cellular senescence)
圖1. 衰老的九大標(biāo)志(引自Lopez-Otin et al., 2013 )
目前有研究發(fā)現(xiàn)下丘腦的功能對(duì)人體的衰老有著重大的影響。下丘腦位于大腦腹面,基本與人的耳朵和眼睛處于同一平面。是調(diào)節(jié)內(nèi)臟,代謝和內(nèi)分泌的重要腦區(qū),能調(diào)節(jié)垂體對(duì)激素的分泌,控制如體溫、飲水,攝食、性活動(dòng)、打斗等行為。2017年,有研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)小鼠下丘腦的神經(jīng)干細(xì)胞隨年齡增長(zhǎng)而逐漸衰老死亡,并伴隨著如肌肉耐力、社交能力以及記憶力等衰老表型的出現(xiàn);如果將新生小鼠的神經(jīng)干細(xì)胞移植到中年小鼠相應(yīng)的腦區(qū),則會(huì)使小鼠重新獲得生命活力。因此,神經(jīng)干細(xì)胞尤其是下丘腦神經(jīng)干細(xì)胞(hypothalamus Neural Stem Cells, htNSCs)的研究可能幫助人們找到對(duì)抗衰老的利器。
圖2. 人類下丘腦(引自NIH)
目前的研究認(rèn)為,在人類的編碼RNA中,真正編碼蛋白的只占30%左右,其余的非編碼RNA還包括小干擾RNA(miRNA)、小核RNA/核仁小RNA(snRNA/snoRNA)、假基因RNA、雜RNA和長(zhǎng)非編碼RNA (long non-coding RNA, lncRNA)。在這些非編碼RNA中,lncRNA長(zhǎng)度大于200個(gè)核苷酸,占總編碼基因的35~40%左右。和其他的非編碼RNA一樣,有一定的時(shí)空表達(dá)特異性,能夠調(diào)節(jié)編碼蛋白的轉(zhuǎn)錄,在高等生物的發(fā)育和組織分化等過(guò)程中起著重要作用。
圖3. 長(zhǎng)非編碼RNA(lncRNA)(引自Atianand et al., 2014)
相比之下,小鼠的lncRNA數(shù)量較少,但也具有不可忽視的重要作用。總體而言,不同物種之間的lncRNA保守性不是很高,并不是所有的人類lncRNA都能在常用的模式動(dòng)物中找到同源物。
研究?jī)?nèi)容
2.1 影響下丘腦衰老的長(zhǎng)非編碼RNA的發(fā)現(xiàn)
在實(shí)驗(yàn)室條件下,小鼠的壽命一般為24個(gè)月。研究人員對(duì)比了3個(gè)月(年輕)和18個(gè)月(中年)小鼠下丘腦神經(jīng)干細(xì)胞的生長(zhǎng)情況,發(fā)現(xiàn)在體外培養(yǎng)7-10天后,年輕小鼠的下丘腦神經(jīng)干細(xì)胞(神經(jīng)干細(xì)胞在體外培養(yǎng)時(shí)一般會(huì)從單個(gè)細(xì)胞分裂成一團(tuán)細(xì)胞,這些細(xì)胞聚集成球狀,其狀態(tài)可表征神經(jīng)干細(xì)胞的活性)形成神經(jīng)球的數(shù)量和大小都要高于中年小鼠,說(shuō)明年輕小鼠的下丘腦神經(jīng)干細(xì)胞數(shù)量和活性都要高于中年小鼠。
那么,這種差異是如何產(chǎn)生的呢?使用RNAseq對(duì)這些神經(jīng)球進(jìn)行檢測(cè),發(fā)現(xiàn)一種被命名為Hnscr(htNSCs-related)的lnc-RNA在年輕小鼠的表達(dá)要顯著高于中年小鼠,而且這種lnc-RNA與人類高度同源,選擇其進(jìn)行研究有利于后續(xù)向人類相關(guān)lncRNA研究的轉(zhuǎn)化。通過(guò)RT-PCR檢測(cè)也發(fā)現(xiàn)Hnscr不但在3個(gè)月和18個(gè)月的小鼠中存在顯著差異,而且隨著年齡的增長(zhǎng)表達(dá)逐漸降低。
圖4. 年齡對(duì)htNSCs形成神經(jīng)球的影響及Hnscr表達(dá)隨年齡減少
2.2 Hnscr敲除小鼠抑制htNSCs活性并誘發(fā)衰老表型
這里用到的Hnscr敲除小鼠(賽業(yè)生物科技提供)年輕的時(shí)候(3月齡)在大部分基本表型上與對(duì)照小鼠相比,在體重、行為以及生育等方面沒(méi)有差異。但當(dāng)小鼠到了18個(gè)月的時(shí)候,轉(zhuǎn)基因小鼠的htNSCs出現(xiàn)了明顯的病理表型,包括形成神經(jīng)球的數(shù)量減少,體積減��;衰老神經(jīng)元的增加;分化能力變?nèi)酢?/p>
圖5. 敲除hnscr基因?qū)tNSCs的影響
上述的這些研究都是神經(jīng)干細(xì)胞在離體培養(yǎng)中發(fā)生的改變。那么具體到動(dòng)物的表型上又有哪些改變呢?
研究人員通過(guò)一系列的行為實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)Hnscr敲除小鼠的肌肉持久力變?nèi)酰瑒?dòng)作的協(xié)調(diào)性變差,運(yùn)動(dòng)能力降低,與其他小鼠的互動(dòng)減少,同時(shí)空間記憶能力也不如同窩對(duì)照小鼠。這一系列的衰老表型導(dǎo)致了Hnscr敲除小鼠的壽命顯著降低。
圖6. 敲除hnscr基因?qū)π∈蟊硇偷挠绊?/span>
2.3 局部抑制Hnscr抑制小鼠htNSCs活性并誘發(fā)衰老表型
雖然已經(jīng)證實(shí)了Hnscr對(duì)下丘腦神經(jīng)干細(xì)胞和小鼠認(rèn)知功能的影響,但是由于轉(zhuǎn)基因小鼠的Hnscr缺失是全身性的,具體到下丘腦干細(xì)胞對(duì)衰老的影響還無(wú)法下定論。因此研究人員采用腦定位注射的方法,用腺病毒包裝SOX2啟動(dòng)子和Hnscr-shRNA注射進(jìn)入14月齡小鼠下丘腦內(nèi)側(cè)基底(Mediobasal Hypothalamic,MBH)抑制Hnscr的表達(dá)。結(jié)果發(fā)現(xiàn)與Hnscr敲除小鼠一樣,htNSCs的神經(jīng)球數(shù)量減少,體積減小;衰老神經(jīng)元增加;分化能力變?nèi)酢?/p>
圖7. 局部注射sh-hnscr抑制Hnscr對(duì)htNSCs的影響
此外,在動(dòng)物行為方面,小鼠除了社交能力沒(méi)有明顯變化以外,其他的注射了sh-hnscr的小鼠發(fā)生了和基因敲除小鼠一致的表型。
圖8. 局部注射sh-Hnscr對(duì)野生型小鼠表型的影響
2.4 YB-1受Hnscr調(diào)節(jié)并參與對(duì)小鼠htNSCs衰老的抑制
那么,Hnscr究竟是怎樣影響小鼠htNSCs的改變并作用到小鼠衰老表型的呢?通過(guò)RNA-pulldown后的質(zhì)譜檢測(cè)(找出與該RNA結(jié)合的豐度最高的蛋白),免疫印跡(用抗體確定就是YB1蛋白),免疫共沉淀(進(jìn)一步證明結(jié)合)等多種方法證明Hnscr是與一種YB-1(Y-box Protein 1)的蛋白具有高度的親和力。并且還發(fā)現(xiàn)Hnscr影響的是YB-1的蛋白水平而非RNA轉(zhuǎn)錄水平。接下來(lái)通過(guò)蛋白酶抑制劑的使用和泛素化實(shí)驗(yàn),研究人員確定了Hnscr能夠抑制YB-1的泛素化降解,從而提高YB-1在神經(jīng)細(xì)胞中的豐度。
注:YB-1是一種能夠結(jié)合DNA和RNA的蛋白,通常在轉(zhuǎn)錄和翻譯過(guò)程中發(fā)揮作用,并作用于pre-RNA的剪切、DNA的修復(fù)以及參與核糖核蛋白的組裝,還有研究發(fā)現(xiàn)YB-1能夠在microRNA的加工中起作用,其不正常表達(dá)跟多種腫瘤的發(fā)生有關(guān)。
圖9. Hnscr抑制YB-1降解
為了進(jìn)一步明確Hnscr和YB-1對(duì)衰老的影響,在Hnscr敲除小鼠中研究人員用RT-PCR的方法檢測(cè)發(fā)現(xiàn)Hnscr或者YB-1減少均會(huì)導(dǎo)致p16INK4A mRNA表達(dá)量的增加。Hnscr的減少會(huì)降低YB-1的表達(dá),反過(guò)來(lái)YB-1的增加卻不會(huì)提高Hnscr的水平,說(shuō)明Hnscr在通路中位于YB-1的上游。對(duì)mRNA的表達(dá)一致,YB-1的增加也會(huì)抑制p16INK4A 蛋白的表達(dá)。研究人員繼續(xù)對(duì)htNSCs的活性和衰老狀態(tài)進(jìn)行了檢測(cè),發(fā)現(xiàn)增加YB-1也能抑制其衰老并提高分化活性。
注:p16INK4A與衰老相關(guān),可以看做是一種衰老標(biāo)志物蛋白,但該蛋白也是一種抑癌基因,其活性的降低在多種腫瘤細(xì)胞中也比較常見(jiàn)。
圖10 . YB-1對(duì)Hnscr缺失小鼠p16INK4A和htNSCs影響
2.5 TF2A抑制YB-1降解并緩解htNSCs及小鼠的衰老
無(wú)論是YB-1還是Hnscr,直接應(yīng)用于對(duì)抗人類的衰老都是相當(dāng)困難的,那么有沒(méi)有一種物質(zhì)能夠模擬Hnscr的作用,抑制YB-1進(jìn)行的降解,從而抑制衰老呢?研究人員從分子化合物庫(kù)中篩選得到了一種名為TF2A(茶黃素3-沒(méi)食子鹽酸,Theaflavin 3-Gallate)的物質(zhì),該物質(zhì)在經(jīng)過(guò)發(fā)酵的紅茶中含量豐富,而紅茶又是中國(guó)南方地區(qū)廣泛流行的飲品。在蛋白合成抑制劑CHX的存在的條件下,實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)TF2A能夠和Hnscr一樣抑制YB-1的降解,并能抑制YB-1的泛素化,而且在一定濃度范圍內(nèi),隨著TF2A濃度的提高,YB-1的豐度逐漸提高。
圖11. TF2A抑制YB-1降解
研究者也補(bǔ)充了細(xì)胞表型和動(dòng)物行為方面的實(shí)驗(yàn),結(jié)果顯示TF2A對(duì)htNSCs起到的恢復(fù)效果基本和外源增加Hnscr與YB-1所產(chǎn)生的效果一致,不過(guò)對(duì)小鼠肌肉和運(yùn)動(dòng)協(xié)調(diào)恢復(fù)有明顯效果,對(duì)認(rèn)知和社交這類高級(jí)認(rèn)知功能也體現(xiàn)出了部分作用,不過(guò)統(tǒng)計(jì)上并沒(méi)有與對(duì)照產(chǎn)生統(tǒng)計(jì)學(xué)上的顯著差異。值得注意的是,TF2A是通過(guò)飲用水給小鼠服用的,說(shuō)明該物質(zhì)易用性很好。
圖12. TF2A抑制htNSCs衰老并改善小鼠衰老表型
全文總結(jié)及展望
總結(jié)下來(lái),本文的研究思路十分清晰:
1. 對(duì)比lncRNA在不同年齡之間htNSCs的表達(dá)差異,根據(jù)表達(dá)變化幅度以及與人類的親源關(guān)系等限定條件找到Hnscr;
2. 利用基因編輯敲除小鼠Hnscr,研究Hnscr對(duì)htNSCs以及小鼠表型的影響;
3. 通過(guò)腦定位注射shRNA精準(zhǔn)抑制小鼠下丘腦神經(jīng)干細(xì)胞中的Hnscr,探究該區(qū)域htNSCs的改變,驗(yàn)證Hnscr敲除小鼠中該長(zhǎng)非編碼RNA的功能;
4. 通過(guò)多種方法找到Hnscr高親和力蛋白YB-1,先確定Hnscr抑制YB-1降解,并驗(yàn)證YB-1對(duì)htNSCs和小鼠表型的影響;
5. 通過(guò)數(shù)據(jù)庫(kù)和實(shí)驗(yàn)篩選出功能類似于Hnscr的小分子化合物,并驗(yàn)證其在小鼠下丘腦干細(xì)胞和動(dòng)物表型中發(fā)揮的作用。
該研究不僅揭示了下丘腦中神經(jīng)干細(xì)胞影響衰老的深層機(jī)理,加強(qiáng)了人們對(duì)衰老過(guò)程的認(rèn)識(shí),還發(fā)現(xiàn)了一種能夠模擬抗衰老長(zhǎng)非編碼RNA的化合物——TF2A。長(zhǎng)久以來(lái)就有喝茶有益健康,延年益壽的說(shuō)法。TF2A是發(fā)酵紅茶中的一種成分,早在上世紀(jì)50年代就已經(jīng)被分離出來(lái)。該研究采用現(xiàn)代生物學(xué)的方法,通過(guò)多角度的深入研究,發(fā)現(xiàn)了其在抗衰老作用的深層機(jī)理,在人類追求高品質(zhì)的老年生活的道路上邁出了堅(jiān)實(shí)的一步。
參考文獻(xiàn):
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