彗星實(shí)驗(yàn)(Comet assay)也被稱為單細(xì)胞凝膠電泳實(shí)驗(yàn)(Single cell gel electrophoresis,SCGE),是一種在單細(xì)胞水平上檢測DNA損傷的技術(shù)。當(dāng)各種內(nèi)源性和外源性 DNA 損傷因子誘發(fā)細(xì)胞 DNA 鏈斷裂時(shí),其超螺旋結(jié)構(gòu)受到破壞,在細(xì)胞裂解液作用下,細(xì)胞膜、核膜等膜結(jié)構(gòu)受到破壞,細(xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì)、RNA 以及其他成分均擴(kuò)散到電解液中,而核DNA由于分子量太大不能進(jìn)入凝膠而留在原位。電泳過程中,如果DNA沒有損傷,則將停留在原位,染色后呈圓形的熒光團(tuán),無拖尾出現(xiàn)。如果DNA受損,斷裂的碎片進(jìn)入到凝膠中,在電場的作用下,DNA碎片離開原位向陽極遷移,形成拖尾。DNA受損越嚴(yán)重,斷裂越多,產(chǎn)生的碎片就越多、越小,則向陽極遷移的DNA碎片量就越多,遷移距離也越長,熒光染色后就能看見“彗星”樣尾長并且熒光強(qiáng)度增強(qiáng)。
目前有兩種常見的彗星實(shí)驗(yàn)檢測方式——堿性處理&中性處理。在堿性處理?xiàng)l件下,DNA發(fā)生變性,因而可檢測包括單鏈及雙鏈斷裂在內(nèi)的所有DNA 損傷;在中性處理?xiàng)l件下,DNA 維持雙鏈構(gòu)象,因而僅可以檢測雙鏈斷裂。
實(shí)驗(yàn)大體流程如下:
注:最常用的熒光染料是SYBR Gold,但熒光染料的觀察需要熒光顯微鏡。如果選擇銀染,使用標(biāo)準(zhǔn)的光學(xué)顯微鏡觀察即可。
圖片處理
在拍照時(shí)以tif格式保存圖片,然后用CASP彗星分析軟件分析,如下圖是軟件打開的界面➙
接下來➙導(dǎo)入圖片,用白色畫框選中要分析的區(qū)域。下圖中的“調(diào)整”項(xiàng)可以調(diào)整畫框的位置以包含整個(gè)細(xì)胞,開始分析前要點(diǎn)擊“開始”,然后點(diǎn)“分析”,再點(diǎn)“保存”,這樣一張圖的數(shù)據(jù)就分析完了,數(shù)據(jù)會保存在系統(tǒng)里。點(diǎn)擊“翻頁”可以繼續(xù)分析下一張圖。
分析完所有圖片后導(dǎo)出數(shù)據(jù)到Excel表格,保留TailDNA%(尾部DNA百分含量),TailLength(尾長),TailMoment(尾矩)三列數(shù)據(jù)。根據(jù)細(xì)胞尾部的DNA百分含量(即TailDNA%),將采集的細(xì)胞圖像分為5級:彗星尾部熒光強(qiáng)度(TailDNA%)占總強(qiáng)度為0-6%是0級;6.1%-17.0%是1級;17.1%-35.0%是2級;35.1%-60.0%是3級;60.1%-100.0%是4級。
彗星率等于彗星細(xì)胞數(shù)目(除去0級細(xì)胞)占總細(xì)胞數(shù)目的百分比。任意值等于各等級細(xì)胞的百分比與其對應(yīng)的級別號的乘積之和,它可以綜合反映細(xì)胞的DNA損傷情況。最后,綜合分析Tail DNA%、Tail length、Tail moment、彗星率和任意值,共5個(gè)指標(biāo)比較細(xì)胞的DNA損傷程度。
作為一家專注于開發(fā)細(xì)胞凋亡、DNA損傷和修復(fù)、腫瘤細(xì)胞功能與行為等相關(guān)研究產(chǎn)品的美國生物技術(shù)公司,Trevigen可為您提供彗星實(shí)驗(yàn)全線產(chǎn)品:
CometAssay®彗星分析專用玻片
貨號 | 名稱 | 規(guī)格 |
4250-004-03 | CometSlide™(2 Well) | 2孔樣式玻片 * 2片 |
4250-050-03 | CometSlide™(2 Well) | 2孔樣式玻片 * 25片 |
4250-200-03 | CometSlide™(2 Well) | 2孔樣式玻片 * 100片 |
4252-040-01 | CometSlide™(20 Well) | 20孔樣式玻片 * 2片 |
4252-200-01 | CometSlide™(20 Well) | 20孔樣式玻片 * 10片 |
4252-500-01 | CometSlide™(20 Well) | 20孔樣式玻片 * 20片 |
4252-02K-01 | CometSlide™(20 Well) | 20孔樣式玻片 * 100片 |
4253-096-03 | CometSlide™(96Well) | 96孔樣式玻片 * 1片 |
CometAssay® 彗星分析銀染試劑盒
貨號 | 名稱 | 規(guī)格 |
4254-200-K | Silver Staining Components | 200次銀染分析 |
4251-050-K | CometAssay®Silver Kit | 2孔樣式玻片 * 25片和50次銀染分析 備注: 包括4250-050-k(彗星實(shí)驗(yàn)試劑) + 4254-200-K(銀染試劑) |
CometAssay®彗星分析試劑盒
貨號 | 名稱 | 規(guī)格 |
4250-050-K | CometAssay® Kit (25 x 2 well slides) | 50次分析 |
4252-040-K | CometAssay® Kit (2X20 well slides) | 40次分析 |
4253-096-K | CometAssay® Kit (1X96 well slides) | 96次分析 |
CometAssay®彗星電泳檢測系統(tǒng)
貨號 | 名稱 | 產(chǎn)品組分 |
4250-050-ES | CometAssay® Electrophoresis System | 彗星電泳儀 |
4250-050-ESK | CometAssay® 2 Well ES Unit w/ Starter Kit | 彗星電泳儀&25個(gè)2孔玻片式彗星分析試劑盒 |
4250-050-ESK-PS1 | CometAssay® 20 Well ES Unit w/ Starter Kit and Power Supply
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彗星電泳儀& 25個(gè)2孔玻片式彗星分析試劑盒&電源 |
4252-040-ESK | CometAssay® 20 Well ES Unit w/ Starter Kit | 彗星電泳儀&25個(gè)2孔玻片彗星分析式試劑盒 |
4252-040-ESK-PS1 | CometAssay® 20 Well ES Unit w/ Starter Kit plus NA Power Supply | 彗星電泳儀& 2個(gè)20孔玻片式彗星分析試劑盒&電源 |
4253-096-ESK | CometAssay® 96 Well ES Unit w/ Starter Kit | 彗星電泳儀&1個(gè)96孔玻片式彗星分析試劑盒 |
4253-096-ESK-PS1 | CometAssay® 96 Well ES Unit w/ Starter Kit plus NA Power Supply | 彗星電泳儀&電源與1個(gè)96孔玻片式彗星分析試劑盒 |
備注:以上套裝電源為北美制氏電源,其他制氏類型電源(例如英國制式),詳詢艾美捷科技
除了以上試劑盒外,Trevigen還可單獨(dú)提供彗星實(shí)驗(yàn)的各種試劑組分,例如:低熔點(diǎn)瓊脂糖CometAssay® LMAgarose)、細(xì)胞裂解液(CometAssay® Lysis Solution)。
Trevigen是一家快速成長的美國生物技術(shù)公司,專注于細(xì)胞凋亡、DNA損傷和修復(fù)、腫瘤細(xì)胞功能與行為等方面研究的腫瘤研究產(chǎn)品和服務(wù)。作為 Trevigen在中國區(qū)域的總代理,艾美捷與Trevigen一道為中國的科研工作者提供最好、最新的氧化應(yīng)激、細(xì)胞損傷和腫瘤細(xì)胞行為研究等領(lǐng)域內(nèi)的 優(yōu)質(zhì)產(chǎn)品和技術(shù)服務(wù)。
如果您對上述產(chǎn)品及方案感興趣,請致電400-6800-868至艾美捷科技有限公司垂詢彗星實(shí)驗(yàn)的相關(guān)產(chǎn)品,或索取最新的產(chǎn)品資料。