基因芯片篩選發(fā)現(xiàn)小麥白粉病抗性基因Stpk-V
小麥?zhǔn)悄壳笆澜缟戏N植最廣泛的糧食作物,全球至少三分之一的人口以小麥為主食。而小麥白粉。╬owdery mildew)嚴(yán)重影響小麥的產(chǎn)量,小麥白粉病是由白粉菌(Blumeria graminis f. sp. tri1ci,Bgt)引起的世界性真菌病害,培養(yǎng)小麥白粉病抗性品種是控制白粉病的有效途徑。
南京農(nóng)業(yè)大學(xué)作物遺傳與種質(zhì)創(chuàng)新國家重點實驗室的陳佩度教授是小麥遺傳育種的專家,他曾將簇毛麥(Haynaldia villosa)抗白粉病基因定位于6V染色體短臂,這一染色體區(qū)段后來被命名為Pm21。簇小麥-普通小麥易位系T6VS-6AL具有持久、廣譜的白粉病抗性,這也從一個側(cè)面證明了Pm21具有穩(wěn)定的白粉病抗性功能。然而Pm21染色體區(qū)段上白粉病抗性基因的精細(xì)定位用傳統(tǒng)的分子遺傳方法卻很難實現(xiàn),因為簇毛麥的6VS染色體區(qū)段與普通小麥的6AS不配對。
在本研究中,陳佩度教授領(lǐng)導(dǎo)研究小組利用基因芯片等技術(shù)手段,克隆并鑒定出Pm21基因簇的關(guān)鍵成員——絲氨酸和蘇氨酸蛋白激酶基因(Serine/threonine kinase gene,Stpk-V),此基因賦予了小麥白粉病抗性。該研究成果發(fā)表在2011年的PNAS雜志上。相關(guān)的基因芯片技術(shù)服務(wù)由上海伯豪生物技術(shù)有限公司/生物芯片上海國家工程研究中心()完成。
一、基因芯片篩選發(fā)現(xiàn)Pm21染色體區(qū)段處的白粉病抗性基因
研究小組首先利用基因芯片(Affymetrix Barley GeneChip)比較Bgt感染前后的簇毛麥表達(dá)譜,發(fā)現(xiàn)Bgt感染后,共有196個基因表達(dá)量增加了一倍,其中有131個基因具有明確的功能。在這131個基因中,研究人員發(fā)現(xiàn)了4個抗性相關(guān)基因(resistance gene analogues,RGAs),而其中只有一個基因位于簇毛麥的6VS區(qū)段,這個基因就是Stpk-V。隨后研究人員用RT-PCR的方法對基因芯片的結(jié)果進(jìn)行了驗證,并用RACE的方法獲得了Stpk-V基因的cDNA全長,并用可轉(zhuǎn)化人工染色體(transforma Mon-competent arMficial chromosome,TAC)文庫的方法獲得了Stpk-V基因全長,Stpk-V基因共有6個外顯子和5個內(nèi)含子。研究小組又用FISH和GISH的方法對Stpk-V進(jìn)行基因組定位,證實它確實位于6VS的FL 0.45-0.58染色體區(qū)段上,這一區(qū)段正是Pm21基因簇的位置。
二、Stpk-V的功能分析
吸器(haustorium)是真菌生長過程中獲取營養(yǎng)物質(zhì)的關(guān)鍵器官,吸器指數(shù)(haustorium index)也常被用來衡量真菌的生長狀況。研究小組利用瞬時表達(dá)的方法對Stpk-V對Bgt感染小麥的吸器指數(shù)進(jìn)行了研究。
如圖所示。Yangmai158小麥?zhǔn)荁gt敏感型,易位系小麥T6VS-6AL則具有Bgt抗性。當(dāng)Yangmai158瞬時表達(dá)對照基因GUS時,吸器指數(shù)高達(dá)54.8%;而Yangmai158瞬時表達(dá)GUS+Stpk-V時,吸器指數(shù)降低到13.6%。T6VS-6AL瞬時表達(dá)GUS,吸器指數(shù)為14.1%。這一結(jié)果表明,瞬時表達(dá)Stpk-V會抑制Bgt的生長。
Bgt感染T6VS-6AL和Yangmai158,隨后用RT-PCR分析Stpk-V的表達(dá)情況,發(fā)現(xiàn)Bgt的感染能增加T6VS-6AL中Stpk-V的表達(dá)量,而Yangmai158中則檢測不到Stpk-V的表達(dá)。用病毒誘導(dǎo)的基因沉默系統(tǒng)(virus-induced gene silencing system, VIGS)抑制簇毛麥和T6VS-6AL中的Stpk-V,會導(dǎo)致吸器指數(shù)的增加。
三、Bgt抗性的機(jī)制研究
在Bgt感染T6VS-6AL易位系小麥后,可以觀察到明顯的因超敏反應(yīng)(HypersensiMve Response,HR)引起的細(xì)胞死亡。植物的超敏反應(yīng)是植物應(yīng)對病原菌侵襲的一種保護(hù)性措施,主要表現(xiàn)是受侵細(xì)胞及其鄰近細(xì)胞的快速壞死,從而遏制病原菌的生長。研究人員推測Stpk-V對Bgt的抗性可能也是通過超敏反應(yīng)實現(xiàn)的。
超敏反應(yīng)最常見的信號分子是H2O2,于是研究人員開始研究三種小麥(Bgt敏感型Yangmai158,Bgt抗性型T6VS-6AL,轉(zhuǎn)化型pAHC:Stpk-V)在Bgt感染后H2O2的積累情況,并與生存情況對比。結(jié)果顯示,在Yangmai158中,H2O2僅在Bgt感染的初期大量富集,隨后含量降低,也沒有超敏反應(yīng)的發(fā)生。而在T6VS-6AL和pAHC:Stpk-V中,H2O2始終存在,從而能引起超敏反應(yīng),遏制Bgt的進(jìn)一步侵襲。
綜上所述,研究小組利用表達(dá)譜芯片的方法比較Bgt感染前后的簇毛麥表達(dá)譜,篩選到了位于Pm21基因簇上發(fā)揮Bgt抗性功能的基因Stpk-V,隨后利用吸器指數(shù)實驗和瞬時表達(dá)實驗證實Stpk-V確實能抑制Bgt的感染,最后通過比較三種不同基因型小麥在Bgt感染后H2O2的積累情況,發(fā)現(xiàn)Stpk-V對Bgt的抗性可能和植物的超敏反應(yīng)有關(guān)。
原文出處:
Cao A, Xing L, Wang X, Yang X, Wang W, Sun Y, Qian C, Ni J, Chen Y, Liu D, Wang X, Chen P. From the Cover: Serine/threonine kinase gene Stpk-V, a key member of powdery mildew resistance gene Pm21, confers powdery mildew resistance in wheat. Proc Natl Acad Sci USA. 2011, 108(19): 7727-7732.