技術(shù)簡介:
cDNA文庫是以特定的組織或細(xì)胞mRNA為模板,逆轉(zhuǎn)錄形成的互補(bǔ)DNA(cDNA)與適當(dāng)?shù)妮d體(常用噬菌體或質(zhì)粒載體)連接后轉(zhuǎn)化受體菌形成重組DNA克隆群,這樣包含著細(xì)胞全部mRNA信息的cDNA克隆集合稱為該組織或細(xì)胞的cDNA文庫。cDNA文庫特異地反映某種組織或細(xì)胞中,在特定發(fā)育階段表達(dá)的蛋白質(zhì)的編碼基因,因此cDNA文庫具有組織或細(xì)胞特異性。cDNA文庫比基因組DNA文庫小得多,能夠比較容易從中篩選克隆得到細(xì)胞或組織特異表達(dá)的基因。cDNA文庫在研究具體某類特定細(xì)胞中基因組的表達(dá)狀態(tài)及表達(dá)基因的功能鑒定方便具有特殊的優(yōu)勢,從而使它在個(gè)體發(fā)育、細(xì)胞分化、細(xì)胞周期調(diào)控、細(xì)胞衰老和死亡調(diào)控等生命現(xiàn)象的研究中具有更為廣泛的應(yīng)用價(jià)值,是研究工作中最常使用到的基因文庫。
經(jīng)典cDNA文庫構(gòu)建基本原理:用Oligo(dT)作逆轉(zhuǎn)錄引物,或者用隨機(jī)引物,給所合成的cDNA 加上適當(dāng)?shù)倪B接接頭,連接到適當(dāng)?shù)妮d體中獲得cDNA文庫。其基本步驟包括:(1)mRNA的提取。獲取高質(zhì)量的mRNA是構(gòu)建高質(zhì)量的cDNA文庫的關(guān)鍵步驟之一。(2)cDNA第一條鏈的合成。(3)cDNA第二條鏈的合成。(4)雙鏈cDNA的修飾。(5)雙鏈cDNA的分子克隆。(6)cDNA文庫的擴(kuò)增。(7)cDNA文庫鑒定評價(jià)。
客戶須知:
1. 客戶須在實(shí)驗(yàn)開始前確保其提供材料的數(shù)量和質(zhì)量,并提供相關(guān)信息。
客戶可提供組織(200~1000μg)、細(xì)胞(106)或總RNA (>1μg ),請務(wù)必保持樣品新鮮,RNA無任何降解,植物材料應(yīng)避免過老的組織,盡量用柔嫩部位,以確保文庫質(zhì)量。同時(shí)請盡量提供物種基因組背景資料信息,如:基因組大小,基因平均長度,預(yù)計(jì)表達(dá)的基因數(shù)量等等。
材料具體要求:
A. 動(dòng)物、植物、微生物組織 請?zhí)峁┳懔康男迈r樣品(4℃保存,不超過一天)或?qū)⑿迈r樣品立即存于液氮或-80℃后保存不超過一個(gè)星期。
注意: 用植物樣品構(gòu)建基因組文庫,為了降低文庫中的葉綠體污染,樣品須是植物的黃化苗嫩芽。若需建cDNA文庫,樣品必須是新鮮保存的。
B. RNA 如要提供RNA,要求總RNA>500ug,濃度>1ug/ul;mRNA>3ug,濃度>50ng/ul;OD260/OD280值:2.0,以我方電泳膠圖、紫外分析儀定量檢測為準(zhǔn)。 RNA的總量根據(jù)庫容量不同會(huì)有所增加。
注意: a) 建議由我方提取RNA;b) 對于客戶提供的RNA,由于樣品原因建庫可能沒有結(jié)果或結(jié)果不好,其損失和責(zé)任全部由樣品提供方承擔(dān);c)由樣品質(zhì)量產(chǎn)生的任何問題,其損失和責(zé)任應(yīng)全部由樣品提供方承擔(dān)。
2. 本公司在收到客戶提供的研究材料后會(huì)在第二個(gè)工作日起開始服務(wù)工作。
3. 工作完成后,本公司會(huì)將結(jié)果及時(shí)發(fā)給客戶,同時(shí)根據(jù)客戶要求處理相關(guān)材料。
4. 客戶應(yīng)對所提供的材料及信息負(fù)責(zé),如因客戶提供的材料及信息不準(zhǔn)確而引起的實(shí)驗(yàn)延誤或經(jīng)濟(jì)損失全部由客戶承擔(dān)。
服務(wù)承諾:
1. 本公司將在保證質(zhì)量的前提下,在最短的時(shí)間內(nèi)完成實(shí)驗(yàn)。
2. 本公司保證檢測結(jié)果準(zhǔn)確、客觀、可信。
3. 公司將對所有技術(shù)服務(wù)相關(guān)材料信息保密,并會(huì)在服務(wù)完成后按客戶要求對相關(guān)材料進(jìn)行合理處理。
服務(wù)周期:
實(shí)驗(yàn)周期一般為得到合格的總RNA后15~45個(gè)工作日。
1. 從客戶提供的材料中提取高質(zhì)量的mRNA。
2. 根據(jù)客戶需求構(gòu)建普通cDNA文庫、全長cDNA文庫和均一化cDNA文庫。
服務(wù)內(nèi)容:
百博明創(chuàng)(北京)生物科技有限公司擁有一批優(yōu)秀的文庫構(gòu)建專業(yè)技術(shù)人員,可以提供標(biāo)準(zhǔn)化cDNA文庫構(gòu)建以及EST測序和分析服務(wù),可以針對動(dòng)物、植物、微生物等的組織和細(xì)胞等材料進(jìn)行文庫構(gòu)建(普通cDNA文庫、全長cDNA文庫和均一化cDNA文庫)。
A.材料用量少,只需要1mg的Total RNA。
B.采用Clontech SMART專利技術(shù),技術(shù)成熟,全長比率高。
(2)均一化文庫構(gòu)建
文庫特點(diǎn):
1.無需反復(fù)雜交過程,均一化程度高。
2.均一化后平均插入片斷大小無明顯變化。
(3)全長文庫構(gòu)建
文庫特點(diǎn):
1.不經(jīng)過PCR過程,容易獲得低豐度基因
2.全長比例高(全長比例>80%)
3.樣品用量大,需要25mg的mRNA,因此,不適合樣品量少的材料。
交貨產(chǎn)品:
A. 產(chǎn)物電泳圖譜;
B. 初始庫,保存在-20℃;
C. 文庫評價(jià)數(shù)據(jù),包括庫容量,插入片段平均長度,重組效率,cDNA完整性評價(jià)等。技術(shù)指標(biāo):庫容≥1.0×106,insert≥400 bp,平均 insert≥1.3Kb
D. 實(shí)驗(yàn)報(bào)告(包括實(shí)驗(yàn)流程,材料和方法等)。
優(yōu)惠報(bào)價(jià):
cDNA文庫構(gòu)建:1-3萬元人民幣
全長cDNA文庫構(gòu)建:3.0-5.0萬元人民幣
均一化cDNA文庫構(gòu)建:3.5-6萬元人民幣
cDNA測序:
≥10,000條序列 20元/條
5,000-10,000條序列 25元/條
≤5000條序列 30元/條
信息服務(wù):1.5-4.0萬元
基本信息服務(wù):從峰圖到序列的轉(zhuǎn)化,控制低質(zhì)量,去除載體序列;序列拼接;EST注釋;ORF預(yù)測及分析;利用 nr,nt數(shù)據(jù)庫進(jìn)行注釋。
高級信息服務(wù):代謝途徑分析;功能蛋白分析;Interpro功能域分析;序列屬性及其對應(yīng)unigene分析;COG分析;EST相關(guān)網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫構(gòu)建。
BAC文庫構(gòu)建篩選專家-百博明創(chuàng)
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