微衛(wèi)星標記（Microsatellite）也稱為短串聯(lián)重復序列（STR）或簡單重復序列（SSR），是廣泛分布在真核生物基因組中的簡單重復序列，一般由一個長2～6bp的核心序列經多次串聯(lián)重復排列而成，重復次數(shù)大多在10～60次之間。微衛(wèi)星中重復單位的數(shù)目存在高度變異，這些變異表現(xiàn)為微衛(wèi)星數(shù)目的整倍性變異或重復單位序列中的序列有可能不完全相同，因而造成多個位點的多態(tài)性。SSR標記能很好地將這些變異揭示出來，不同的SSR在不同的種甚至不同個體間的多態(tài)性。由于基因組中某一特定的微衛(wèi)星的側翼序列通常都是保守性較強的單一序列，因而可以將微衛(wèi)星側翼的DNA片段克隆、測序，然后根據(jù)微衛(wèi)星的側翼序列就可以人工合成引物進行PCR擴增，從而將單個微衛(wèi)星位點擴增出來。由于單個微衛(wèi)星位點重復單元在數(shù)量上的變異，個體的擴增產物在長度上的變化就產生長度的多態(tài)性，這一多態(tài)性稱為簡單序列重復長度多態(tài)性(SSLP)，每一擴增位點就代表了這一位點的一對等位基因。由于SSR重復數(shù)目變化很大，所以SSR標記能揭示比RFLP高得多的多態(tài)性。STR分型高效快捷，結果精確，是非常重要的遺傳標記，在基因定位、遺傳育種等領域有著廣泛的應用。

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