離子交換層析實(shí)驗(yàn)指南
離子交換層析(Ion Exchange Chromatography, IEX)是一種基于蛋白等電點(diǎn)(pI)和緩沖液 pH 之間的電荷差異,利用離子交換介質(zhì)對(duì)帶正電(陽離子交換)或負(fù)電(陰離子交換)的蛋白進(jìn)行分離的方法。該方法可用于蛋白純化、去除雜質(zhì)、濃縮目標(biāo)蛋白等。
1. 實(shí)驗(yàn)原理
離子交換層析依賴于蛋白的凈電荷與固定相的相互作用:
陽離子交換層析(Cation Exchange, CEX):固定相帶負(fù)電,結(jié)合帶正電的蛋白(pH < pI)。
常用填料:CM-Cellulose, SP-Sepharose。
陰離子交換層析(Anion Exchange, AEX):固定相帶正電,結(jié)合帶負(fù)電的蛋白(pH > pI)。
常用填料:DEAE-Cellulose, Q-Sepharose。
在不同鹽濃度(如 NaCl 梯度)或 pH 梯度的作用下,結(jié)合的蛋白被依次洗脫,實(shí)現(xiàn)分離。
2. 實(shí)驗(yàn)材料與設(shè)備
(1) 試劑與填料
- 離子交換填料(如 Q Sepharose Fast Flow, SP Sepharose Fast Flow)。
- 緩沖液(一般選擇 pKa 接近目標(biāo)蛋白 pI 的緩沖體系)。常用緩沖液:
- Tris-HCl(pH 7.0-8.5)
- HEPES(pH 6.8-8.2)
- MES(pH 5.5-6.7)
- 洗脫鹽溶液:通常為 0-1 M NaCl 梯度洗脫,或 KCl、(NH₄)₂SO₄。
(2) 設(shè)備
層析柱(如 HiTrap Q FF 5 mL, HiTrap SP FF 5 mL)。
層析系統(tǒng)(Hass25 AKTA、FPLC等)。
(圖例使用輝因科技全具備自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)國產(chǎn)蛋白純化系統(tǒng)Hy-Hass25)
輝因科技蛋白純化系統(tǒng)Hy-Hass25
紫外檢測儀(280 nm 監(jiān)測蛋白洗脫)。
3. 實(shí)驗(yàn)步驟
Step 1. 預(yù)處理
樣品準(zhǔn)備:
細(xì)胞裂解、離心(10,000 x g, 10 min),取上清。
0.22 μm 過濾,去除顆粒和雜質(zhì)。
調(diào)節(jié)緩沖液 pH 以確保目標(biāo)蛋白帶相應(yīng)電荷(pH < pI 選 CEX,pH > pI 選 AEX)。
調(diào)節(jié)離子強(qiáng)度,低鹽(<50 mM NaCl)可增強(qiáng)蛋白吸附。
柱子平衡:
用 5 倍柱體積(CV)的平衡緩沖液清洗柱子,流速 1-2 mL/min。
監(jiān)測 280 nm 吸光度,確保基線穩(wěn)定。
Step 2. 蛋白結(jié)合
樣品加載:
以 1 mL/min 低流速 加載蛋白(最大不超過柱體積的 10%)。
監(jiān)測 280 nm,確保蛋白吸附完全(流出液 A280 降低)。
洗滌雜質(zhì):
繼續(xù)用平衡緩沖液清洗柱子,直到流出液 A280 降至基線(去除未結(jié)合蛋白)。
Step 3. 洗脫蛋白
梯度洗脫:
使用 0-1 M NaCl 線性梯度(通常 10-20 CV)。
逐步增加鹽濃度,使不同結(jié)合力的蛋白依次洗脫。
監(jiān)測 280 nm,記錄蛋白洗脫峰。
等度洗脫(可選):
直接用 0.5-1 M NaCl 緩沖液一步洗脫目標(biāo)蛋白(適用于已知洗脫條件的蛋白)。
Step 4. 分段收集與后處理
收集洗脫組分:
根據(jù) UV 吸收峰,分段收集蛋白組分。
用 SDS-PAGE 確定目標(biāo)蛋白所在的洗脫組分。
緩沖液置換:
透析或超濾換至目標(biāo)緩沖液(如 PBS、Tris-HCl)。
濃縮蛋白(如使用 10 kDa 超濾離心管)。
4. 優(yōu)化策略
(1) 提高分辨率
降低流速(0.5-1 mL/min),減少峰擴(kuò)散。
優(yōu)化梯度洗脫(線性梯度 vs. 分步梯度)。
(2) 提高結(jié)合效率
選擇合適的 pH,使蛋白帶足夠電荷。
低離子強(qiáng)度(<50 mM NaCl)有助于蛋白結(jié)合。
(3) 目標(biāo)蛋白洗脫優(yōu)化
低 pH 或高 pH 改變蛋白電荷狀態(tài),幫助洗脫。
除了 NaCl,也可嘗試 KCl 或 (NH₄)₂SO₄。
5. 結(jié)果分析
SDS-PAGE:檢測目標(biāo)蛋白的純度。
UV 280 nm 吸收峰:確認(rèn)目標(biāo)蛋白的洗脫位置。
蛋白濃度測定(Bradford/BCA 法):計(jì)算蛋白回收率。
6. 常見問題及解決方案
問題 可能原因 解決方案
目標(biāo)蛋白未結(jié)合柱子 pH 不合適,蛋白未帶電 調(diào)整 pH 使蛋白帶電
目標(biāo)蛋白流失在洗脫前 樣品鹽濃度過高 降低 NaCl 濃度 <50 mM
目標(biāo)蛋白洗脫不完全 鹽濃度不夠 提高 NaCl 梯度(0-1 M)
目標(biāo)蛋白變性 pH 過低或過高 選擇溫和 pH(pH 6-8)
7. 典型實(shí)驗(yàn)參數(shù)
參數(shù) 設(shè)定值
柱體積 5 mL (HiTrap Q/SP)
流速 1 mL/min
平衡緩沖液 20 mM Tris-HCl (pH 7.4), 50 mM NaCl
洗脫方式 0-1 M NaCl 梯度洗脫 (20 CV)
收集方式 1 mL 分段收集
儀器 盡量選擇優(yōu)質(zhì)穩(wěn)定的儀器,這樣可以去除設(shè)備因素
總結(jié)
離子交換層析是一種高效的蛋白純化方法,通過調(diào)節(jié) pH 和鹽梯度,可獲得高純度目標(biāo)蛋白。合理選擇 緩沖體系、填料和梯度洗脫方式,可顯著提高分辨率和回收率。
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