Plant Phenomics | 全球糧食安全研究所對大豆根瘤功能結構的同步輻射X射線成像進行可視化與定量評價
在現代農業(yè)中,作物與固氮菌的共生關系對于氮肥的可持續(xù)替代發(fā)揮著重要作用。大豆作為典型的豆科作物,通過根瘤中的固氮細菌進行氮的生物固氮,這一過程極大地影響了作物的生長與產量。為了更好地理解大豆根瘤中不同組織在氮固定過程中的功能,科學家們不斷尋求新的技術手段來可視化和量化根瘤內部的結構。
2024年7月,Plant Phenomics 在線發(fā)表了加拿大Global Institute for Food Security題為Visualization and Quantitative Evaluation of Functional Structures of Soybean Root Nodules via Synchrotron X-ray Imaging 的研究論文。這項研究利用同步加速器X射線顯微斷層成像(SR-μCT)技術,對新鮮大豆根瘤的內部結構進行了非侵入性的三維成像。
研究表明,根瘤中的中央感染區(qū)(CIZ)是固氮細菌集中的區(qū)域,負責氮氣的轉化,而維管束(VBs)則負責將水分、養(yǎng)分及固氮產物輸送到植物體內。通過半自動分割算法,研究團隊生成了大豆根瘤內部結構的三維模型,并對這些結構的體積進行了精確的定量分析。
圖2 4周齡大豆植株(基因型PI209332)新鮮根瘤的同步輻射x射線顯微斷層圖像。
圖5 我們研究的3種不同N2固定的大豆基因型中,每個結節(jié)的中心感染區(qū)(CIZ,紫色)和結節(jié)脈管系統(tǒng)(藍色)的重建結節(jié)內部組織的三維視圖。
值得注意的是,研究還利用同步輻射X射線熒光成像(SR-XRF)技術,首次在2D平面上可視化了根瘤內鐵和鋅的分布,鐵主要集中在中央感染區(qū),而鋅則主要分布在維管束中。這些元素的空間分布為理解根瘤的功能提供了新的視角,有望為未來的育種工作提供關鍵表型信息。
這項研究的成果不僅展示了同步加速器X射線成像技術在植物內部結構研究中的潛力,還為通過根瘤功能的增強來提高作物固氮能力提供了新思路。
論文鏈接:
https://doi.org/10.34133/plantphenomics.0203
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About Plant Phenomics
《植物表型組學》(Plant Phenomics)是由南京農業(yè)大學創(chuàng)辦的英文學術期刊,于2019年1月正式上線發(fā)行。采用開放獲取形式,刊載植物表型組學交叉學科熱點領域具有突破性科研進展的原創(chuàng)性研究論文、綜述、數據集和觀點。具體范圍涵蓋高通量表型分析的最新技術,基于圖像分析和機器學習的表型分析研究,提取表型信息的新算法,作物栽培、植物育種和農業(yè)實踐中的表型組學新應用,與植物表型相結合的分子生物學、植物生理學、統(tǒng)計學、作物模型和其他組學研究,表型組學相關的植物生物學等。期刊已被DOAJ、Scopus、PMC、EI和SCIE等數據庫收錄?祁Nò睯CR2023影響因子為7.6,位于農藝學一區(qū)(1/125名),植物科學一區(qū)(13/265名),遙感一區(qū)(6/62名)。2023年中科院期刊分區(qū)位于農林科學大類一區(qū)。2020年入選中國科技期刊卓越行動計劃高起點新刊項目、2024年入選江蘇科技期刊卓越行動計劃領軍期刊項目、中國科技期刊卓越行動計劃二期英文梯隊期刊。
說明:本文由《植物表型組學》編輯部負責組稿。
中文內容僅供參考,一切內容以英文原版為準。
撰稿:王孟達(南京農英大學)
排版:王平、陳思潔(昆山杜克大學)
審核:尹歡、孔敏