運(yùn)用基因組原位雜交技術(shù)精準(zhǔn)甄別抗黃矮小麥
瀏覽次數(shù):115 發(fā)布日期:2024-12-7
來源:威尼德生物科技
摘要
本研究圍繞小麥黃矮病這一嚴(yán)重威脅全球小麥產(chǎn)量與品質(zhì)的病害展開,創(chuàng)新性地運(yùn)用基因組原位雜交(GISH)技術(shù),旨在建立一套精準(zhǔn)甄別抗黃矮小麥的高效方法。通過對大量小麥品種及種質(zhì)資源的樣本處理、嚴(yán)謹(jǐn)實(shí)驗(yàn)操作與數(shù)據(jù)分析,成功明確了抗病與感病小麥在基因組層面的差異特征,不僅精準(zhǔn)鑒定出攜帶抗黃矮病關(guān)鍵基因的小麥材料,還為后續(xù)抗病小麥選育、基因定位及功能解析提供關(guān)鍵技術(shù)支撐與理論依據(jù),有力推動小麥抗黃矮病育種進(jìn)程。
引言
(一)小麥黃矮病現(xiàn)狀及危害
小麥作為全球最重要的糧食作物之一,關(guān)乎著數(shù)十億人口的基本口糧供應(yīng)。然而,小麥黃矮病猶如高懸在小麥產(chǎn)業(yè)頭頂?shù)?“達(dá)摩克利斯之劍”,由蚜蟲傳播的大麥黃矮病毒(BYDV)引發(fā),該病具有爆發(fā)突然、傳播迅速、危害范圍廣等特點(diǎn)。染病小麥植株初期葉片發(fā)黃、生長遲緩,隨后光合作用嚴(yán)重受阻,麥穗發(fā)育不良,產(chǎn)量銳減可達(dá) 30% - 70%,在重病區(qū)甚至可能絕收。且隨全球氣候變暖、貿(mào)易往來頻繁,其發(fā)病頻率與傳播范圍呈上升、擴(kuò)大態(tài)勢,給小麥安全生產(chǎn)帶來極大挑戰(zhàn)。
(二)傳統(tǒng)抗病甄別方法的局限
過往鑒別抗黃矮小麥多依賴田間表型觀察與人工接種鑒定。田間觀察易受環(huán)境因素干擾,不同年份、地域氣候差異致使小麥生長表現(xiàn)波動,難以精準(zhǔn)判斷抗病性;人工接種雖能一定程度模擬發(fā)病,但操作繁瑣、耗時(shí)久,還存在病毒接種量與發(fā)病程度把控不準(zhǔn)問題,且無法從根本上揭示小麥內(nèi)在抗病遺傳機(jī)制,難以滿足高效、精準(zhǔn)育種需求。
(三)基因組原位雜交技術(shù)優(yōu)勢及應(yīng)用前景
基因組原位雜交技術(shù)是分子細(xì)胞遺傳學(xué)領(lǐng)域 “利器”,能直接在染色體水平定位特定 DNA 序列。用于甄別抗黃矮小麥時(shí),可清晰呈現(xiàn)抗病基因在基因組位置、拷貝數(shù)及與其他染色體關(guān)系。相較傳統(tǒng)方法,它不受環(huán)境左右,以直觀、精準(zhǔn)視角直擊小麥抗病遺傳本質(zhì),為快速鎖定抗病種質(zhì)、挖掘抗病基因、培育優(yōu)質(zhì)抗病品種開辟全新路徑,在小麥抗病研究領(lǐng)域極具應(yīng)用潛力。
實(shí)驗(yàn)材料與方法
(一)實(shí)驗(yàn)材料
小麥樣本收集:從國內(nèi)外各大種質(zhì)資源庫、小麥主產(chǎn)區(qū)廣泛搜集不同生態(tài)型小麥品種 200 余份,涵蓋已知抗黃矮品種、感病品種及野生近緣種,確保樣本遺傳多樣性豐富,最大程度囊括潛在抗病基因資源。每份樣本種植于防蟲網(wǎng)室,嚴(yán)格管控生長條件,在三葉期、拔節(jié)期、抽穗期分別采集新鮮葉片,迅速液氮速凍后 -80℃保存?zhèn)溆谩?br />
探針制備:以已克隆、測序明確的抗黃矮病關(guān)鍵基因片段為模板,運(yùn)用 PCR 技術(shù)擴(kuò)增、標(biāo)記探針。選用生物素、地高辛等高效標(biāo)記物,經(jīng)嚴(yán)格純化、質(zhì)量檢測,保證探針特異性與靈敏度,能精準(zhǔn)識別小麥基因組對應(yīng)抗病基因區(qū)域,為后續(xù)雜交奠定基礎(chǔ)。
(二)實(shí)驗(yàn)方法
染色體玻片制備:取小麥幼嫩根尖,置于飽和對二氯苯溶液預(yù)處理,卡諾氏固定液固定,隨后用 1mol/L 鹽酸解離細(xì)胞壁,改良苯酚品紅染色,壓片法制得染色體分散良好、形態(tài)清晰玻片;經(jīng)梯度乙醇脫水、空氣干燥,玻片 -20℃儲存?zhèn)溆,確保染色體完整、結(jié)構(gòu)清晰利于雜交。
原位雜交流程:將玻片在 70℃變性液處理使染色體 DNA 解鏈,迅速冰浴淬火;探針與雜交緩沖液按比例混合,滴加玻片,加蓋玻片封片后置于保濕盒,37℃雜交 16 - 24 小時(shí),期間維持溫濕度穩(wěn)定,促使探針與靶序列充分互補(bǔ)配對;雜交后依次經(jīng)嚴(yán)謹(jǐn)洗脫去除非特異性結(jié)合探針,再用熒光標(biāo)記抗生物素、抗地高辛抗體孵育,使雜交信號放大、可視化。
(三)顯微鏡觀察與數(shù)據(jù)分析
熒光顯微鏡成像:玻片置于熒光顯微鏡,選用合適濾光片組合,分別捕捉染色體與雜交信號熒光圖像;調(diào)整焦距、曝光參數(shù),獲取多視野、高分辨率圖像,保證各染色體及雜交位點(diǎn)清晰呈現(xiàn);對每個(gè)樣本隨機(jī)選取 10 個(gè)視野拍照記錄,留存原始圖像數(shù)據(jù)。
數(shù)據(jù)分析:利用專業(yè)圖像分析軟件定量分析雜交信號,測量信號強(qiáng)度、面積、位置;統(tǒng)計(jì)各小麥品種抗病基因位點(diǎn)數(shù)目、分布規(guī)律;通過聚類分析、主成分分析等多元統(tǒng)計(jì)方法,對比不同品種雜交結(jié)果,依抗病基因特征精準(zhǔn)甄別抗黃矮小麥,構(gòu)建品種抗病性數(shù)字化評價(jià)體系,繪制直觀抗病圖譜。
實(shí)驗(yàn)結(jié)果與討論
(一)抗病與感病小麥基因組雜交信號差異
直觀呈現(xiàn):抗黃矮小麥品種在預(yù)期染色體區(qū)域呈現(xiàn)強(qiáng)而集中的雜交信號,熒光亮點(diǎn)清晰、規(guī)則,位置與已知抗病基因定位相符;感病品種對應(yīng)區(qū)域信號微弱、彌散甚至無信號,鮮明揭示二者在抗病基因攜帶狀態(tài)的本質(zhì)區(qū)別,圖像為抗病甄別提供最直觀證據(jù)。
量化分析:經(jīng)軟件測算,抗病品種平均信號強(qiáng)度比感病品種高 3 - 5 倍,信號面積精準(zhǔn)定位在特定染色體臂,占該臂總長特定比例;數(shù)據(jù)量化支撐視覺差異,凸顯 GISH 技術(shù)精準(zhǔn)揭示基因組差異能力,為后續(xù)育種選材提供可靠量化指標(biāo)。
(二)不同小麥種質(zhì)資源抗病基因分布規(guī)律
品種間差異:地方品種多含古老、獨(dú)特抗病基因,呈零散分布,單份材料攜帶基因位點(diǎn)少但類型多樣;現(xiàn)代育成品種經(jīng)定向選育,抗病基因集中在少數(shù)優(yōu)勢染色體區(qū)段,拷貝數(shù)高,利于穩(wěn)定遺傳抗病性;野生近緣種蘊(yùn)藏大量未知抗病基因,信號常出現(xiàn)在進(jìn)化保守區(qū)域,為拓寬小麥抗病基因庫提供寶貴資源。
地域關(guān)聯(lián):來自黃矮病高發(fā)區(qū)小麥品種抗病基因分布頻率高、類型多元,是長期自然與人工選擇結(jié)果;低發(fā)區(qū)品種雖總體攜帶基因少,但偶現(xiàn)稀有變異位點(diǎn),暗示區(qū)域適應(yīng)性抗病機(jī)制,助力區(qū)域針對性育種策略制定。
(三)基于 GISH 甄別結(jié)果的育種啟示
親本選配:精準(zhǔn)甄別成果指導(dǎo)育種親本搭配,依抗病基因互補(bǔ)、累加原則,組合含不同優(yōu)良抗病位點(diǎn)品種,加速聚合多抗基因,培育高抗、廣適小麥新品系;避免盲目雜交,減少育種周期與資源浪費(fèi)。
基因定位與克。烘i定抗病基因確切位置后,利用分子標(biāo)記技術(shù)精細(xì)定位,結(jié)合生物信息學(xué)、基因編輯手段克隆、功能驗(yàn)證,解析抗病分子機(jī)制;推動轉(zhuǎn)基因、基因編輯抗病育種從理論走向?qū)嵺`,提升小麥自主抗病能力。
研究創(chuàng)新點(diǎn)與展望
(一)創(chuàng)新點(diǎn)
技術(shù)集成創(chuàng)新:將基因組原位雜交與小麥黃矮病抗性甄別深度融合,優(yōu)化實(shí)驗(yàn)流程,實(shí)現(xiàn)從樣本處理到數(shù)據(jù)分析全鏈條高效精準(zhǔn)操作;解決傳統(tǒng)方法無法精準(zhǔn)定位抗病基因難題,拓展 GISH 技術(shù)在作物抗病研究應(yīng)用邊界。
大數(shù)據(jù)挖掘:積累海量小麥品種基因組雜交數(shù)據(jù),借多元統(tǒng)計(jì)挖掘基因分布、遺傳關(guān)聯(lián)信息;打破以往單一品種研究局限,構(gòu)建小麥抗病基因大數(shù)據(jù)平臺,為全球小麥育種者共享資源、協(xié)同創(chuàng)新提供支撐。
(二)展望
技術(shù)拓展:結(jié)合新興單細(xì)胞測序、三代測序技術(shù),追蹤抗病基因在單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄、染色體三維結(jié)構(gòu)動態(tài)變化;從多維度解析抗病機(jī)制,助力靶向基因操作與智能育種設(shè)計(jì)。
應(yīng)用深化:將精準(zhǔn)甄別體系嵌入小麥智慧育種平臺,實(shí)現(xiàn)田間 - 實(shí)驗(yàn)室實(shí)時(shí)數(shù)據(jù)交互;依氣候、病害流行模型預(yù)測育種方向,推動小麥產(chǎn)業(yè)從 “經(jīng)驗(yàn)育種” 邁向 “精準(zhǔn)智能育種”,筑牢全球糧食安全防線。
本研究借基因組原位雜交技術(shù)為小麥抗黃矮病研究注入強(qiáng)勁動力,未來隨技術(shù)迭代、理念更新,有望重塑小麥抗病育種格局,為保障全球糧食穩(wěn)定供應(yīng)貢獻(xiàn)關(guān)鍵力量。