郁金香碎色病毒探針法熒光定量RT-PCR試劑盒
Tu lip b reaki ng Pot y vi rus P ro be RT - q P C R K it
產(chǎn)品及特點
本試劑盒可用于檢測郁金香碎色病毒。郁金香碎色病毒(Tulip breaking Potyvirus , TBV)屬馬鈴薯 Y 病毒科馬鈴薯 Y 病毒屬,只侵染郁金香屬(
Tulipa spp.)和百合屬(
Lilium spp.)植物,導(dǎo)致郁金香和百合的花瓣和葉片出現(xiàn)斑駁的雜色條紋,感染 TBV 的郁金香不 僅表現(xiàn)出花色雜色,而且植株也會退化。本產(chǎn)品是根據(jù)探針法熒光定量 RT-PCR 原理開發(fā) 的郁金香碎色病毒檢測試劑盒,它具有下列特點:
1. 即開即用,用戶只需要提供樣品 RNA 模板。
2. 引物等組分經(jīng)過優(yōu)化,靈敏度高。
3. 提供陽性對照,便于區(qū)分假陰性樣品。
4. 特異性高,引物是根據(jù)郁金香碎色病毒 RNA 序列高度保守區(qū)設(shè)計,不會跟其他 病毒的 RNA 發(fā)生交叉反應(yīng)。
5. 既可用于定性檢測,又可用于定量檢測。用于定量檢測時線性范圍至少為 5 個 數(shù)量級。
6. 本產(chǎn)品足夠 50 次 20μL 體系的探針法熒光定量 RT-PCR 反應(yīng)。
7. 本產(chǎn)品只能用于科研。
成分規(guī)格
產(chǎn)品組成 |
編號 |
規(guī)格 |
2 × OneStep Probe Mix |
021101a |
550 μl |
OneStep Probe Enzyme Mix |
021102b |
55 μl |
DEPC-H2O |
070401 |
1 ml |
熒光模板稀釋液 |
070407 |
1 ml |
郁金香碎色病毒
RT-qPCR 引物-探針混合液 |
1525190yp |
210 μl |
郁金香碎色病毒 RT-qPCR 陽性對照
(1×10E8 拷貝/μL) |
1525190pc |
50 μl |
保存條件
低溫運輸,-20℃保存,保存期限為一年。陽性對照需要單獨放置,不要污染其他試 劑。
使用方法
一、RNA 提取(樣本制備區(qū))
用自選方法提取純化樣品 RNA,本試劑盒跟市場上大多數(shù)核酸提取試劑盒兼容。建 議使用病毒基因組 DNA/RNA 提取試劑盒(Cat:GZ010702-50)提取 RNA。
二、稀釋標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品(樣本制備區(qū))
(由于陽性對照濃度高,因此下列稀釋操作一定要在獨立的區(qū)域進(jìn)行,避免污染樣 品或本試劑盒的其他成分)。
1. 標(biāo)記 6 個離心管,分別為 7 ,6 ,5 ,4 ,3 ,2。
2. 用帶芯槍頭分別加入 45 μL 熒光模板稀釋液,(最好用帶芯槍頭,下同)。
3. 在 7 號管中加入 5 μL 1×10E8 拷貝/μL 的陽性對照(試劑盒提供),充分震蕩 1 分鐘, 得 1×10E7 拷貝/μL 的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。
4. 換槍頭,在 6 號管中加入 5 μL 1×10E7 拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所得),充分震 蕩 1 分鐘,得 1×10E6 拷貝/μL 的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。
5. 換槍頭,在 5 號管中加入 5 μL 1×10E6 拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所得),充分震 蕩 1 分鐘,得 1×10E5 拷貝/μL 的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。
6. 重復(fù)上面的操作直到得到 6 個稀釋度的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。 若無需制作標(biāo)準(zhǔn)曲線,將陽性對照稀釋到 1×10E5 拷貝/μL 即可。
三、試劑配制(試劑準(zhǔn)備區(qū))
若有 N 個待檢樣品,準(zhǔn)備 N+2 個 qPCR 管(N 個待檢樣品+1個陰性對照+6 個陽性對 照) ,向各 qPCR 管中分別加入下列成分。
成分 |
樣品管 N+2 個 |
qPCR 陰性對照 |
qPCR 陽性對照 |
2 × OneStep Probe Mix |
各 10 μL |
10 μL |
10 μL |
OneStep Probe Enzyme Mix |
各 1 μL |
1 μL |
1 μL |
郁金香碎色病毒 RT-qPCR 引物-探針 混合液 |
各 4 μL |
4 μL |
4 μL |
轉(zhuǎn)移至樣本準(zhǔn)備區(qū)。
四、添加模板(模板添加區(qū))
向 qPCR 管中分別加入 5 μl 模板,順序為陰性對照(DEPC-H2O)、待測樣品模板、 郁金香碎色病毒 RT-qPCR 陽性對照,離心 30 秒,立即進(jìn)行擴增反應(yīng)。
五、擴增反應(yīng)(擴增及產(chǎn)物分析區(qū))
將 qPCR 管放置在 qPCR 擴增儀器樣品槽相應(yīng)位置,進(jìn)行擴增,擴增程序如下:
過程 |
溫度 |
時間 |
逆轉(zhuǎn)錄 |
50℃ |
20 min |
預(yù)變性 |
95℃ |
3 min |
qPCR 反應(yīng) (45 個循環(huán)) |
95℃ |
15 sec |
60℃ |
20 sec |
信號通道 |
FAM 通道采集熒光信號 |
六、結(jié)果分析
1. 如果制作標(biāo)準(zhǔn)曲線,則以陽性對照濃度的 log 值為橫軸,以 Ct 值為縱軸,繪制 標(biāo)準(zhǔn)曲線。再以待測樣品的 Ct 值從標(biāo)準(zhǔn)曲線上推算出樣品 RNA 濃度的 log 值,推算出 其濃度。
2. 如果未制作標(biāo)準(zhǔn)曲線,按照如下標(biāo)準(zhǔn)判定結(jié)果:
陽性對照(1×10E5 拷貝/μL)結(jié)果:Ct 值<30 ,有明顯指數(shù)增長,呈典型的 S 型曲 線。
陰性對照結(jié)果:Ct 值>40 或無 Ct 值,無明顯指數(shù)增長期和平臺期。
樣本檢測結(jié)果:Ct 值<38 ,有明顯指數(shù)增長,表明樣本中檢測出該病毒,結(jié)果為陽 性;Ct 值>40 或無 Ct 值,表明樣本中未檢測出該病毒,結(jié)果為陰性;Ct 值在38-40 范 圍,應(yīng)對樣本進(jìn)行復(fù)檢,如重復(fù)實驗結(jié)果 Ct 值仍在 38-40 范圍,有明顯指數(shù)增長,則判 定為陽性,否則為陰性。
關(guān)聯(lián)產(chǎn)品
產(chǎn)品編號 |
產(chǎn)品名稱 |
010702-50 |
病毒基因組 DNA/RNA 提取試劑盒(離心柱型) |
020701-1 |
2 ×Probe qPCR Mix |
020801-1 |
2×SYBR qPCR Mix |