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小分子量蛋白成功做好WB實驗的影響因素

瀏覽次數(shù):4545 發(fā)布日期:2022-6-22  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責任自負
相信經(jīng)常做WB的實驗汪們經(jīng)常會頭疼,郁悶。有些蛋白指標一次就能做成功,而有些指標做無數(shù)次都是失敗,導致吃不香,睡不下。蛋白分子量過大或過小都不易做,今天我們就來聊下小分子量蛋白如果成功做出WB。
 
一、上樣量
通常Western Blot每孔上樣量為30-50μg,80%蛋白在細胞中的含量很低,當?shù)鞍追肿恿窟^小時,上樣量建議選擇50-100μg。畢竟對 于小分子的蛋白來說,在跑電泳時,稍不留心,蛋白就跑沒影了。
 
二、凝膠電泳
1.選擇合適膠濃度。分子量小的蛋白,建議配置5%的濃縮膠,分離膠濃度參考下表。
分子量(kDa) 分離膠濃度
X≤10 15%
10 13.5%
15 12%
2.電泳電壓太大會導致跑在最前面的小分子蛋白成鋸齒狀,建議濃縮膠用80V 30分鐘,之后調(diào)成100V, 溴酚藍跑到距膠底1cm以上就停下,不要跑到底,否則目的蛋白可能跑出去了。
 
三、轉(zhuǎn)模
1.膜的選擇。免疫印跡中常用的固相材料有 NC 膜、DBM、DDT、尼龍膜、PVDF 膜等。推薦選用 PVDF 膜(聚偏二氟乙烯),因為蛋白質(zhì)與 PVDF 膜以疏水力結合,從而將親水部位暴露到液相,使抗體更容易與之結合。
 
針對不同分子量的蛋白質(zhì),PVDF 膜有兩種規(guī)格:0.45 μm 的膜適合檢測 MW > 20 kDa 的蛋白質(zhì),0.2 μm 的膜適合檢測MW < 20 kDa 的蛋白質(zhì),而且0.2 μm 的膜可以有效防止蛋白質(zhì)在轉(zhuǎn)移過程中直接穿透過膜。PVDF 膜使用之前需要在甲醇中浸泡 5min 后再轉(zhuǎn)入轉(zhuǎn)移液中,PVDF膜用甲醇泡的目的是為了活化PVDF膜上面的正電基團,使它更容易跟帶負電的蛋白質(zhì)結合。
 
2.轉(zhuǎn)膜方式。對于小分子蛋白,電流太大或時間太長容易轉(zhuǎn)過。轉(zhuǎn)膜采用濕轉(zhuǎn),條件參考下圖
分子量(kDa) 轉(zhuǎn)膜條件
X≤10 恒流200mA,30min
10 < X≤15 恒流200mA,40min
15< X≤20 恒流200mA,50min
3.轉(zhuǎn)膜前的平衡時間短點,幾分鐘甚至1min就好。平衡所用的液體及轉(zhuǎn)膜液成份相同,都不要加SDS,效果是天壤之別。
 
四、轉(zhuǎn)膜后用麗春紅染色,測定蛋白豐度。
PVDF膜經(jīng)麗春紅染色后,可以檢測出樣品電泳過程中呈現(xiàn)印跡的大小,通過各個泳道上樣品印跡的對比,可以初步判斷上樣量的準確性。
 
五、一抗的稀釋比例。
通?贵w的說明書上都會給出一定的稀釋比例對于分子量過小的蛋白來說,一抗應選擇低的稀釋比例,這樣有助于抗體的結合。
 
六、顯影要把握曝光時間。
根據(jù)信號的強弱適當調(diào)整曝光時間,如果在暗處馬上可以看到條帶,建議曝光時間在30s-2min內(nèi)完成,如果信號較弱,第一遍滴加顯影液后條帶不會很清晰,可以把膜拿出來放一邊讓它反應一會,然后再放回機器里面,重新滴加顯影液顯影,效果就會好不少。還有適當延長顯影時間,就能獲得清晰的條帶。
 
以上就是關于小分子量蛋白WB實驗的一些經(jīng)驗建議,希望對還被小分子量蛋白WB折磨的朋友們有幫助。 
來源:上海雅吉生物科技有限公司
聯(lián)系電話:021-34661275
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