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單細胞轉錄組+16S揭示腸道微生物或能為機體免疫系統(tǒng)“充電”

瀏覽次數(shù):972 發(fā)布日期:2022-4-22  來源:中科新生命
腸道微生物群的組成與腫瘤的發(fā)展和抗腫瘤免疫的功效有關。匹茲堡大學醫(yī)學院Timothy Hand教授研究團隊在Immunity (31.428)雜志上發(fā)表了一篇研究論文,名為“Microbiota-specific T follicular helper cells drive tertiary lymphoid structures and anti-tumor immunity against colorectal cancer”,揭示了帶有免疫原性腸道細菌肝螺桿菌(Hhep)定殖結腸腫瘤小鼠,誘導Hhep特異性T濾泡輔助細胞和腫瘤鄰近的三級淋巴結構(TLSs)擴張,從而促進抗腫瘤免疫。


研究材料
AOM-DSS模型鼠、AOM-DSS+Hhep小鼠

技術路線
· 步驟1:表型數(shù)據(jù)分析發(fā)現(xiàn)Hhep定殖介導了結腸癌中強大的抗腫瘤作用;
· 步驟2:單細胞轉錄組分析揭示Hhep定殖增加細胞毒性淋巴細胞的腫瘤浸潤并促使TLSs的擴張;
· 步驟3:Tfh 細胞是 Hhep 介導的腫瘤控制和免疫浸潤所必需的。

研究結果
1. Hhep定殖重塑結直腸癌腫瘤微環(huán)境
前人的研究表明,Hhep菌(一種具有內在免疫原性的腸道細菌)定殖荷瘤小鼠引發(fā)的特異性免疫反應可修飾結腸癌微生物群結構,導致抗腫瘤免疫增強。本研究,作者將Hhep菌定殖于生長7周的結直腸癌(CRC)小鼠模型中,相對于對照組(荷瘤小鼠無Hhep菌定殖),Hhep定殖顯著減少了腫瘤的數(shù)量和大小,延長了小鼠的生存周期。同時,Hhep定殖對腫瘤小鼠的腸道微生物群產(chǎn)生影響,以及腫瘤的免疫細胞浸潤增加。以上結果表明,Hhep定殖介導了結腸癌中強大的抗腫瘤作用。


圖1 Hhep可降低腫瘤負荷并增加CRC的生存周期

2. Hhep驅動的抗腫瘤免疫
為了更全面的了解Hhep定殖對CRC TME的影響,作者對腫瘤上皮層細胞(epithelial layer,EL)進行單細胞轉錄組測序,共鑒定出12個細胞簇,Hhep定殖誘導了細胞毒性淋巴細胞(簇1)和效應T細胞(簇5)的增加。其中細胞毒性淋巴細胞包含多種不同的NK細胞和T細胞(CD8+、CD4+),表達與細胞毒性功能相關的基因(Gzma)。以上數(shù)據(jù)表明,Hhep定殖增加細胞毒性淋巴細胞的腫瘤浸潤。


圖2  Hhep定殖導致腫瘤TME的細胞毒性淋巴細胞的增加

3. Hhep定殖促使TLSs擴張
前人的研究表明,Hhep特異性CD4+T細胞主要在結腸固有層( lamina propria,LP)中積累(Chai et al., 2017; Xu et al., 2018),因此作者利用單細胞轉錄組測序分析了Hhep定殖對LP的影響。聚類分析揭示了表達與基質和內皮細胞相關基因的細胞(簇 1、5、9 和 13)的富集,特別是 Hhep 定殖小鼠中 Ccl21a+Lyve1+ 淋巴管簇(簇 9、子簇 2)的增加。同時,作者觀察到 LP 中淋巴管生成所需基因(Pdpn,Vegfc)的頻率增加,熒光顯微鏡顯示 Lyve-1 染色增加。Hhep定殖的小鼠顯示腫瘤周圍和腫瘤內部的TLSs數(shù)量增加,與TLS形成相關的基因表達增加,以上數(shù)據(jù)表明,Hhep 定殖促使小鼠結腸淋巴網(wǎng)絡的擴張。


圖3 Hhep定殖擴大了結腸淋巴網(wǎng)絡

4. Hhep定殖驅動Hhep特異性CD4+Tfh細胞擴增
抗體介導的耗竭實驗顯示,抗腫瘤免疫不依賴于CD8+T細胞,但依賴于CD4+T細胞。因此,作者分析了結腸中CD4+T細胞對Hhep定殖的反應,流式結果顯示,在Hhep定殖后,CD4+ T細胞中Tfh細胞(CXCR5+PD1+CD4+ T cells)的百分比持續(xù)增加,即在結直腸腫瘤的背景下,Hhep定殖驅動Hhep特異性Tfh細胞擴增。


圖4  Hhep定殖驅動Hhep特異性Tfh細胞擴增

5. Tfh細胞是Hhep菌介導的腫瘤控制和免疫浸潤所必需的
對TLSs進行FISH染色發(fā)現(xiàn)TLSs中含有Hhep菌和Hhep特異性T細胞。為了測試Hhep特異性Tfh細胞在TLS誘導和直接控制CRC中的重要性,作者利用AOM-DSS+Hhep處理Bcl6fl/flCd4Cre小鼠(Tfh 細胞缺陷型)誘導CRC證實了Tfh細胞是Hhep驅動的結腸TLS形成、腫瘤的免疫浸潤和控制腫瘤生長所必需的。所有數(shù)據(jù)表明,在CRC動物模型中,Hhep特異性Tfh細胞足以驅動TLS形成、增加免疫浸潤并導致腫瘤減少或清除。癌癥基因組圖譜 (TCGA) 數(shù)據(jù)庫中對CRC患者的分析表明,豐富的Tfh細胞特征通常存在于處于較低腫瘤階段的患者體內,并且還與更長的無進展生存期相關,因此,在小鼠和人類患者中,Tfh細胞和TLS的存在與更好地控制CRC相關。


圖5 Tfh細胞是Hhep菌介導的腫瘤控制和免疫浸潤所必需的

小編小結
綜上,本文利用最新的單細胞轉錄組技術聯(lián)合腸道微生物測序技術,揭示了肝螺桿菌增強了適應性免疫反應,并促使輔助T細胞和產(chǎn)生抗體的B細胞的選擇性激活,小鼠結腸腫瘤縮小,延長了小鼠的生存周期。這項開創(chuàng)性研究為利用腸道微生物群治療(對常規(guī)藥物和免疫療法耐藥的)結直腸癌腫瘤提供了強有力的證據(jù)。

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