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簡化微生物實驗室的MALDI工作流程

瀏覽次數(shù):2770 發(fā)布日期:2020-12-16  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)
簡化微生物實驗室的MALDI工作流程
 
作者:Markus Meyer,布魯克微生物學(xué)與診斷學(xué)
 
基質(zhì)輔助激光解吸/電離飛行時間質(zhì)譜(MALDI-TOF MS)作為微生物鑒定技術(shù),應(yīng)用已有十多年了,傳統(tǒng)生化方法需要數(shù)天時間才能得出結(jié)果,而且往往缺乏特異性,而MALDI-TOF 質(zhì)譜儀則克服了上述局限性。MALDI作為一種用于質(zhì)譜(MS)的軟電離方法,可實現(xiàn)對生物分子(如DNA、核糖體蛋白質(zhì)、肽和糖)以及有機大分子(如聚合物和其它大分子)的分析。MALDI-TOF質(zhì)譜儀也因此成為當(dāng)今最先進的利用蛋白質(zhì)組指紋技術(shù)鑒定細(xì)菌、酵母和真菌的技術(shù)。

快速準(zhǔn)確的分析、便捷的樣品制備以及簡便的結(jié)果生成,使得MALDI-TOF質(zhì)譜儀非常適合于常規(guī)的和高通量的微生物鑒定。為此,微生物樣品點在MALDI-TOF質(zhì)譜儀靶板上的點位,并在分析前以特定的MALDI基質(zhì)覆蓋,隨后將所獲得的質(zhì)譜圖譜與參考譜庫進行匹配。MALDI-TOF 質(zhì)譜儀靶板通常采用金屬、塑料或陶瓷,可將MALDI-TOF 質(zhì)譜樣品點在單個點位上用于分析。MALDI-TOF 質(zhì)譜儀靶板主要有兩種類型,即一次性靶板和可重復(fù)使用靶板。其關(guān)鍵的區(qū)別在于,可重復(fù)使用靶板需要在每次試驗之間進行徹底的清潔和檢查,而一次性靶板則即時可用。本文將討論一次性靶板在經(jīng)濟、方便的微生物鑒定工作流程中的優(yōu)勢。
 
快速、穩(wěn)定的工作流程
在中、高通量實驗室(例如在制藥或食品工業(yè))中,快速微生物鑒定是質(zhì)量控制(QC)和及時交付所必需的,因此,高效、方便、快捷的工作流程至關(guān)重要。此外,在受到高度管制的行業(yè)(如制藥行業(yè)),QC方法必須通過實驗室驗證。可重復(fù)使用的MALDI鋼質(zhì)靶板由微生物實驗室負(fù)責(zé),因為它們需要一個必須經(jīng)常被記錄的額外清潔步驟,作為遵循清潔程序的審查證據(jù)。然而,使用一次性靶板可直接支持規(guī)定環(huán)境下的工作流程,如ISO 15189。

一次性靶板可減輕清潔程序驗證的負(fù)擔(dān),降低先前樣本的污染和記憶效應(yīng)的風(fēng)險。因此,當(dāng)使用一次性MALDI靶板時,基于MALDI的工作流中有關(guān)質(zhì)量管理(Quality Management, QM)的部分變得更加簡便,并能為管理和實驗室團隊節(jié)省時間,更能專注于其核心任務(wù)。

此外,這種即時可用的概念在需要檢測緊急樣品的情況下尤其有利;例如,在食品工業(yè)中,要求快速識別微生物污染,以決定是否召回或保留市場上的產(chǎn)品。

除了可重復(fù)使用靶板所需的額外清潔步驟外,一次性和可重復(fù)使用MALDI-TOF 質(zhì)譜儀靶板的工作流是相同的,這使得在保持鑒定程序不變的情況下進行靶板切換變得簡單。此外,一次性靶板能提供與可重復(fù)使用靶板相同的性能表現(xiàn)。

在MALDI-TOF質(zhì)譜儀市場上,有一系列不同尺寸和材質(zhì)的一次性MALDI靶板供應(yīng)。影響MALDI-TOF 質(zhì)譜儀微生物鑒定的穩(wěn)定性的重要因素之一,靶板表面的平整度。某些材料,如塑料,更易受到表面微小變化的影響,這可能導(dǎo)致譜圖中的質(zhì)量偏差,并需要額外的校準(zhǔn)孔。相反,構(gòu)建在陶瓷基底上的靶板(圖1),具有完美的平整表面,無需預(yù)先確定校準(zhǔn)位置,具有可在靶板上的任何位置應(yīng)用校準(zhǔn)物的靈活性,且整個一次性靶板都可以使用。在整個靶板上只需要一個校準(zhǔn)位置就可以獲得很好的質(zhì)量精度,這意味著有更多的點位可用于樣品檢測。此外,陶瓷材料非常堅固,因此,萬一靶板從實驗臺掉到地板上也不會斷裂。當(dāng)一次性靶板尚未完全點滿樣本時,使用單個靶板進行多次MALDI-TOF采集,在軟件和工作流程上并無限制。例如,用戶可以先僅點樣幾個樣本并完成MALDI運行,隨后可再回來使用該靶板的空余位置點上其它的樣本并做檢測。
 
1:陶瓷一次性MALDI-TOF 靶板。圖片來源:Bruker Daltonics

成本因素
雖然一次性MALDI-TOF質(zhì)譜儀靶板的前期成本可能稍高,但不存在使用或維護方面的隱藏成本。相比之下,對于可重復(fù)使用靶板,實驗室可能需要購買、儲存、使用并處置清潔程序所需的一系列有機化學(xué)品。除了所涉財務(wù)問題外,還需要額外考慮有機清潔溶劑,例如通風(fēng)柜的使用及其維護、工作人員的額外安全協(xié)議以及適當(dāng)?shù)奶幹么胧?br />
總之,在與可重復(fù)使用靶板進行直接成本比較時,需要考慮實驗室訂購、維護和處理此“日常運營”所需的全部時間。此外,有機溶劑的可用性和價格波動,也會給負(fù)責(zé)實驗室?guī)齑娴娜藛T帶來挑戰(zhàn),且有時很難預(yù)測未來的成本。
 
樣品制備
在高通量的實驗室里,微生物學(xué)家們可以通過使用一次性陶瓷靶板來節(jié)省等待液體樣本干燥的時間,在陶瓷靶板表面干燥要比在不銹鋼靶板表面快10%左右。
這些一次性靶板采用了旨在提供環(huán)繞親水性樣品位置或“錨點”的疏水表面的技術(shù)。這使得液體樣品能夠均勻地分布在靶點上,而不會在點位之間產(chǎn)生交叉污染(圖2)。避免靶板上各點位之間的交叉污染,是MALDI-TOF 質(zhì)譜儀微生物鑒定工作流程的關(guān)鍵。
這種技術(shù)特別適用于慢干的液體樣品的制備,這些樣品更容易在各點位之間流動并造成交叉污染。由于液滴在疏水邊緣停止擴散并停留在親水錨點上,因此用戶能更容易地將樣本點在靶點上,避免了液滴在靶點上流動的風(fēng)險。最后,對于需要添加更大體積(如3-5µl的樣本)的特殊樣品方案,錨定效應(yīng)使大體積液滴集中于各自的點位,而不存在交叉污染的風(fēng)險。
 
2:利用專利技術(shù)防止樣品在一次性陶瓷靶板上的點位之間流動。圖片來源:布魯克 道爾頓
 
流程簡便的關(guān)鍵
即時可用的功能和簡化的工作流程,能帶來節(jié)省時間的益處,使一次性MALDI-TOF 靶板成為了中、高通量微生物實驗室的便捷解決方案。為了提高效率和節(jié)省時間,一次性靶板可與現(xiàn)成的細(xì)菌試驗標(biāo)準(zhǔn)品(BTS)及預(yù)配制的HCCA(α-氰基-4-羥基肉桂酸)基質(zhì)一起使用,以實現(xiàn)簡單、安全、快速和準(zhǔn)確的微生物鑒定。
 
 
 
 
來源:布魯克(北京)科技有限公司
聯(lián)系電話:010 58333000
E-mail:liyan.zheng@bruker.com

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