水德浮游生物大數(shù)據(jù)平臺(tái)
目前,絕大多數(shù)海洋和淡水生態(tài)領(lǐng)域的研究機(jī)構(gòu)和業(yè)務(wù)監(jiān)測(cè)單位,對(duì)浮游生物的研究手段還停留在人工鏡檢及手工測(cè)定的階段,這樣經(jīng)常導(dǎo)致操作過(guò)程繁瑣、工作量巨大、分析結(jié)果滯后,而且需要資深專業(yè)技術(shù)人員。
此平臺(tái)用于對(duì)浮游生物樣品進(jìn)行快速安全清洗、掃描成像、種類鑒定、數(shù)量統(tǒng)計(jì)、大小測(cè)量、生物量測(cè)定等工作,可以讓相關(guān)研究機(jī)構(gòu)和業(yè)務(wù)單位快速了解水域生態(tài)系統(tǒng)中的浮游生物在空間維度和時(shí)間維度上的分布和變化情況。
浮游生物大數(shù)據(jù)平臺(tái)主要包括以下四個(gè)組成部分:ZooSCAN浮游動(dòng)物圖像掃描分析系統(tǒng)
(含專用電腦和ZooProcess軟件)、浮游生物甲醛快速清洗裝置、EcoTaxa云端大數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)及國(guó)內(nèi)云服務(wù)器。
一、ZooSCAN浮游動(dòng)物圖像掃描分析系統(tǒng)
ZooSCAN浮游動(dòng)物圖像掃描分析系統(tǒng)是該平臺(tái)中的硬件部分,它主要用于對(duì)浮游動(dòng)物樣品掃描,形成數(shù)字化的圖像。其自帶的軟件ZooProcess會(huì)以標(biāo)準(zhǔn)化的程序處理原始圖像并對(duì)不同個(gè)體的形態(tài)參數(shù)進(jìn)行自動(dòng)測(cè)量及計(jì)數(shù)。
ZooSCAN工作流程:
1)掃描空白背景;2)掃描樣品,獲得原始圖片和元數(shù)據(jù)信息;3)使用ZooProcess軟件,標(biāo)準(zhǔn)化原始圖片,提取并測(cè)量圖片中不同個(gè)體的形態(tài)參數(shù);4)通過(guò)對(duì)形態(tài)學(xué)參數(shù)的提取與分析,可進(jìn)一步獲得樣品的粒徑組成、生物學(xué)體積等信息(由EcoTaxa完成)。
ZooSCAN掃描結(jié)果:
ZooSCAN掃描得到的浮游動(dòng)物圖片
測(cè)得的浮游動(dòng)物形態(tài)學(xué)參數(shù)
ZooSCAN 規(guī)格:
- 型號(hào):ZSCA04
- 規(guī)格 (LxWxH):60 x 54 x 36 cm (關(guān)上蓋子)
- 質(zhì)量:25 Kg
- 輸入電壓:110 to 230 VAC, 50 to 60 Hz
- 接口:USB 2.0
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二、浮游生物甲醛快速清洗裝置
甲醛快速清洗裝置是一套專業(yè)的工具,專門用來(lái)清洗使用福爾馬林保存的浮游生物樣品中的甲醛成分,跟傳統(tǒng)清洗方法相比,此裝置更加安全、快速、高效。
甲醛快速清洗裝置采用AISI 316不銹鋼制成,配6個(gè)相互獨(dú)立的圓柱形清洗器,每個(gè)清洗器容積約2L,可單獨(dú)拆卸。每個(gè)清洗器配有1個(gè)獨(dú)立開(kāi)關(guān),可單獨(dú)控制水流出入。
每個(gè)清洗器側(cè)面有一個(gè)矩形小孔,裝有500μm(可定制,最小20μm)孔徑的不銹鋼網(wǎng)篩。每個(gè)清洗器有1個(gè)手柄,保證使用時(shí)的方便和安全。
頂部是1個(gè)焊接上的圓環(huán),直徑180mm,圓環(huán)上安裝了一個(gè)網(wǎng)目500μm的不銹鋼篩網(wǎng)。底部直徑10mm,有3個(gè)直徑3mm的圓孔,圓孔上裝有網(wǎng)目500μm的不銹鋼篩網(wǎng)。清洗器通過(guò)1個(gè)閥門連接在2mm的AISI 316不銹鋼架上。一個(gè)進(jìn)水接頭,一個(gè)出水接頭。
三、EcoTaxa云端大數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)
EcoTaxa云端大數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)是一個(gè)浮游生物數(shù)據(jù)庫(kù)共享平臺(tái),主要致力于對(duì)浮游生物圖片進(jìn)行高效地自動(dòng)鑒定、分類和統(tǒng)計(jì)。它的數(shù)據(jù)庫(kù)完全獨(dú)立,專門為中國(guó)用戶建立,使用者可以在該網(wǎng)站上瀏覽、上傳浮游生物圖片或創(chuàng)建浮游生物數(shù)據(jù)庫(kù)。其分類速度快、數(shù)據(jù)保有量大、系統(tǒng)樹(shù)完整,因此受到了廣大浮游生物分類學(xué)專家們的青睞。
EcoTaxa云端大數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)主界面
EcoTaxa云端大數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)通常配合ZooSCAN一起使用。將通過(guò)ZooSCAN獲得的浮游生物圖片和相關(guān)信息上傳到EcoTaxa后,用戶可以利用網(wǎng)站上已有的或自己新創(chuàng)建的數(shù)據(jù)庫(kù)快速對(duì)圖片中的浮游生物種類進(jìn)行自動(dòng)鑒定、分類,再?gòu)腅coTaxa中將鑒定的結(jié)果導(dǎo)出,用于統(tǒng)計(jì)該批浮游生物具體的分類學(xué)數(shù)據(jù)。這樣大大地提高了物種分類的效率,能夠幫助用戶們節(jié)省寶貴的科研時(shí)間。此外,數(shù)字化的圖片及分類保存形式,方便使用者日后對(duì)項(xiàng)目進(jìn)行檢索、調(diào)用。
EcoTaxa云端大數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)檢索界面
EcoTaxa云端大數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)項(xiàng)目分類界面
EcoTaxa云端大數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)導(dǎo)出鑒定結(jié)果
EcoTaxa云端大數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)數(shù)據(jù)處理速度更加快速、界面簡(jiǎn)潔、易于操作且功能強(qiáng)大,定能協(xié)助浮游生物研究人員取得更加豐碩的科研成果。同時(shí),幫助國(guó)內(nèi)水域生態(tài)監(jiān)測(cè)單位,快速獲得浮游生物數(shù)據(jù),通過(guò)研究浮游生物的生物量變化來(lái)及時(shí)的了解對(duì)應(yīng)水域生態(tài)環(huán)境的變化情況。
水德浮游生物大數(shù)據(jù)平臺(tái)的特性:
- 應(yīng)用(專):專門用于浮游生物研究
- 功能(強(qiáng)):自動(dòng)對(duì)浮游生物鑒定、分類、計(jì)數(shù)、計(jì)算生物量
- 效率(高):快速批量分析大量浮游生物樣品
- 信息量(大):經(jīng)緯度、采樣深度、網(wǎng)型、網(wǎng)口面積等
- 照明系統(tǒng)(優(yōu)):確保圖像質(zhì)量和對(duì)比度最佳
- 圖像解析度(高):最高可達(dá)4800dpi
- 圖像分辨率(高):14150 x 22640 (3.2億像素,1GB)
- 數(shù)據(jù)分析緯度(大):空間維度和時(shí)間維度
- 深度學(xué)習(xí)能力(強(qiáng)):隨著數(shù)據(jù)量的增加,圖像識(shí)別率會(huì)逐步提升
水德浮游生物大數(shù)據(jù)平臺(tái)的應(yīng)用:
- 浮游生物自動(dòng)鑒定、計(jì)數(shù)、分類
- 水域生物量計(jì)算分析
- 水域生態(tài)災(zāi)害應(yīng)急監(jiān)測(cè)
- 水域生態(tài)數(shù)據(jù)統(tǒng)一管理
- 特定水域生態(tài)系統(tǒng)演變監(jiān)測(cè)和預(yù)測(cè)
- 不同水域生態(tài)系統(tǒng)關(guān)系分析
- 漁業(yè)資源評(píng)估和預(yù)測(cè)
水德浮游生物大數(shù)據(jù)平臺(tái)能夠高效地幫助用戶處理和分析大批量的浮游生物樣品,并快速獲得用戶需要的浮游生物分類學(xué)信息以及浮游生物時(shí)空分布信息,為科研人員的學(xué)術(shù)研究和政府部門的決策提供快速、全面的數(shù)據(jù)支撐。