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                                                              English | 中文版 | 手機版 企業(yè)登錄 | 個人登錄 | 郵件訂閱
                                                              當(dāng)前位置 > 首頁 > 技術(shù)文章 > 一文攬盡:熒光定量PCR擴增曲線哪個階段最重要

                                                              一文攬盡:熒光定量PCR擴增曲線哪個階段最重要

                                                              瀏覽次數(shù):6664 發(fā)布日期:2021-11-17  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負

                                                              qPCR擴增曲線一般分成四個階段:基線期、指數(shù)期、線性期和平臺期。那么每個階段PCR產(chǎn)物量的變化都有什么區(qū)別呢?哪個階段最重要呢?小編這就一一道來。

                                                              基線期

                                                              PCR起始時,剛開始前幾個循環(huán)的熒光信號還沒有發(fā)生變化,接近一條直線,將其稱之為基線,一般是3-15個循環(huán)。在基線期內(nèi),擴增的熒光信號被背景熒光信號所掩蓋,無法判斷PCR產(chǎn)物量的變化。

                                                              指數(shù)期

                                                              擴增的熒光信號高于背景熒光信號,擴增曲線起峰,開始進入指數(shù)期。在指數(shù)期內(nèi),每個循環(huán)積聚的產(chǎn)物準確加倍(假定100%反應(yīng)效率)。該階段的PCR反應(yīng)具有高度特異性和精確度。因為所有試劑均充足,反應(yīng)的動力學(xué)推動反應(yīng)有利于擴增子加倍,所以產(chǎn)物出現(xiàn)指數(shù)級擴增。只有在這個階段,Cq值與初始模板量的對數(shù)之間存在線性關(guān)系,所以在此階段進行定量分析最合適。

                                                              線性期(高變異性)

                                                              隨著PCR反應(yīng)體系各成分的消耗,其中的一種或者多種成分限制反應(yīng),導(dǎo)致反應(yīng)開始減緩,并且每個循環(huán)的PCR產(chǎn)物不再加倍,該階段不再是指數(shù)級擴增。

                                                              平臺期

                                                              反應(yīng)停止,不再產(chǎn)生更多產(chǎn)物,并且如果放置時間夠長,PCR產(chǎn)物將開始降解。因為每個樣品具有不同的反應(yīng)動力學(xué),所以每支試管或每個反應(yīng)將在不同的時間點進入平臺期,最終的產(chǎn)物含量也各不相同。

                                                              由于線性期和平臺期的擴增產(chǎn)物已不再呈指數(shù)級的增加,PCR的產(chǎn)物量與初始模板量之間沒有線性關(guān)系,所以也不能通過這兩個階段的PCR產(chǎn)物量計算出初始模板量。想要知道初始模板量的多少,還要依賴指數(shù)期的Cq值進行計算。

                                                              ▲ 圖1. qPCR 反應(yīng)的重要階段
                                                               

                                                              如圖所示,標準的擴增曲線是呈現(xiàn)S型的。曲線是否符合標準,不僅跟樣本起始量、qPCR體系配制、反應(yīng)程序等相關(guān),更依賴于一套高品質(zhì)的實時熒光定量PCR系統(tǒng)。對于實時熒光定量PCR系統(tǒng)來說,高度檢測靈敏度、高度重復(fù)性和高度穩(wěn)定性,是每一臺qPCR儀的追求。

                                                              高性能的Azure Cielo™實時熒光定量PCR系統(tǒng)完全符合以上要求,該系統(tǒng)來自美國Azure Biosystems公司,融合了高品質(zhì)的帕爾特溫度模塊和基于光纖傳輸?shù)墓鈱W(xué)檢測系統(tǒng),為您的科學(xué)研究提供高精準、高靈敏可靠結(jié)果。提供Azure Cielo-3通道和Azure Cielo-6通道,可根據(jù)實驗需求靈活配置。

                                                              同時配有10.3”觸控系統(tǒng),主機本身可獨立運行、連接、遠程交互,讓您隨時隨地知悉實驗進程和及時獲得實驗結(jié)果。

                                                              ▲ 圖2. Azure Cielo™ 實時熒光定量PCR系統(tǒng)

                                                              高度的靈敏度

                                                              使用探針法,同時在Azure Cielo™實時熒光定量PCR系統(tǒng)和其他品牌產(chǎn)品上檢測GAPDH基因,結(jié)果表明:A)Azure Cielo™實時熒光定量PCR系統(tǒng)對單拷貝基因的檢出率更高。B)Azure Cielo™實時熒光定量PCR系統(tǒng)的Cq平均值要低于2個Cq。

                                                              ▲ 圖3. 單拷貝基因檢測對比(n=96)

                                                              高度的重復(fù)性

                                                              源于優(yōu)異的孔間均一性。105拷貝數(shù)GAPDH模板,GAPDH引物擴增,96孔重復(fù)結(jié)果。Cq平均值=19.1,變異系數(shù)(Cv)=0.002。

                                                              ▲ 圖4. 96孔重復(fù)擴增曲線   A)線性圖  B)對數(shù)圖

                                                              高度的穩(wěn)定性

                                                              穩(wěn)定可靠的溫度模塊和光學(xué)系統(tǒng),確保儀器連續(xù)運行1000輪qPCR實驗,數(shù)據(jù)依然穩(wěn)定可靠,重復(fù)性高度一致。對GAPDH進行檢測并連續(xù)計算Cq值得出平均值和Cq值的標準偏差。Cq值=22.4+0.01。

                                                              ▲ 圖5. 長時間連續(xù)工作數(shù)據(jù)穩(wěn)定

                                                              發(fā)布者:艾普拜生物科技(蘇州)有限公司
                                                              聯(lián)系電話:0512--86860010
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