根據(jù)世界衛(wèi)生組織發(fā)布的數(shù)據(jù)，心血管疾病一直是人類健康的“第一殺手”，但是相比于各種惡性腫瘤，這個(gè)“殺手”在科研領(lǐng)域卻低調(diào)很多。究其原因，沒(méi)有細(xì)胞模型，動(dòng)物模型并不能完美的模擬心血管疾病發(fā)生發(fā)展的過(guò)程等等，都導(dǎo)致了心血管疾病的基礎(chǔ)科研相對(duì)薄弱。但是對(duì)于臨床醫(yī)生，除去關(guān)心機(jī)制，我們更應(yīng)該通過(guò)科研去解決臨床問(wèn)題！

不同于基因組和轉(zhuǎn)錄組的不確定性，蛋白質(zhì)組學(xué)由于其直觀、穩(wěn)定的特性在非腫瘤領(lǐng)域的科研中扮演了非常重要的角色。心臟系統(tǒng)的功能改變尤其依賴蛋白質(zhì)的改變，因此通過(guò)蛋白質(zhì)組學(xué)探究組織或者體液水平的蛋白改能夠更加深入的探索心臟疾病的發(fā)病機(jī)制，并可以對(duì)診斷、治療指導(dǎo)和預(yù)后提供更好的Biomarker。

下面我們簡(jiǎn)單分析幾篇文獻(xiàn)，來(lái)看一下在心臟領(lǐng)域怎樣使用蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)做科研！

Case 1

樣本：血漿  疾病：肥厚型心肌病  IF:1.618 Physiol Res 

 

本文思路清晰簡(jiǎn)明，使用正常人46例、肥厚型心肌病47例、擴(kuò)張性心肌�。―CM）21例、冠心�。–AD）20例、主動(dòng)脈狹窄（AS）24例和高血壓（AH）20例的血清樣本進(jìn)行Itraq蛋白質(zhì)組學(xué)比對(duì)。通過(guò)2v4v2v2v2v2分組比較，共鑒定到476個(gè)蛋白質(zhì)，共128個(gè)血漿蛋白與心臟病變有關(guān)，其中49個(gè)是沒(méi)有報(bào)道過(guò)的新蛋白質(zhì)。

 

 

通過(guò)生物信息學(xué)分析，作者發(fā)現(xiàn)跟每心血管疾病相關(guān)的一些廣譜蛋白，而這些蛋白都可以作為潛在的診斷方向的biomarker。另外，通過(guò)統(tǒng)計(jì)建模的方法，作者還將幾種疾病大致分為兩類病理生理學(xué)過(guò)程。

 

文章思路：iTraq+生信分析

Case 2

樣本：組織  疾病：胸主動(dòng)脈夾層  IF:2.803 Eur J Cardio-Thorac

這篇文章主要通過(guò)1V1的iTraq尋找到36個(gè)主動(dòng)脈夾層病人（13例）和正常人（13例）之間差異表達(dá)的蛋白。

 

通過(guò)western blotting驗(yàn)證，fibrillin-1, emilin-1, decorin, protein DJ-1 和histone H4表達(dá)有顯著差異。富集分析顯示，細(xì)胞粘附、細(xì)胞外基質(zhì)互作、蛋白質(zhì)水解、細(xì)胞外基質(zhì)重組和白介素6信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)等是在主動(dòng)脈夾層中被顯著影響的蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)。另外，作者還通過(guò)數(shù)據(jù)分析預(yù)測(cè) TGF-β和損傷主動(dòng)脈壁修復(fù)可能是主動(dòng)脈夾層潛在的分子病理機(jī)制

文章思路：iTraq+生信分析+ WB驗(yàn)證差異蛋白

Case 3

樣本：血清  疾病：先天心臟缺陷  IF:5.228 Sci Reports 

 

這篇文章之所以分?jǐn)?shù)較前兩篇高的原因之一是分組比較復(fù)雜，涉及到正常人（10例）、法洛四聯(lián)癥（TOF）10例、室中隔缺損（VSD）10例、永存動(dòng)脈干（PTA）10例）和混合型10例。通過(guò)高通量Itraq技術(shù)共鑒定到606個(gè)蛋白，其中差異表達(dá)蛋白47個(gè)。

 

 

在靶標(biāo)蛋白中挑選11個(gè)進(jìn)行MRM質(zhì)譜鑒定，最終挑出的biomarker再進(jìn)行進(jìn)一步的Elisa驗(yàn)證。

 

 

最終這篇文章非常成功地確定了由四個(gè)細(xì)胞支架蛋白組成的一個(gè)檢測(cè)panel。這個(gè)方法可以在早期通過(guò)血液活檢判斷病人情況，在疾病惡化之前進(jìn)行早期臨床干預(yù)，有望有效提高病人生存率。

文章思路：iTraq+ELISA+WB+IHC+生物信息學(xué)

對(duì)比以上文章，我們不難發(fā)現(xiàn)在臨床科研方面，iTraq等蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)性價(jià)比非常之高。只需要簡(jiǎn)單的對(duì)臨床樣本進(jìn)行高通量篩選，即可得到大量準(zhǔn)確的陽(yáng)性結(jié)果。所以想要多快好省的做臨床科研、發(fā)文章，兩個(gè)部分很重要：1，臨床樣本；2，蛋白質(zhì)組學(xué)！換句話說(shuō)，只要手頭有臨床樣本，無(wú)論任何形式、無(wú)論是血液還是組織、甚至是尿液，都可以來(lái)做基于蛋白質(zhì)組學(xué)的科研！

可以說(shuō)，蛋白質(zhì)組學(xué)為非腫瘤科室開(kāi)拓了新的科研思路，只要您有樣本，吉?jiǎng)P蛋白質(zhì)平臺(tái)幫您完成科研轉(zhuǎn)化！

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