差示掃描熒光法DSF的介紹及其在蛋白質(zhì)穩(wěn)定性篩選等方面的應(yīng)用
瀏覽次數(shù):53 發(fā)布日期:2025-1-22
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前言
蛋白質(zhì)涉及生理的方方面面,要正確地發(fā)揮其作用,它們需要以特定的方式折疊。這些大分子的結(jié)構(gòu)和穩(wěn)定性是保持其活性和功能的重要因素。保持蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定狀態(tài)對于藥物開發(fā)、給藥和基礎(chǔ)研究至關(guān)重要。蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性與環(huán)境條件和緩沖液配方直接相關(guān),不同蛋白質(zhì)的環(huán)境條件和緩沖液配方各不相同。這些因素與蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和氨基酸序列有關(guān),決定了蛋白質(zhì)的緊密程度以及等電點(diǎn)(pI)等。此后,這些參數(shù)通過定義最佳pH值、離子和溫度來確定最佳儲(chǔ)存條件。
應(yīng)研究蛋白質(zhì)在不同條件和不同添加劑下的結(jié)構(gòu),以便深入了解其功能并優(yōu)化條件。這對生物制劑尤為重要。蛋白質(zhì)工程有助于蛋白質(zhì)治療,根據(jù)分子類型進(jìn)行分類,其中規(guī)模最大、增長最快的是抗體藥物。在這一類蛋白質(zhì)中,單克隆抗體(mAbs)正受到各大制藥和生物技術(shù)公司的關(guān)注。大多數(shù)mAb多肽鏈可以折疊成特定形狀,這對蛋白質(zhì)的功能性和穩(wěn)定性至關(guān)重要。保持和提供形狀正確的mAb是制藥研發(fā)部門的主要重點(diǎn)之一,這不僅與蛋白質(zhì)的穩(wěn)定性有關(guān),還與蛋白質(zhì)的聚集傾向有關(guān)。
差示掃描熒光法(DSF)介紹
差示掃描熒光法(Differential Scanning Fluorimetry,DSF),又稱熱遷移分析(Thermal Shift Assay,TSA)或ThermoFluor,是一種成本效益高、可并行化、實(shí)用且易于使用的生物物理技術(shù)(圖1)。因此,它被廣泛用作跟蹤蛋白質(zhì)折疊狀態(tài)和穩(wěn)定性以及相互作用等研究。傳統(tǒng)的DSF使用實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀,通過測量優(yōu)先與未折疊蛋白質(zhì)結(jié)合的染料(如SYPRO Orange,它與蛋白質(zhì)因折疊而暴露的疏水區(qū)域結(jié)合)的熒光變化來監(jiān)測熱誘導(dǎo)的蛋白質(zhì)變性。該實(shí)驗(yàn)也被稱為蛋白質(zhì)熱遷移分析,因?yàn)樵诩尤敕(wěn)定或不穩(wěn)定的結(jié)合配體或緩沖成分后,可以測量表觀熔解溫度(Tm)的變化。在有特定化合物或配體結(jié)合的情況下,蛋白穩(wěn)定性的上升,表現(xiàn)為熔解溫度的上升。
圖1:使用外部熒光染料的典型蛋白質(zhì)熱穩(wěn)定性分析數(shù)據(jù)。(A) 溫度的升高將蛋白質(zhì)推向未折疊狀態(tài),50%的蛋白質(zhì)樣品處于折疊狀態(tài)和50%處于未折疊狀態(tài)的溫度被定義為熔解溫度(Tm),對應(yīng)的熒光強(qiáng)度達(dá)到最大熒光值的一半;隨著溫度進(jìn)一步升高,蛋白質(zhì)最終聚集而使染料解離,熒光強(qiáng)度降低。(B) 為提高可視化程度,還可將數(shù)據(jù)繪制成熒光曲線(dF/dT)與溫度的對比斜率圖。Tm顯示為一個(gè)峰值,ΔTm可以通過配體結(jié)合蛋白(紅色)和非結(jié)合蛋白(黑色)的峰值之間的距離得到。
與大多數(shù)其他方法相比,DSF的速度很快(20-120分鐘)。它還可用于多種用途,例如,確定純化重組蛋白的穩(wěn)定條件、添加劑和小分子配體以及輔助因子。收集到的數(shù)據(jù)可直接用于研究蛋白質(zhì)的特性,也可用于指示有利的結(jié)晶或儲(chǔ)存條件,或幫助確定功能。DSF的高通量特性允許通過對各種溶液條件(如緩沖液特性、溶液pH值和離子強(qiáng)度)進(jìn)行稀疏基質(zhì)篩選,快速發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)穩(wěn)定溶液。通常,DSF檢測在96孔板或384孔板中以20 µL的體積進(jìn)行,最終體積中含有5-10 µM的蛋白質(zhì)。鑒于這些優(yōu)點(diǎn),DSF被廣泛應(yīng)用于學(xué)術(shù)界、政府和工業(yè)界的實(shí)驗(yàn)室。
差示掃描熒光法(DSF)應(yīng)用
蛋白質(zhì)穩(wěn)定性篩選
▪ 改進(jìn)蛋白質(zhì)預(yù)處理(緩沖液pH值、鹽、輔料、添加劑)
▪ 分析結(jié)晶條件
▪ 蛋白質(zhì)配方和儲(chǔ)存緩沖液優(yōu)化
▪ 突變或修飾對蛋白質(zhì)穩(wěn)定性的影響
▪ 蛋白質(zhì)制備質(zhì)量控制(是否存在雜質(zhì)或聚集蛋白質(zhì))
高通量配體篩選
▪ 小分子和片段庫篩選
▪ 抗體-靶標(biāo)特異性
▪ 蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用
▪ 抑制劑結(jié)合
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