Plant Phenomics 綜述 | 植物壓力檢測中成像傳感器和人工智能的進(jìn)展
精準(zhǔn)表型學(xué)對于植物育種以及理解環(huán)境對植物生長和產(chǎn)量的影響至關(guān)重要。隨著世界人口的增長,農(nóng)作物的產(chǎn)量提升和可持續(xù)生產(chǎn)已成為一個嚴(yán)峻的挑戰(zhàn)。作物環(huán)境所面臨的壓力會對其生長、發(fā)育產(chǎn)生不利影響,對農(nóng)作物生產(chǎn)構(gòu)成了的重大威脅,因此早期檢測和準(zhǔn)確診斷是有效管理和預(yù)防的關(guān)鍵。最新的人工智能(Artificial Intelligence, AI)和成像傳感器技術(shù)顯示出了準(zhǔn)確識別和預(yù)測植物壓力癥狀的潛力。通過將AI算法與成像傳感器結(jié)合使用,可以克服傳統(tǒng)方法的局限性,如耗時、昂貴且容易受主觀影響。這種整合使得能夠快速和客觀地分析植物圖像,促進(jìn)了植物壓力癥狀的早期識別,甚至在肉眼可見癥狀出現(xiàn)之前。這種能力使農(nóng)民能夠迅速有效地應(yīng)對,從而減少作物損失,提高農(nóng)業(yè)生產(chǎn)力。
2024年3月,Plant Phenomics 在線發(fā)表了University College Dublin題為Advancements in Imaging Sensors and AI for Plant Stress Detection: A Systematic Literature Review 的綜述文章。
成像傳感器在早期壓力識別中發(fā)揮著關(guān)鍵作用,因?yàn)樗鼈兛梢钥焖、無損地捕捉植物表型特征的微小變化。在各種成像傳感器中, RGB傳感器已被廣泛運(yùn)用于植物表型研究中。這些傳感器捕捉植物反射的可見光譜,提供紅、綠和藍(lán)光的信息。此外,光譜成像提供了更詳細(xì)的關(guān)于生物和非生物壓力引起的生化和生理變化的見解。通過在多個波長處捕獲圖像,RGB和光譜傳感器可以識別植物組織中的變化,這些變化可能肉眼無法辨別。雖然AI和成像傳感器取得了識別植物壓力的進(jìn)展,但仍然面臨著諸多挑戰(zhàn),如波動的環(huán)境條件和不同的植物反應(yīng)對準(zhǔn)確診斷和分類應(yīng)激或傷害癥狀構(gòu)成困難。解決這些挑戰(zhàn)將為基于AI的植物表型學(xué)的發(fā)展提供更多可能性,進(jìn)而促進(jìn)更可持續(xù)和有韌性的農(nóng)業(yè)實(shí)踐,滿足全球不斷增長的食品需求。
本文進(jìn)行了一項(xiàng)系統(tǒng)文獻(xiàn)綜述(Systematic Literature Review, SLR),著重審查了植物成像和人工智能在識別壓力反應(yīng)方面的應(yīng)用,采用了一系列特定關(guān)鍵詞進(jìn)行了廣泛的檢索,包括非生物性壓力、生物性壓力、機(jī)器學(xué)習(xí)、植物成像和深度學(xué)習(xí)等。與此同時,本文利用可編程機(jī)器人檢索了自2006年以來發(fā)表的相關(guān)論文,并從4個主要數(shù)據(jù)庫(Springer、ScienceDirect、PubMed和Web of Science)中收集了共計(jì)2,704篇論文。為了繞過搜索引擎的限制,本研究選擇了OneSearch這一綜合平臺來統(tǒng)一檢索關(guān)鍵詞,在仔細(xì)審閱了262項(xiàng)研究后,總結(jié)出了AI算法和成像傳感器的主要趨勢。另外本研究還發(fā)現(xiàn)開源成像倉庫的增加極大地推動了植物研究向深度學(xué)習(xí)的轉(zhuǎn)變,這也需要大量的數(shù)據(jù)集來訓(xùn)練AI模型對壓力癥狀進(jìn)行解讀。本文展示了目前在AI應(yīng)用算法方面的最新趨勢,以便開發(fā)出更加有效的植物壓力檢測方法。
圖1 此系統(tǒng)文獻(xiàn)綜述(SLR)采用了三階段搜索策略。第一階段側(cè)重于初始范圍審查。第二階段側(cè)重于對結(jié)果研究的系統(tǒng)審查和收集。最后,第三階段側(cè)重于對主要研究群體的分析和審查。
論文鏈接:
https://spj.science.org/doi/10.34133/plantphenomics.0153
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https://spj.science.org/doi/10.34133/plantphenomics.0051
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About Plant Phenomics
《植物表型組學(xué)》(Plant Phenomics)是由南京農(nóng)業(yè)大學(xué)和美國科學(xué)促進(jìn)會(AAAS)合作創(chuàng)辦的英文學(xué)術(shù)期刊,于2019年1月正式上線發(fā)行。采用開放獲取形式,刊載植物表型組學(xué)交叉學(xué)科熱點(diǎn)領(lǐng)域具有突破性科研進(jìn)展的原創(chuàng)性研究論文、綜述、數(shù)據(jù)集和觀點(diǎn)。具體范圍涵蓋高通量表型分析的最新技術(shù),基于圖像分析和機(jī)器學(xué)習(xí)的表型分析研究,提取表型信息的新算法,作物栽培、植物育種和農(nóng)業(yè)實(shí)踐中的表型組學(xué)新應(yīng)用,與植物表型相結(jié)合的分子生物學(xué)、植物生理學(xué)、統(tǒng)計(jì)學(xué)、作物模型和其他組學(xué)研究,表型組學(xué)相關(guān)的植物生物學(xué)等。期刊已被DOAJ、Scopus、PMC、EI和SCIE等數(shù)據(jù)庫收錄?祁Nò睯CR2021影響因子為6.5,位于農(nóng)藝學(xué)、植物科學(xué)、遙感一區(qū)。2023年中科院期刊分區(qū)位于農(nóng)林科學(xué)大類一區(qū)。2020年入選中國科技期刊卓越行動計(jì)劃高起點(diǎn)新刊項(xiàng)目。
說明:本文由《植物表型組學(xué)》編輯部負(fù)責(zé)組稿。
中文內(nèi)容僅供參考,一切內(nèi)容以英文原版為準(zhǔn)。
撰稿:吳庚宸(南京農(nóng)業(yè)大學(xué))
排版:許怡瑤(南京農(nóng)業(yè)大學(xué))
審核:孔敏、王平