"SWATH" 是 "Sequential Window Acquisition of all Theoretical Mass Spectra" 的縮寫,它是一種質(zhì)譜技術(shù),常用于蛋白質(zhì)組學定量分析。今天小編就帶大家一起了解一下 SWATH 定量蛋白組學的基本原理和特點:
圖1. SWATH定量蛋白組學服務技術(shù)平臺
1、基本原理:
在 SWATH 分析中,質(zhì)譜儀連續(xù)地和自動地掃描一系列質(zhì)量窗口,覆蓋所有潛在的前體離子。這樣,理論上所有可能的離子都會被檢測到。與定性的數(shù)據(jù)依賴掃描 (DDA) 相比,SWATH 為數(shù)據(jù)獨立掃描 (DIA) 提供了更加系統(tǒng)的、無偏的數(shù)據(jù)收集方式。
2、定量特點:
SWATH 的特點是它可以在復雜樣本中進行多成分的高通量、高重復性和高精度的定量分析。這使得它特別適合于那些需要大規(guī)模樣本隊列比較的研究,例如生物標志物發(fā)現(xiàn)。
3、數(shù)據(jù)處理:
由于 SWATH 收集的數(shù)據(jù)是非常復雜的,它通常需要特定的軟件和算法進行數(shù)據(jù)提取和定量。這些軟件會使用預先獲取的蛋白質(zhì)/肽段的質(zhì)譜圖庫來輔助識別和定量。
4、應用領(lǐng)域:
SWATH 質(zhì)譜技術(shù)在各種生物研究中都有應用,包括生物標志物鑒定、通路分析、蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用研究等。
5、與其他技術(shù)的比較:
與傳統(tǒng)的數(shù)據(jù)依賴掃描 (DDA) 技術(shù)相比,SWATH 提供了更好的定量重復性和更廣的動態(tài)范圍。但由于其數(shù)據(jù)復雜性,數(shù)據(jù)分析可能會更加具有挑戰(zhàn)性。