SWATH (Sequential Window Acquisition of All Theoretical Mass Spectra) 和 DIA (Data-Independent Acquisition) 是兩種質(zhì)譜技術(shù),主要用于蛋白質(zhì)組學(xué)研究。它們都是數(shù)據(jù)獨(dú)立采集的策略,與傳統(tǒng)的數(shù)據(jù)依賴采集(DDA, Data-Dependent Acquisition)方式不同。
一、SWATH (Sequential Window Acquisition of All Theoretical Mass Spectra):
SWATH是SCIEX公司為其TripleTOF系列質(zhì)譜儀開發(fā)的DIA技術(shù)的一個(gè)商標(biāo)名稱。
在SWATH模式下,預(yù)設(shè)的質(zhì)荷比窗口會(huì)依次掃描整個(gè)質(zhì)譜范圍,捕獲所有離子的碎片信息。
通過這種方法,實(shí)驗(yàn)可以多次復(fù)現(xiàn),因?yàn)樗袧撛诘碾亩涡畔⒍急挥涗浵聛怼?/p>
二、DIA (Data-Independent Acquisition):
DIA是一個(gè)通用術(shù)語,描述的是一種不依賴于實(shí)時(shí)離子豐度決策的質(zhì)譜采集策略。
在DIA模式下,質(zhì)譜儀會(huì)在預(yù)設(shè)的質(zhì)荷比窗口范圍內(nèi)系統(tǒng)地捕獲所有的碎片離子,而不是基于其豐度選擇特定的前體離子進(jìn)行碎裂。
SWATH只是DIA策略的一個(gè)實(shí)例。
三、應(yīng)用與優(yōu)勢(shì):
DIA和SWATH提供了更全面的樣品覆蓋率,因?yàn)樗鼈儾灰蕾囉谇绑w離子的豐度進(jìn)行碎裂決策。
它們特別適用于定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究,因?yàn)椴东@的數(shù)據(jù)可以在不同的實(shí)驗(yàn)之間進(jìn)行比較。
與DDA相比,它們提供了更高的復(fù)現(xiàn)性。
圖1. 數(shù)據(jù)獨(dú)立采集定量蛋白組分析