生命的奧秘往往藏于微觀世界。蛋白質(zhì),作為生物體內(nèi)的工作機(jī)器,其序列與結(jié)構(gòu)的特征在很大程度上決定了其功能。因此,高精度鑒定蛋白質(zhì)的序列和結(jié)構(gòu),對(duì)于理解生命現(xiàn)象以及疾病的發(fā)生、發(fā)展具有至關(guān)重要的意義。近年來(lái),隨著高通量技術(shù)的發(fā)展,我們有了更多有效的工具來(lái)解析蛋白質(zhì)的這些特性。
一. 蛋白質(zhì)序列的鑒定
蛋白質(zhì)序列是由20種氨基酸以特定順序排列形成的。每種蛋白質(zhì)的序列都是由其編碼的基因決定的。鑒定蛋白質(zhì)序列的常用技術(shù)主要有以下幾種:
1.質(zhì)譜法
通過(guò)測(cè)定蛋白質(zhì)或多肽片段的質(zhì)量/電荷比(m/z)來(lái)確定蛋白質(zhì)序列。其中液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜(LC-MS/MS)是最常用的質(zhì)譜方法。通過(guò)酶解,蛋白質(zhì)被分解成多肽,然后通過(guò)質(zhì)譜獲取多肽的m/z,再通過(guò)數(shù)據(jù)庫(kù)匹配來(lái)鑒定蛋白質(zhì)序列
2.Edman降解法
通過(guò)逐步移除蛋白質(zhì)N端的氨基酸并進(jìn)行鑒定,可以獲得蛋白質(zhì)的氨基酸序列。然而,由于此方法只適用于較短的多肽,且步驟繁瑣,所以在實(shí)際應(yīng)用中有一定的局限性。
二、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的鑒定
蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)是其功能的物理基礎(chǔ),因此蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的鑒定對(duì)于理解蛋白質(zhì)的功能至關(guān)重要。常見(jiàn)的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)鑒定技術(shù)包括:
1.X射線晶體學(xué)
通過(guò)測(cè)定X射線通過(guò)蛋白質(zhì)晶體時(shí)的衍射模式,可以推導(dǎo)出蛋白質(zhì)的原子級(jí)別的結(jié)構(gòu)。這是目前最為常用且精確的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)鑒定方法。
2.核磁共振(NMR)
通過(guò)測(cè)定原子核在磁場(chǎng)中的共振信號(hào),可以獲取到蛋白質(zhì)在溶液中的動(dòng)態(tài)結(jié)構(gòu)信息。
3.冷凍電鏡(Cryo-EM)
通過(guò)在低溫下獲取蛋白質(zhì)復(fù)合物的電子微圖,并通過(guò)后續(xù)的圖像處理,可以重建出蛋白質(zhì)復(fù)合物的三維結(jié)構(gòu)。近年來(lái),隨著冷凍電鏡技術(shù)的飛速發(fā)展,其在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)鑒定中的應(yīng)用越來(lái)越廣泛。
高通量技術(shù)的發(fā)展讓我們有了越來(lái)越多的方法來(lái)鑒定蛋白質(zhì)的序列和結(jié)構(gòu),不僅提高了我們的研究效率,也加深了我們對(duì)生命過(guò)程的理解。在未來(lái),隨著科技的不斷進(jìn)步,我們將有可能解析出更多、更復(fù)雜的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu),揭示生命的更多奧秘。
圖1