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內(nèi)質(zhì)網(wǎng)自噬的發(fā)展歷程和主要調(diào)控途徑詳細(xì)介紹

瀏覽次數(shù):1372 發(fā)布日期:2023-12-25 
選擇性自噬:有目的的“吞噬”方式
 
自噬 (Autophagh),既 “自己吃自己”,是細(xì)胞應(yīng)對不良環(huán)境自發(fā)產(chǎn)生的一種保護(hù)機制 (根據(jù)細(xì)胞內(nèi)容物進(jìn)入溶酶體的不同方式,自噬可分為三大類:微自噬、分子伴侶介導(dǎo)的自噬 (CMA) 和巨自噬)[1]。自噬受一系列自噬相關(guān)基因 (ATG) 的調(diào)控,一般符合 “Cargo-ligand-receptor” 模式,主要分為 4 個過程:自噬的誘導(dǎo),自噬體形成,自噬體與溶酶體的融合,完成自噬。
自噬可以是非選擇性或選擇性的,選擇性自噬有目的吞噬不同底物:線粒體、過氧化物酶體、核糖體、內(nèi)質(zhì)網(wǎng) (ER)、溶酶體、細(xì)胞核、蛋白酶體和脂滴 (LD) (圖 1)[2]。
圖 1不同的選擇性的自噬途徑[3]
不同的選擇性自噬方式:線粒體自噬 (Mitophagy)、核糖體自噬 (Ribophagy) 以及異源自噬(Xenophagy) 等。
其中內(nèi)質(zhì)網(wǎng)自噬也被稱為網(wǎng)狀吞噬,2007 年 Sebastián Bernales 等人首次在電鏡下觀察到了含 ER 的自噬體 (ER containing autophagosomes, ERA)。在 2015 年,酵母中兩個新的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)自噬受體:Atg39 和 Atg40[3],和乳動物細(xì)胞中的首個內(nèi)質(zhì)網(wǎng)自噬受體:FAM134B 被發(fā)現(xiàn),該領(lǐng)域真正進(jìn)入了分子水平的研究[4]。同時,還發(fā)現(xiàn) ER-Phagy 與神經(jīng)退行性疾病、癌癥、代謝性疾病等人類疾病之間的有著密切關(guān)系,內(nèi)質(zhì)網(wǎng)自噬,值得被關(guān)注。

圖 2. 內(nèi)質(zhì)網(wǎng)自噬的發(fā)展歷程[2]

 
 
內(nèi)質(zhì)網(wǎng)自噬:ER 質(zhì)量控制的重要途徑
 

內(nèi)質(zhì)網(wǎng):維持細(xì)胞穩(wěn)態(tài)的重要細(xì)胞器

作為一種重要的連續(xù)膜細(xì)胞器,內(nèi)質(zhì)網(wǎng)由一系列與核膜相連的扁平囊組成,其質(zhì)量控制對維持細(xì)胞穩(wěn)態(tài)中起著重要作用。當(dāng)細(xì)胞暴露于不利的外部刺激 (基因突變、缺氧、營養(yǎng)缺乏和氧化應(yīng)激等條件) 時,會誘導(dǎo)內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激 (Endoplasmic reticulumstress, ERS) 的發(fā)生,導(dǎo)致未折疊和錯誤折疊的蛋白質(zhì)在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔中積累,從而激活未折疊蛋白反應(yīng) (Unfolded protein response, UPR) 抵御不利的外部環(huán)境[4]。 
 
 內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的質(zhì)量控制主要有兩條途徑介導(dǎo):泛素-蛋白酶體系統(tǒng) (該系統(tǒng)為“ER 相關(guān)蛋白降解” (ERAD) 途徑自噬-溶酶體系統(tǒng)。

ERAD 的底物僅限于蛋白質(zhì),而自噬-溶酶體系統(tǒng)能夠降解蛋白的物質(zhì)以及部分內(nèi)質(zhì)網(wǎng)。

 ER 應(yīng)激誘導(dǎo)的自噬有兩個主要功能:

1. ERA 形成后吞噬無法被其他途徑處理的多余 ER 或聚集蛋白
2. 當(dāng) ER 壓力消失時,將擴大的 ER 大小減小到正常水平 

 

■ 內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激下自噬的主要調(diào)控途徑

在 ERS 誘導(dǎo)的自噬過程中,UPR 通過相應(yīng)的 IRE1α、PERK,ATF6 和 Ca2+ 調(diào)控自噬的發(fā)生,其中關(guān)鍵的調(diào)節(jié)因子是C/EBP同源蛋白 (CHOP)[3]
圖 3. ERS 誘導(dǎo)的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)自噬[3]
  
腫瘤壞死因子受體相關(guān)因子2(TRAF2);Jun氨基末端激酶(JNK);激活細(xì)胞凋亡信號調(diào)節(jié)激酶(ASK);死亡相關(guān)蛋白激酶1(DAPK1);蛋白激酶C(PKC)和鈣/鈣調(diào)蛋白依賴性蛋白激酶II(CaMKII)。
 
IRE1α:IRE1α通路中 TRAF2 被激活,進(jìn)而下游細(xì)胞凋亡信號調(diào)節(jié)激酶 (ASK)/c-JNK 被激活,從而介導(dǎo)磷酸化 Bcl2,并破壞 Bcl2/Beclin1 間的相互作用,導(dǎo)致 Beclin1 的釋放,從而增強基礎(chǔ)自噬。IRE1α-TRAF2 通路還可以通過促進(jìn) ATG 復(fù)合物和 LC3 的形成來促進(jìn)自噬體膜的延伸和擴展[5][6]。 
PERK:UPR 的 PERK-eIF2α-ATF4 通路導(dǎo)致 Sestrin2 和 DDIT4 相關(guān)基因的表達(dá),抑制 mTORC1 活性,并誘導(dǎo)自噬。ER 中 Ca2+ 的釋放激活死亡相關(guān)蛋白激酶 1(DAPK1)、蛋白激酶 C (PKC)、鈣/鈣調(diào)蛋白依賴性蛋白激酶 II (CaMKII) 等相應(yīng)因子參與調(diào)控自噬。

 
內(nèi)質(zhì)網(wǎng)自噬,有何花樣? 
 

內(nèi)質(zhì)網(wǎng)自噬發(fā)生的關(guān)鍵 “守門人”:自噬受體

這里不得不先說關(guān)鍵選手,自噬受體 (ER-Phagy adaptor),為了確保選擇性自噬順利發(fā)生,貨物 (Cargos) 必須被自噬體膜上的蛋白質(zhì)識別,ERA 可以通過自噬受體直接連接到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)并降解過量的 ER。迄今為止,在哺乳動物和酵母中分別發(fā)現(xiàn)了FAM134B、RTN3L、CCPG1、SEC62、TEX264 和 ATL3 和 Atg39 和 Atg40 等自噬受體 (圖 4)[6]。

以上自噬受體的都是 ER 膜蛋白,它們在結(jié)構(gòu)、組織分布方面有所不同,可介導(dǎo)內(nèi)質(zhì)網(wǎng)不同區(qū)域的降解 (內(nèi)質(zhì)網(wǎng)由幾個子結(jié)構(gòu)域組成,如片內(nèi)質(zhì)網(wǎng)、管狀內(nèi)質(zhì)網(wǎng)、核膜和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)出口位點, 如 FAM134B 主要介導(dǎo)片內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的降解,而 RTN3L 和 ATL3 介導(dǎo)管狀內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的降解)。

圖 5. 不同的自噬受體[7]

這些受體它們都含有至少一個LC3/GABARAP 相互作用區(qū) (LIR;LC3-interacting region) 或 Atg8 相互作用基序);可以結(jié)合哺乳動物的自噬體 LC3/GABARAP 家族蛋白或酵母的Atg8家族蛋白;或者可與最上游的自噬起始復(fù)合物組分 (如 Atg1/ULK1) 相互作用。

內(nèi)質(zhì)網(wǎng)自噬的三大途徑

介紹完自噬的受體,就該介紹內(nèi)質(zhì)網(wǎng)自噬的途徑了,依據(jù)內(nèi)質(zhì)網(wǎng)結(jié)構(gòu),分為以下 3 大途徑:大 ER 自噬 (Macro-ER-phagy),微 ER 自噬 (Micro-ER-phagy) 和囊泡傳遞 (Vesicular delivery)

圖 5:內(nèi)質(zhì)網(wǎng)自噬的不同途徑[8]

 

Macro-ER-phagy:在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激的誘導(dǎo)下,內(nèi)質(zhì)網(wǎng)結(jié)構(gòu)被破壞,需要降解的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)成分被特定的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)自噬受體識別 “標(biāo)記”,并被 LC3/GABARAP/Atg8 識別,與 ER 連接的隔離膜組裝并擴展為吞噬細(xì)胞,然后吞噬細(xì)胞包裹 ER 片段并密封形成自噬體。隨后,自噬體與溶酶體融合形成哺乳動物細(xì)胞中的自噬溶酶體。最終,被自噬體吞噬的成分被溶酶體水解酶降解。

Micro-ER-phagy:微吞噬溶酶體膜內(nèi)陷并“擠壓”內(nèi)質(zhì)網(wǎng)進(jìn)入溶酶體腔。此外,溶酶體可以直接與內(nèi)質(zhì)網(wǎng)衍生的囊泡融合進(jìn)行降解 (“囊泡傳遞”)。

當(dāng)然內(nèi)質(zhì)網(wǎng)自噬的形成是一個復(fù)雜的過程,內(nèi)質(zhì)網(wǎng)自噬的信號也可能會傳遞到線粒體或者其他細(xì)胞器,其常常伴隨核糖體自噬和線粒體自噬一起發(fā)生或相互傳遞信號,共同在細(xì)胞中發(fā)揮作用;下面 Table 為不同自噬的關(guān)聯(lián)情況。


表 1:不同自噬方式的區(qū)別[7]

小結(jié)

內(nèi)質(zhì)網(wǎng),作為細(xì)胞重要的細(xì)胞器之一,其穩(wěn)態(tài)改變會引發(fā)一系列細(xì)胞反應(yīng),小 M 今天給大家簡要介紹了一種選擇性自噬,ER 誘導(dǎo)的自噬,這種自噬方式清除細(xì)胞內(nèi)受損的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)或內(nèi)質(zhì)網(wǎng)片段,以幫助內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的質(zhì)量調(diào)控;還介紹了內(nèi)質(zhì)網(wǎng)自噬的誘導(dǎo)的相關(guān)信號通路,形成過程,以及與其他自噬的區(qū)別,希望對大家有所幫助!
 
相關(guān)產(chǎn)品
4μ8C
(IRE1 Inhibitor III) 是 IRE1α 的小分子抑制劑。  
APY29
一種特異性的 IRE1α 別構(gòu)調(diào)節(jié)劑,通過結(jié)合到 ATP 結(jié)合口袋來抑制 IRE1α 的自主磷酸化,IC50 值為 280 nM。APY29 也可以變構(gòu)激活 IRE1α 相鄰 RNase 域。
GSK2850163
GSK2850163 是一個新型的肌醇需要酶-1α (IRE1α) 抑制劑,它可抑制 IRE1α 的激酶活性和 RNA 酶活性,其 IC50 值分別為 20 和 200 nM。
GSK2606414
GSK2606414 是可滲透細(xì)胞且有口服活性的蛋白激酶 R 樣內(nèi)質(zhì)網(wǎng) (ER) 激酶 (PERK) 抑制劑,IC50 值為 0.4 nM。
MK-28
MK-28 是有效、選擇性的 PERK 激動劑。MK-28 在小鼠中表現(xiàn)出良好的藥代動力學(xué)特征,且能透過血腦屏障。
自噬化合物庫
自噬參與多種生理和病理過程。細(xì)胞自噬調(diào)控異常會導(dǎo)致多種疾病的發(fā)生,包括感染、癌癥、神經(jīng)退行性疾病、衰老和心臟病等。MCE 提供 1245 種自噬信號通路相關(guān)的產(chǎn)品,是研究自噬相關(guān)調(diào)控及疾病的有用工具。
3-Methyladenine (3-MA)
PI3K 的抑制劑。它通過抑制 class III PI3K 廣泛作為自噬 (autophagy) 的抑制劑使用。 
Bafilomycin A1
大環(huán)內(nèi)酯類抗生素, 是一種自噬 (autophagy) 晚期階段抑制劑。Bafilomycin A1 阻斷自噬體與溶酶體的融合,并抑制培養(yǎng)細(xì)胞溶酶體中的酸化和蛋白質(zhì)降解。Bafilomycin A1 也誘導(dǎo)調(diào)亡 (apoptosis)。
MCE 的所有產(chǎn)品僅用作科學(xué)研究或藥證申報,我們不為任何個人用途提供產(chǎn)品和服務(wù)
 

參考文獻(xiàn)

1. Evripidis Gavathiotis, Ana Maria Cuerv, et al. Chaperone-mediated autophagy prevents collapse of the neuronal metastable proteome. Cell2021 May 13;184(10):2696-2714.e25.

 
2. Wen Li, Pengcheng He, Yuge Huang, et al. Selective autophagy of intracellular organelles: recent research advances. Theranostics. 2021 Jan 1;11(1):222-256. 
 
3.Sebastián Bernales, Sebastian Schuck, Peter Walter. ER-phagy: selective autophagy of the endoplasmic reticulum. Autophagy. 2007 May-Jun;3(3):285-7.
 
4.Khaminets, A, et al., Regulation of endoplasmic reticulum turnover by selective autophagy. Nature, 2015. 522(7556): p. 354
 
5.Jian Zhang, Jiafu Guo, et al. Endoplasmic reticulum stressmediated cell death in liver injury. Cell Death Dis. 2022 Dec 19;13(12):1051.
 
6.Mochida, K, et al., Receptor-mediated selective autophagy degrades the endoplasmic reticulum and the  nucleus. Nature, 2015. 522(7556): p. 359-62.
 
7.Haruka Chino, et al. ER-Phagy: Quality Control and Turnover of Endoplasmic Reticulum. Trends Cell Biol. 2020 May;30(5):384-398. 
 
8.Fulvio Reggiori, et al. ER-phagy: mechanisms, regulation, and diseases connected to the lysosomal clearance of the endoplasmic reticulum. Physiol Rev. 2022 Jul 1;102(3):1393-1448. 
 
9. Yo-Hei Yamamoto, Takeshi Noda. Autophagosome formation in relation to the endoplasmic reticulum. J Biomed Sci. 2020 Oct 22;27(1):97. 
 
10. Jose Norberto S Vargas, Maho Hamasaki, et al. The mechanisms and roles of selective autophagy in mammals. Nat Rev Mol Cell Biol. 2023 Mar;24(3):167-185.
來源:上海皓元生物醫(yī)藥科技有限公司
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