一、引言
蛋白質(zhì)組學(xué)是研究生物體內(nèi)蛋白質(zhì)的種類、數(shù)量、結(jié)構(gòu)、功能和相互作用的一門學(xué)科。在生物藥物領(lǐng)域,蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)被廣泛應(yīng)用于生物藥物的研發(fā)、質(zhì)量控制和臨床前后的評(píng)價(jià)。其中,蛋白質(zhì)定量是蛋白質(zhì)組學(xué)研究的重要組成部分。而dia定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)的出現(xiàn),為蛋白質(zhì)定量帶來(lái)了新的突破。
二、dia定量蛋白質(zhì)組學(xué)的基本原理
dia定量蛋白質(zhì)組學(xué)是一種基于數(shù)據(jù)無(wú)偏性的定量方法。它的基本原理是在不同樣品中同時(shí)加入已知濃度的內(nèi)標(biāo)蛋白,通過(guò)內(nèi)標(biāo)蛋白的定量來(lái)計(jì)算待測(cè)蛋白的濃度。與其他定量方法相比,dia定量蛋白質(zhì)組學(xué)具有高通量、高精度、高靈敏度和高可重復(fù)性等優(yōu)點(diǎn)。
三、dia定量蛋白質(zhì)組學(xué)的多樣化技術(shù)
dia定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)的發(fā)展,離不開多樣化的技術(shù)手段。以下是dia定量蛋白質(zhì)組學(xué)中常用的技術(shù):
1.SWATH-MS
SWATH-MS是一種基于數(shù)據(jù)無(wú)偏性的定量方法,它結(jié)合了數(shù)據(jù)依賴性采集和數(shù)據(jù)無(wú)偏性的定量方法。SWATH-MS技術(shù)通過(guò)將整個(gè)質(zhì)譜圖分成多個(gè)離散的窗口,每個(gè)窗口內(nèi)包含多個(gè)離子對(duì),然后采用數(shù)據(jù)依賴性采集的方法,選擇一定數(shù)量的離子對(duì)進(jìn)行定量。SWATH-MS技術(shù)具有高通量、高精度、高靈敏度和高可重復(fù)性等優(yōu)點(diǎn)。
2.DIA-MS
DIA-MS是一種基于數(shù)據(jù)無(wú)偏性的定量方法,它與SWATH-MS類似,但是DIA-MS技術(shù)采用的是連續(xù)的窗口,而不是離散的窗口。DIA-MS技術(shù)具有高通量、高精度、高靈敏度和高可重復(fù)性等優(yōu)點(diǎn)。
3.TMT
TMT是一種基于同位素標(biāo)記的定量方法,它通過(guò)在不同樣品中加入不同的同位素標(biāo)記劑,然后將樣品混合在一起進(jìn)行質(zhì)譜分析。TMT技術(shù)具有高通量、高精度、高靈敏度和高可重復(fù)性等優(yōu)點(diǎn)。
四、dia定量蛋白質(zhì)組學(xué)在應(yīng)用中的優(yōu)勢(shì)
dia定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)具有多種優(yōu)勢(shì),以下是dia定量蛋白質(zhì)組學(xué)在應(yīng)用中的優(yōu)勢(shì):
1.高通量
dia定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)具有高通量的優(yōu)勢(shì),可以同時(shí)定量數(shù)千個(gè)蛋白質(zhì),大大提高了蛋白質(zhì)組學(xué)研究的效率。
2.高精度
dia定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)具有高精度的優(yōu)勢(shì),可以準(zhǔn)確地定量蛋白質(zhì)的濃度,避免了其他定量方法中可能存在的偏差和誤差。
3.高靈敏度
dia定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)具有高靈敏度的優(yōu)勢(shì),可以檢測(cè)到低濃度的蛋白質(zhì),甚至是稀有蛋白質(zhì),有助于發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)志物和潛在的治療靶點(diǎn)。
4.高可重復(fù)性
dia定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)具有高可重復(fù)性的優(yōu)勢(shì),可以在不同實(shí)驗(yàn)之間和不同實(shí)驗(yàn)室之間獲得一致的結(jié)果,有助于驗(yàn)證和復(fù)現(xiàn)研究結(jié)果。
5.多樣化技術(shù)
dia定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)具有多樣化的技術(shù)優(yōu)勢(shì),包括SWATH-MS、DIA-MS和TMT等不同的定量方法,可以根據(jù)研究需求選擇最適合的技術(shù)方案。
6.應(yīng)用廣泛
dia定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)在生物藥物領(lǐng)域的應(yīng)用非常廣泛,可以用于藥物研發(fā)、生物標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)、疾病診斷和治療等方面。它可以幫助科研人員更好地理解蛋白質(zhì)的功能和相互作用,為藥物研發(fā)和個(gè)體化醫(yī)療提供重要的支持。
dia定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)具有高通量、高精度、高靈敏度、高可重復(fù)性和多樣化技術(shù)等優(yōu)勢(shì),在生物藥物領(lǐng)域的應(yīng)用中發(fā)揮著重要的作用。它為科研人員提供了一種準(zhǔn)確、高效、可靠的蛋白質(zhì)定量方法,有助于推動(dòng)生物藥物研發(fā)和臨床應(yīng)用的進(jìn)展。
圖1