平行反應(yīng)監(jiān)測(Parallel Reaction Monitoring,PRM)是質(zhì)譜分析中的一種方法,廣泛用于生物分子,特別是蛋白質(zhì)的定量分析。然而,關(guān)于PRM是否屬于絕對定量的問題,往往會引發(fā)疑惑。那么,PRM真的是絕對定量的嗎?在這篇文章中,我們將詳細探討這個問題。
1. 平行反應(yīng)監(jiān)測(PRM)簡介
PRM是一種質(zhì)譜技術(shù),其在靶向蛋白質(zhì)分析中尤其有用。它利用了高分辨質(zhì)譜儀的精確度,通過選擇特定的前體離子(代表目標蛋白質(zhì)的特異性肽段),并在碰撞細胞中對其進行分解,然后監(jiān)測所有產(chǎn)生的碎片離子。這樣,通過測量這些碎片離子的強度,可以推斷出目標蛋白質(zhì)的量。
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2. 絕對定量和相對定量
絕對定量方法需要對樣品中目標分子的確切濃度進行度量,這需要使用一個準確的濃度標準或內(nèi)標。相對定量則是基于比較,在同一樣品中或者在不同樣品中比較目標分子的豐度。
3. PRM在絕對定量中的應(yīng)用
PRM本身并不直接提供絕對定量,但當(dāng)結(jié)合適當(dāng)?shù)膬?nèi)標技術(shù)時,可以實現(xiàn)絕對定量。其中一種常用的內(nèi)標是穩(wěn)定同位素標記的肽段(如13C、15N標記的肽段)。這種標記的肽段在質(zhì)譜中的表現(xiàn)與自然豐度的肽段幾乎相同,但由于質(zhì)量的微小差異,可以在質(zhì)譜圖上將它們區(qū)分開來。
首先,我們需要知道內(nèi)標肽段的準確濃度,然后將其添加到樣品中。在質(zhì)譜分析中,由于內(nèi)標肽段和樣品中的自然豐度肽段同時被測量,因此可以通過比較它們的峰高或面積來推算出目標蛋白質(zhì)的絕對濃度。這種方法可以消除實驗過程中的各種變量,如樣品制備、離子化效率等。
因此,盡管PRM本身不是絕對定量技術(shù),但結(jié)合適當(dāng)?shù)膬?nèi)標技術(shù),PRM可以用于絕對定量。這使得PRM成為了蛋白質(zhì)組學(xué)研究中非常強大的工具,因為它可以精確、可靠地測量目標蛋白質(zhì)的豐度,從而提供了關(guān)于生物系統(tǒng)狀態(tài)的重要信息。