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空間單細胞蛋白組學技術原理及應用

瀏覽次數(shù):963 發(fā)布日期:2023-6-9  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負
Akoya空間單細胞蛋白組學是在組織原位追蹤細胞亞群分布和檢測功能蛋白表達的全新技術。該技術可同步對多達100多種蛋白靶標進行檢測和成像,不僅能夠保留完整的組織結構,而且可以精確區(qū)分單個細胞以及細胞的間隙。在此基礎上,可獲得特定組織結構中細胞亞群數(shù)量、細胞鄰域中的細胞關系圖譜、細胞間的通訊網(wǎng)絡、以及免疫檢查點等關鍵功能蛋白在單個細胞上的表達定位等高級空間信息。

|   技術原理
采用美國Akoya Biosciences公司的專利DNA偶聯(lián)抗體檢測技術結合自動化高分辨熒光顯微鏡,可還原蛋白質和特定細胞在組織中的真實分布。所有DNA偶聯(lián)抗體先一次性與組織切片結合,再啟動抗體和熒光探針的“雜交 — 成像 — 剝離”三步循環(huán),每次循環(huán)后通過熒光顯微鏡收集3種抗體的熒光信號,30次循環(huán)即可實現(xiàn)近百種蛋白質的空間原位檢測。
 
|   技術優(yōu)勢和特點
● 分辨率高,精確到0.25微米,直達單細胞水平;
● 一次雜交所有抗體,減少反復洗脫帶來的誤差和批次效應;
● 樣本兼容性高,新鮮冷凍FF和FFPE石蠟樣品均適用;
● 使用靈活,既有商品化抗體panel,也可定制化檢測;
● 全片掃描,最大面積可達18mm X 35mm.
 
|   實現(xiàn)細胞表型和功能蛋白的同時檢測
常用抗體目錄
以上為空間單細胞蛋白質組研究的常用指標,客戶可根據(jù)研究需要任意組合,定制化檢測。
 
|   數(shù)據(jù)呈現(xiàn)
根據(jù)研究目的,可深度挖掘組織空間信息、單細胞信息、蛋白定量信息和細胞互作信息。

 
|   研究示例
1. 非肌肉浸潤性膀胱癌(NMIBC)FFPE全組織超多重單細胞原位成像

商品化抗體(37)和定制化抗體(18)聯(lián)合開展NMIBC組織空間單細胞原位成像檢測?偣茶b定了14種細胞亞型,其中Ki67+細胞和CD31+細胞占比最多,說明了NMIBC組織中細胞增殖和血管生成非;钴S?臻g互作分析發(fā)現(xiàn)了CD163+巨噬細胞定位在三級淋巴結構和腫瘤基質區(qū)域。

2. 頭頸鱗狀細胞癌(HNSCC)組織超多重單細胞原位成像分析

超多重空間單細胞原位成像對835823個單細胞聚類成14種細胞亞型。依據(jù)細胞類型的不同和空間關系,可以將腫瘤區(qū)域分為4個異質性區(qū)域,每個腫瘤異質性區(qū)域包含不同的免疫、增殖、血管細胞亞型。例如CD68+巨噬細胞和CD8+ T細胞在腫瘤異質性區(qū)域3中的占比顯著減少,同時該區(qū)域幾乎不表達促凋亡蛋白BAK。這些現(xiàn)象說明區(qū)域3的腫瘤細胞處于活躍狀態(tài),不易受到T細胞的殺傷,此區(qū)域很可能對免疫治療耐受,該類型區(qū)域的存在或許是腫瘤耐藥和復發(fā)的關鍵。
 
|   參考文獻
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上海華盈生物醫(yī)藥科技有限公司(以下簡稱“華盈生物”)成立于2012年,位于上海閔行區(qū)綠洲環(huán)路396弄,是一家集產(chǎn)品研發(fā) — 技術服務為一體的醫(yī)學生物技術領域的特色高科技企業(yè)。華盈生物作為專業(yè)的蛋白組學技術服務公司,充分利用核心團隊的科學背景與資源優(yōu)勢,成功打造了“蛋白芯片”和“蛋白質譜”雙平臺技術服務體系,形成1+1>2的獨特業(yè)務優(yōu)勢。經(jīng)過多年的穩(wěn)步發(fā)展,華盈生物在業(yè)界逐漸樹立了“科學家服務科學家”的良好口碑和形象,業(yè)務覆蓋“蛋白芯片”、“蛋白質譜”、“外泌體研究”、空間單細胞組學”、“藥靶篩選”等領域,是國內(nèi)標桿性的蛋白質篩選與檢測系統(tǒng)性服務平臺。
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