DNA甲基化研究的三大前期探索性實(shí)驗(yàn)思路介紹

瀏覽次數(shù)：506　發(fā)布日期：2023-3-29　來源：本站　僅供參考，謝絕轉(zhuǎn)載，否則責(zé)任自負(fù)

大家好，這里是專注表觀組學(xué)十余年，領(lǐng)跑多組學(xué)科研服務(wù)的易基因。
近些年以來，DNA甲基化研究一直是頂級期刊、基金資助、臨床研究、藥物研發(fā)上市的多重?zé)狳c(diǎn)，其研究方向涵蓋疾病發(fā)生發(fā)展、疾病標(biāo)志物研究、環(huán)境因素暴露與響應(yīng)、發(fā)育和分化等多維度。

研究人員為DNA甲基化課題申請作準(zhǔn)備以及為降低DNA甲基化實(shí)驗(yàn)風(fēng)險(xiǎn)，通常會進(jìn)行DNA甲基化研究的前期探索性實(shí)驗(yàn)，主要包括：

檢測DNA甲基化酶和去甲基化酶的表達(dá)
檢測整體DNA甲基化水平變化
其他前期實(shí)驗(yàn)

一、檢測DNA甲基化酶和去甲基化酶的表達(dá)
方法包括：

RT-qPCR檢測mRNA表達(dá)
Western blot檢測蛋白質(zhì)翻譯

e.g. 高脂飲食組和肥胖人群中均觀察到DNMT的RNA和蛋白質(zhì)表達(dá)上調(diào)

二、檢測整體DNA甲基化水平變化
方法包括：
² 5mC甲基化免疫熒光染色（定性）
² DNA斑點(diǎn)雜交（定性）
² 比色法（定量）
² 質(zhì)譜法（定量）

斑點(diǎn)雜交（Dot blot）

免疫熒光顯微觀察

比色法/質(zhì)譜法

三、其他前期實(shí)驗(yàn)
在沒有條件開展甲基化相關(guān)前期實(shí)驗(yàn)的情況下，也可以開展其他預(yù)實(shí)驗(yàn)。包括：
² 關(guān)鍵表型指標(biāo)測定
² 轉(zhuǎn)錄組（成本低廉）

在進(jìn)行前期探索性實(shí)驗(yàn)后，DNA甲基化的研究思路與項(xiàng)目設(shè)計(jì)還包括：技術(shù)選擇、數(shù)據(jù)挖掘、下游驗(yàn)證。

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