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運用離子組學(xué)手段探究衰老的秘密

瀏覽次數(shù):932 發(fā)布日期:2021-9-14  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負

文章標題:Systematic age-, organ-, and diet-associated ionome remodeling and the development of ionomic aging clocks發(fā)表期刊:Aging Cell發(fā)表時間:2020年5月影響因子:7.238

 研究背景
 

生命是永恒不變的話題,所以衰老的秘密自古以來是研究者孜孜不倦研究的重點。我們知道從分子到組織的所有層面的系統(tǒng)性有害變化都與衰老相關(guān),進而導(dǎo)致功能逐漸衰退。在衰老過程中,生物體會積累包括內(nèi)在的生物過程中的錯誤到外在飲食或環(huán)境等因素的影響在內(nèi)的各種形式的損傷和其他有害變化。而這些內(nèi)在和外在的風(fēng)險因素會干擾正常生理功能,關(guān)于這些風(fēng)險因素所導(dǎo)致基因組、表觀基因組、蛋白質(zhì)組、轉(zhuǎn)錄組和代謝組的改變已經(jīng)被很多研究者廣泛報道。然而構(gòu)成人體的60多種元素,其中既有Na、K、P之類的常量元素,也有Mn、Fe、Zn之類的微量元素,但關(guān)于它們的報道卻是近幾年才逐漸引起。今天BIOTREE為大家?guī)鞻adim N. Gladyshev團隊關(guān)于衰老與離子組變化的報道。



 研究過程及結(jié)果

 1.離子在各器官中的分布較為穩(wěn)定

 

作者選擇了3個月至35個月期間共計16個時間點小鼠的八種器官(腦、肺、心、睪丸、肝、肌肉、胰腺和腎)中的13種元素(Na、Mg、Ca、P、S、K、Mn、Fe、Co、Cu、Zn、Se、Mo)使用ICP-MS進行離子組檢測(圖1a)。

圖1 小鼠組織離子表達狀態(tài)總覽

在整個生命過程中,大部分的離子在各個器官間的分布是較為穩(wěn)定的。從PCA可以看出,所有樣本整體是按照器官間的差異進行的聚類,不同器官間存在較為明顯的離子分布差異,而隨著年齡的變化則不太明顯。其中值得注意的是以知更鳥蛋藍(Robin’s egg blue)所代表的肝臟樣本存在較為廣泛的分布,說明肝臟中的離子分布具有更高的多樣性,作者進一步查看了那些離群較遠的樣本,發(fā)現(xiàn)均屬于30-35個月的大齡小鼠,很可能相當(dāng)于其他的器官而言,肝臟更容易受年齡的影響(圖1b)。圖1c則進一步展示了不同離子在器官中分布的層次聚類熱圖,可以很明顯的發(fā)現(xiàn)同一種元素的的不同同位素大部分聚類在一起,說明哺乳動物對于元素的利用基本上是不區(qū)分同位素的,大部分過度金屬也聚類在一起。值得注意的是,Ca和Mg在肌肉中有較高的含量這和前人的報道也是一致的。

2.生物體內(nèi)不同離子間存在相互關(guān)系

圖2 跨器官的元素組成特征

為了分析生命周期內(nèi)各種元素之間的相關(guān)性,作者對不同離子計算了相關(guān)性?梢钥吹組g、S、P、K聚成一個顯著相關(guān)的數(shù)據(jù)簇,這可能是由于生物體當(dāng)中這些元素都有較高的含量。除此之外,Mn、Cu、Zn和Mo又聚集成了一個簇,Na和Ca也聚集成了一個簇,這很可能是由于生物體中的鈉鈣交換有關(guān),神經(jīng)元細胞在吸收鈉離子時會釋放鈣離子,以避免細胞內(nèi)鈣積累(圖2a)。從PCA上則可以發(fā)現(xiàn),Mn、Ca、Cu和Zn聚集在圖的中央,這些離子在周期表中同屬一個周期,生物體內(nèi)也大多屬于二價態(tài),很可能也暗示著生物體對于這些元素利用的相關(guān)性(圖2b)。



3.年齡與組織中離子變化的關(guān)系
 


 

圖3 元素隨年齡的變化規(guī)律

顯而易見的是,絕大多數(shù)離子在大多數(shù)器官中都會隨著年齡而降低,諸如Zn,Cu, Se, Mn, Mg, P, S, K之類的元素,都會在老年發(fā)生系統(tǒng)性獲得缺乏,當(dāng)然也有些離子在部分器官中隨著年齡的增加而增加,比如腎臟和肌肉中的鈣水平,以及胰腺和睪丸中的鐵水平(圖3a)。除此之外,可以看到絕大多數(shù)器官中離子的變異系數(shù)也會隨著年齡增加而增加,這一現(xiàn)象與隨著年齡的增長組織內(nèi)穩(wěn)態(tài)的破壞是一致的(圖3b)。

但是肺和睪丸呈現(xiàn)相反的情況,可以看到鐵在睪丸中含量和變異系數(shù)會隨著年齡增加而增加,在肺中則恰恰相反,肺部鐵的主要來源是血清,因此鐵的減少可能是該器官血流量減少的標志。在睪丸中觀察到相反的表達模式,很可能是高鐵引起的氧化損傷所導(dǎo)致(圖3c)。此外還可以發(fā)現(xiàn)在極大年齡的小鼠睪丸中發(fā)現(xiàn)了極端上升的鈣水平,因此巨大鈣化很可能只在年齡很大的時候才會發(fā)生(圖3d)。


4.熱量限制對組織中離子分布的影響
 


圖4 熱量限制對離子組的影響
 
熱量限制(Calorie restriction CR)是對小鼠長壽進行干預(yù)的經(jīng)典因素之一,作者使用熱量干預(yù)來研究小鼠的壽命的影響。圖4a中可以發(fā)現(xiàn)無論是腎臟還是肌肉組織中離子的分布均與年齡明顯相關(guān),不同年齡的小鼠呈現(xiàn)明顯的衰老軌跡,有趣的是CR組整體分布與較年輕的正常飲食小鼠更相似,說明CR至少在器官元素組成方面有使小鼠年輕化的作用。作者隨后通過威爾科克森符號秩檢驗來分析正常飲食和CR組間離子含量是否存在顯著差異,值得注意的是Co在大部分組織中都存在顯著差異(圖4b)。此外可以發(fā)現(xiàn)Cd的含量會隨著熱量限制在大部分器官中降低,這可能是因為小鼠體內(nèi)大部分Cd的攝入均來自食物攝入,同時體內(nèi)缺少Cd代謝途徑,因此隨著熱量限制,食物量減少而導(dǎo)致(圖3c)。

 
5.器官年齡標志物的選擇
 

圖5 不同組織年齡的離子生物標志物


 

研究結(jié)論
最后作者嘗試用離子組數(shù)據(jù)來預(yù)測小鼠不同器官衰老的生物標志物。通過彈性凈回歸,構(gòu)建了生物標志物組合,可以發(fā)現(xiàn)腦、心、肝、肺和肌肉中數(shù)據(jù)擬合情況不好,無法構(gòu)建衰老預(yù)測模型。而對于腎、胰和睪丸則分別構(gòu)建了包含Na、Cu、Zn等12種元素(腎);Na、P、S、Zn和Cd等15種元素(胰);Na、P、S和K等16種元素(睪丸)的生物標志物組合。

離子組學(xué)技術(shù)手段已經(jīng)成為繼代謝組學(xué)之后又一新鮮的研究領(lǐng)域,百趣生物期待和您一起探索更多未知的秘密。

 

文獻原文
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來源:上海百趣生物醫(yī)學(xué)科技有限公司
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