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                                                              English | 中文版 | 手機(jī)版 企業(yè)登錄 | 個(gè)人登錄 | 郵件訂閱
                                                              當(dāng)前位置 > 首頁(yè) > 技術(shù)文章 > 樣本收集手冊(cè)之植物類樣本的收集方法及注意事項(xiàng)

                                                              樣本收集手冊(cè)之植物類樣本的收集方法及注意事項(xiàng)

                                                              瀏覽次數(shù):2998 發(fā)布日期:2021-4-19  來(lái)源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)
                                                              各位老師、同學(xué),大家好。今天將要分享的是我們樣本收集手冊(cè)的第五彈——植物類代謝組學(xué)樣本收集參考步驟。本次,我們將詳細(xì)介紹植物類樣本(葉片、莖、花、根、果實(shí)、種子)的收樣方法及注意事項(xiàng)。做植物代謝方向的老師可千萬(wàn)不要錯(cuò)過(guò)。話不多說(shuō),我們干貨奉上。
                                                               



                                                              1.葉片、莖、花

                                                               

                                                              • 樣品量要求:

                                                              GC-MS,LC-MS 實(shí)驗(yàn):200mg/sample。

                                                              頂空 GC-MS 實(shí)驗(yàn):2g/sample。

                                                               

                                                              • 樣本收集步驟:

                                                              取整片葉片/一段莖/一朵花,用錫箔紙包裹并標(biāo)記后,迅速放入液氮中冷凍處理至少 15min。取出后迅速放入自封袋中(每組一袋),在自封袋中放入標(biāo)簽紙注明樣本信息。迅速放入-80℃冰箱凍存。足量干冰寄送。

                                                               

                                                              • 注意事項(xiàng):

                                                              1. 采集葉片樣本時(shí),最好在中午光照好的時(shí)間收集。

                                                              2. 要根據(jù)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì),采集樣本時(shí)保持樣本一致性,尤其是同一組樣本(顏色、衰老程度、葉脈占比、光照、位置等)。

                                                              3. 由于錫箔紙上 marker 筆標(biāo)記容易模糊,所以需要在自封袋中放入標(biāo)簽紙注明。

                                                               

                                                              2.根

                                                               

                                                              • 樣品量要求:

                                                              GC-MS,LC-MS 實(shí)驗(yàn):500mg/sample。

                                                              頂空 GC-MS 實(shí)驗(yàn):3g/sample。

                                                               

                                                              • 樣本收集步驟:

                                                              1. 取整株植物的根部,迅速用 1×PBS 漂洗掉根上的泥土。

                                                              2. 根據(jù)具體實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)取植株根特定的部位,500 mg/sample 裝入離心管中。

                                                              3. 標(biāo)號(hào)后迅速放入液氮中冷凍處理至少 15min。

                                                              4. -80 度凍存;足量干冰寄送。

                                                               

                                                              • 注意事項(xiàng):

                                                              1. PBS 漂洗時(shí)間要盡快。

                                                              2. 由于根部組織特別脆弱,被擠壓后會(huì)變成漿糊狀,所以推薦保存至離心管中,而不是錫箔紙包裹。

                                                               

                                                              3.果實(shí)、種子

                                                               

                                                              • 樣品量要求:

                                                              GC-MS,LC-MS 實(shí)驗(yàn):200~500mg/sample。

                                                              頂空 GC-MS 實(shí)驗(yàn):3g/sample。

                                                               

                                                              • 樣本收集步驟:

                                                              1. 對(duì)于含多汁、塊頭較大的果實(shí)(番茄、西瓜、蘋果等)需要先用鋒利的刀分割成“均勻”合適的小塊(≈200 mg/sample)分裝至 2mL 離心管中,標(biāo)號(hào)后迅速放入液氮中冷凍處理至少 15min。

                                                               

                                                              2. 對(duì)于細(xì)小的顆粒種子(擬南芥種子、谷物種子等),可以先將同一組的植株種子混勻后再分裝(≈200 mg/sample)至 1.5mL 離心管中。標(biāo)號(hào)后迅速放入液氮中冷凍處理至少 15min。

                                                               

                                                              3. 對(duì)于要求對(duì)整個(gè)果實(shí)進(jìn)行提取的(整粒葡萄等),需要把果實(shí)裝在 50mL 離心管中/自封袋中,標(biāo)號(hào)后(同時(shí)放入自封袋中標(biāo)簽紙,注明樣本信息)迅速放入液氮中冷凍處理至少 15min。

                                                               

                                                              • 注意事項(xiàng):

                                                              對(duì)多汁的果實(shí)進(jìn)行取樣很難保持均一性(如番茄,皮、果肉、果瓤、籽的占比), 強(qiáng)烈建議將整個(gè)果實(shí)進(jìn)行研磨、凍干,對(duì)粉末進(jìn)行稱重分裝。
                                                               


                                                               

                                                              收集方法參考文獻(xiàn):

                                                              [1] De Vos R C, Moco S, Lommen A, et al. Untargeted large-scale plant metabolomics using liquid chromatography coupled to mass spectrometry.[J]. Nature Protocols, 2007, 2(4):778-791.

                                                              [2] Kim H K, Choi Y H, Verpoorte R. NMR-based metabolomic analysis of plants[J].Nature Protocols, 2010, 5(3):536-49.

                                                               

                                                              最后附上我司協(xié)助客戶發(fā)表的植物樣本部分文獻(xiàn),以便各位老師、同學(xué)在設(shè)計(jì)課題、文章撰寫等環(huán)節(jié)可參閱和引用。
                                                               

                                                              1. 南京農(nóng)業(yè)大學(xué):Yuan J, Zhao J, Wen T,et al.Root exudates drive the soil-borne legacy of aboveground pathogen infection. Microbiome 2018 Sep 12;6(1). IF=9.133

                                                               

                                                              2. 天津科技大學(xué):Yuqian Liu, Jinguang Liu, Rui Wang, et al. Analysis of secondary metabolites induced by yellowing process for understanding rice yellowing mechanism. Food Chemistry 2020 September 23. IF=6.306

                                                               

                                                              3. 河北師范大學(xué):Lulu Kong, Jingze Liu, Qian Han, Qixing Zhou, Junliang He. Integrating metabolomics and physiological analysis to investigate the toxicological mechanisms of sewage sludge-derived biochars to wheat.Ecotoxicology and Environmental Safety 185 (2019) 109664. IF= 4.527


                                                               
                                                              發(fā)布者:上海百趣生物醫(yī)學(xué)科技有限公司
                                                              聯(lián)系電話:021-61531195
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