GC-MS,LC-MS 實(shí)驗(yàn):200mg/sample。
頂空 GC-MS 實(shí)驗(yàn):2g/sample。
取整片葉片/一段莖/一朵花,用錫箔紙包裹并標(biāo)記后,迅速放入液氮中冷凍處理至少 15min。取出后迅速放入自封袋中(每組一袋),在自封袋中放入標(biāo)簽紙注明樣本信息。迅速放入-80℃冰箱凍存。足量干冰寄送。
1. 采集葉片樣本時(shí),最好在中午光照好的時(shí)間收集。
2. 要根據(jù)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì),采集樣本時(shí)保持樣本一致性,尤其是同一組樣本(顏色、衰老程度、葉脈占比、光照、位置等)。
3. 由于錫箔紙上 marker 筆標(biāo)記容易模糊,所以需要在自封袋中放入標(biāo)簽紙注明。
2.根
GC-MS,LC-MS 實(shí)驗(yàn):500mg/sample。
頂空 GC-MS 實(shí)驗(yàn):3g/sample。
1. 取整株植物的根部,迅速用 1×PBS 漂洗掉根上的泥土。
2. 根據(jù)具體實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)取植株根特定的部位,500 mg/sample 裝入離心管中。
3. 標(biāo)號(hào)后迅速放入液氮中冷凍處理至少 15min。
4. -80 度凍存;足量干冰寄送。
1. PBS 漂洗時(shí)間要盡快。
2. 由于根部組織特別脆弱,被擠壓后會(huì)變成漿糊狀,所以推薦保存至離心管中,而不是錫箔紙包裹。
3.果實(shí)、種子
GC-MS,LC-MS 實(shí)驗(yàn):200~500mg/sample。
頂空 GC-MS 實(shí)驗(yàn):3g/sample。
1. 對(duì)于含多汁、塊頭較大的果實(shí)(番茄、西瓜、蘋果等)需要先用鋒利的刀分割成“均勻”合適的小塊(≈200 mg/sample)分裝至 2mL 離心管中,標(biāo)號(hào)后迅速放入液氮中冷凍處理至少 15min。
2. 對(duì)于細(xì)小的顆粒種子(擬南芥種子、谷物種子等),可以先將同一組的植株種子混勻后再分裝(≈200 mg/sample)至 1.5mL 離心管中。標(biāo)號(hào)后迅速放入液氮中冷凍處理至少 15min。
3. 對(duì)于要求對(duì)整個(gè)果實(shí)進(jìn)行提取的(整粒葡萄等),需要把果實(shí)裝在 50mL 離心管中/自封袋中,標(biāo)號(hào)后(同時(shí)放入自封袋中標(biāo)簽紙,注明樣本信息)迅速放入液氮中冷凍處理至少 15min。
對(duì)多汁的果實(shí)進(jìn)行取樣很難保持均一性(如番茄,皮、果肉、果瓤、籽的占比), 強(qiáng)烈建議將整個(gè)果實(shí)進(jìn)行研磨、凍干,對(duì)粉末進(jìn)行稱重分裝。
收集方法參考文獻(xiàn):
[1] De Vos R C, Moco S, Lommen A, et al. Untargeted large-scale plant metabolomics using liquid chromatography coupled to mass spectrometry.[J]. Nature Protocols, 2007, 2(4):778-791.
[2] Kim H K, Choi Y H, Verpoorte R. NMR-based metabolomic analysis of plants[J].Nature Protocols, 2010, 5(3):536-49.
最后附上我司協(xié)助客戶發(fā)表的植物樣本部分文獻(xiàn),以便各位老師、同學(xué)在設(shè)計(jì)課題、文章撰寫等環(huán)節(jié)可參閱和引用。