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高通量測(cè)序技術(shù)-核酸片段分選

瀏覽次數(shù):1562 發(fā)布日期:2020-9-16  來(lái)源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)

近年來(lái),高通量測(cè)序技術(shù)已經(jīng)日漸成為基因組學(xué)研究項(xiàng)目的標(biāo)準(zhǔn)。從樣品制備到文庫(kù)制備及最終測(cè)序,大多步驟都要求精確高效化、易于自動(dòng)化操作,并且許多高通量測(cè)序應(yīng)用都要求核酸片段在特定范圍內(nèi)緊密分布,因此精準(zhǔn)快速的進(jìn)行片段選擇步驟更具挑戰(zhàn)性。

在進(jìn)行核酸片段分選的過(guò)程中,傳統(tǒng)的瓊脂糖凝膠回收法不適于安全、高通量的操作,使用普通磁珠無(wú)法準(zhǔn)確做到片段大小的選擇,而使用Agencourt SPRIselect的片段分選產(chǎn)品可以得到集中的核酸片段分布,并且可以完全自動(dòng)化,廣泛應(yīng)用于:

   核酸片段回收
​   核酸片段篩選
​   NGS、Sanger測(cè)序
​   qPCR、ddPCR等
 
Fig 1   Agencourt SPRIselect片段篩選試劑盒進(jìn)行目標(biāo)片段回收。

Agencourt SPRIselect試劑盒可常溫保存,方便使用。支持高效純化回收核酸片段(Fig 1);同時(shí)可根據(jù)SPRIselect磁珠與樣品的比例選擇性結(jié)合特定大小的核酸片段,工作流程易于調(diào)整且靈活,以快速達(dá)到去除小片段、大片段、或去大&去小的目的(Fig 2A)。SPRIselect磁珠優(yōu)先結(jié)合大片段核酸,隨著磁珠與樣本體積比例增加,磁珠結(jié)合更小片段的效率增加,結(jié)合更大片段的效率降低。由此,操作人員可以自由選擇需要篩選的片段范圍,以滿足不同核酸長(zhǎng)度范圍的應(yīng)用需求(Fig 2B)。
 
Fig 2 (A) Agencourt SPRIselect片段篩選試劑盒進(jìn)行去除小片段、去除大片段、及目標(biāo)片段選擇回收。
(B)M: 2100檢測(cè)Marker;Shear: 彌散的DNA片段;0.XX - 0.XX: 片段分選時(shí)去大、去小的磁珠樣本比例。

高通量 、簡(jiǎn)便操作

基于Agencourt SPRIselect試劑盒的核酸回收和片段選擇方法,貝克曼的Biomek自動(dòng)化移液站可在1小時(shí)內(nèi)完成96個(gè)樣本的全自動(dòng)流程,提供包含成熟的自動(dòng)化方法、穩(wěn)定的試劑、開放的耗材等在內(nèi)的核酸回收和片段選擇體系。

如果需要不同片段范圍的文庫(kù),用戶可以選擇在多孔反應(yīng)板中應(yīng)用多種樣品比率。Biomek自動(dòng)化移液站的靈活八通道加樣器可用于轉(zhuǎn)移不同體積SPRIselect磁珠和樣本,而多通道加樣器可用于快速批量去除上清液、乙醇并轉(zhuǎn)移最終洗脫的核酸等。
 
Fig 3 Agencourt SPRIselect 自動(dòng)化核酸回收、選擇操作系統(tǒng)

貝克曼庫(kù)爾特為您提供不同規(guī)格Agencourt SPRIselect片段篩選試劑盒和使用支持,致力于為用戶提供更加完整的解決方案。欲了解更多信息,請(qǐng)?jiān)L問(wèn)貝克曼庫(kù)爾特官方網(wǎng)站、小貝智選網(wǎng)上商城或聯(lián)系我們。
 




參考:

1.   US Patent 6938987
2.   US Patent 6938995
3.   http://www.nature.com/doifinder/10.1038/nprot.2014.067
來(lái)源:貝克曼庫(kù)爾特生命科學(xué)
聯(lián)系電話:400 168 5267
E-mail:apls@beckman.com

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