基因編輯鼠的種類很多,在實(shí)際應(yīng)用中,要根據(jù)研究的內(nèi)容和目的來選擇合適的基因編輯鼠才能取得良好的實(shí)驗(yàn)結(jié)果。我們通常會(huì)根據(jù)研究內(nèi)容從背景品系、修飾的基因、修飾的方式以及構(gòu)建技術(shù)這幾個(gè)方面進(jìn)行考慮來選擇合適的基因編輯鼠。今天我們就先來聊一聊研究中常用的兩種背景品系及構(gòu)建技術(shù)的選擇。
研究中常用的兩種背景品系的選擇
面對(duì)家族龐大的基因編輯鼠,你是否有過這樣的疑惑?為什么有的研究大多選擇“小白鼠”,而有的研究卻偏好“小黑鼠”?這是因?yàn)椴煌尘捌废档幕蚓庉嬍蟮谋硇涂赡艽嬖跇O大的差異,這種差異可以表現(xiàn)為完全不同的表型、表型的外顯率變化或者是表型的可變表達(dá)。
實(shí)驗(yàn)鼠分為近交系和遠(yuǎn)交系(封閉群),由于遠(yuǎn)交系雜合率高,個(gè)體差異大;近交系基因純合、遺傳穩(wěn)定、表型一致、背景資料清晰可查等原因,生物醫(yī)藥研究大多選擇近交系的小鼠。
目前,實(shí)驗(yàn)室中最常用的近交系小鼠品系是C57BL/6和Balb/C,對(duì)這兩種小鼠選擇時(shí)通常考慮它們?cè)诿庖邔W(xué)上的差異。那么這兩種小鼠有什么特點(diǎn)?在免疫學(xué)上主要存在哪些差異呢?
C57BL/6
它是繼人類之后第二個(gè)完成基因組測(cè)序的哺乳動(dòng)物,國際小鼠表型協(xié)會(huì)(IMPC)一直對(duì)其基因進(jìn)行功能分析,而且由于它是近交系小鼠,遺傳背景一致,不同的個(gè)體之間在表達(dá)上或表型上的變化不可能歸因于遺傳背景的不同,因此它是大多數(shù)定點(diǎn)修飾和轉(zhuǎn)基因的首選遺傳背景品系。
特性:
● 各種腫瘤發(fā)病率低。乳腺癌自然發(fā)生率低(0%-1%),用致癌物難以致癌。老齡鼠淋巴瘤自發(fā)率為20%~25%;雌鼠白血病自發(fā)率為7%~16%,經(jīng)照射后肝癌發(fā)生率高。
● 對(duì)放射物質(zhì)耐受力中等。
● 補(bǔ)體活性高。
● 較易誘發(fā)免疫耐受性。
● 對(duì)結(jié)核桿菌敏感。對(duì)鼠痘病毒有一定的抵抗力。
● 干擾素產(chǎn)量較高。
● 嗜酒精性高,腎上腺素類脂質(zhì)濃度低,對(duì)百日咳組織胺易感因子敏感。
● 研究飲食誘導(dǎo)的肥胖和慢性實(shí)驗(yàn)性自身免疫性腦脊髓炎多發(fā)性硬化癥模型的首選模型。
● 巨噬細(xì)胞對(duì)炭疽致死毒素的作用具有抗性。
需要注意的是C57BL/6不同的亞系之間存在諸多差異,應(yīng)用時(shí)應(yīng)詳細(xì)了解它們的區(qū)別,關(guān)于C57BL/6N與C57BL/6J之間的關(guān)系和區(qū)別可參考我們之前的推文:當(dāng)C57BL/6N遇上C57BL/6J。
Balb/C
Balb/C小鼠是腫瘤、炎癥和自身免疫等研究領(lǐng)域最常用的動(dòng)物,目前用于細(xì)胞融合的小鼠骨髓瘤細(xì)胞幾乎都來源于Balb/C系小鼠。
特性:
● 對(duì)礦物油誘導(dǎo)漿細(xì)胞瘤敏感。
● 常用于Balb/C脾細(xì)胞來源的雜交瘤產(chǎn)生單克隆抗體。
● 乳腺腫瘤發(fā)病率低(3%),當(dāng)用乳腺腫瘤病毒(MTV)誘導(dǎo)時(shí)發(fā)病率將增高。
● 隨著年齡的增長,患其它癌癥(肺癌、腎癌)的幾率大大增加。有一定幾率的卵巢、腎上腺腫瘤和白血病的發(fā)生。
● 多數(shù)個(gè)體于6月齡以后出現(xiàn)免疫球蛋白增多癥。主要是IgG1和IgA量的增加,干擾素產(chǎn)量低,補(bǔ)體活性高。
● 易受單核細(xì)胞增生性李斯特菌感染。
● 由于具有Hc1等位基因, 所以能抑制新型隱球菌。對(duì)立克次體引起的發(fā)熱、麻疹病毒、利什曼原蟲、曼氏血吸蟲敏感,對(duì)弓形體易感。
● 易患肺炎,最好不要和其他近交系小鼠同室飼養(yǎng)。
VS.
C57BL/6和Balb/C在免疫學(xué)上的區(qū)別
● C57BL/6和Balb/C在Th1和Th2型免疫反應(yīng)方面有所不同。在C57BL/6小鼠中,Th1免疫應(yīng)答和IFNγ產(chǎn)生占主導(dǎo)地位,而Balb/C很容易引發(fā)Th2免疫應(yīng)答,并且這在傳染病和變態(tài)反應(yīng)中很常見。
● 與C57BL/6小鼠相比,Balb/C小鼠傾向于產(chǎn)生更強(qiáng)的體液反應(yīng)。
● Balb/C小鼠MHC I基因位點(diǎn)是H2d型,C57BL/6是H2b型。就是H2的這個(gè)位點(diǎn)上基因序列有差異。但有的抗血清或抗體并不能區(qū)分它們的差異,可能對(duì)兩個(gè)品系的細(xì)胞都有反應(yīng)。有的單抗則可用來分型。
● 樹突狀細(xì)胞(DC)早期產(chǎn)生白介素12(IL-12)的差異是C57BL/6和Balb/C小鼠對(duì)單核細(xì)胞增生李斯特氏菌敏感性差異的基礎(chǔ)。
綜上所述,雖然C57BL/6和Balb/C都具有近交系遺傳背景一致的優(yōu)點(diǎn),但是把它們應(yīng)用于免疫學(xué)、腫瘤和感染性疾病等研究時(shí),還是需要考慮它們之間存在的諸多差異,根據(jù)研究內(nèi)容和目的來進(jìn)行選擇。
構(gòu)建技術(shù)的選擇
說完了背景品系的選擇,接下來我們就簡單地說一下構(gòu)建技術(shù)的選擇。CRISPR/Cas9無物種限制、操作簡單、成本低、周期短,但存在脫靶、產(chǎn)權(quán)糾紛等問題;ES打靶技術(shù)可以進(jìn)行各種復(fù)雜的基因改造而且精確無脫靶,是行業(yè)的金標(biāo)準(zhǔn),但存在物種限制的問題。因此建議常規(guī)的完全性基因敲除小鼠模型、基因敲入小鼠模型,以及C57BL/6以外其他物種的模型構(gòu)建可以選擇CRISPR/Cas9技術(shù)。但對(duì)于復(fù)雜的小鼠模型構(gòu)建以及關(guān)注動(dòng)物模型知識(shí)產(chǎn)權(quán)問題的用戶,仍推薦選擇基于ES打靶技術(shù)的TurboKnockout技術(shù)。
看到這里你可能會(huì)產(chǎn)生這樣的困惑:根據(jù)研究方向和目的,我的最佳選擇是用ES打靶對(duì)Balb/C小鼠進(jìn)行基因修飾,但是成熟的、可用于ES打靶的ES細(xì)胞系通常只有幾種品系來源:C57BL/6、129S3以及C57與129的雜交F1系。選擇CRISPR/Cas9技術(shù)的話,又存在知識(shí)產(chǎn)權(quán)糾紛、復(fù)雜項(xiàng)目難度大、脫靶等問題。那么,“魚與熊掌”真的不能同時(shí)兼得嗎?非也!
有兩種方法,一種是采取迂回路線,先用ES打靶技術(shù)對(duì)C57BL/6進(jìn)行基因修飾,再與野生型Balb/C小鼠回交10代以上,但這樣無疑需要在繁育鑒定上花費(fèi)大量的時(shí)間和精力。另一種方法就是直接解決Balb/C品系ES細(xì)胞培養(yǎng)難、采用ES打靶方式進(jìn)行模型構(gòu)建難度較高的問題。賽業(yè)生物歷時(shí)兩年半時(shí)間,先后篩選了數(shù)批Balb/C品系的ES細(xì)胞,每批ES細(xì)胞都進(jìn)行包括性別鑒定、核型穩(wěn)定性測(cè)試、全能型測(cè)試、生殖嵌合能力測(cè)試以及最終的生殖系遺傳嵌合測(cè)試在內(nèi)的大量測(cè)試,最終篩選出穩(wěn)定的種子細(xì)胞,成功實(shí)現(xiàn)了Balb/C品系的ES打靶模型構(gòu)建。如果你的研究有這方面的需要,歡迎聯(lián)系我們咨詢~
構(gòu)建技術(shù)選擇的詳細(xì)內(nèi)容可參考我們往期的推文:CRISPR/Cas9和ES打靶孰優(yōu)孰劣?怎樣選擇才是最優(yōu)解?