1. 前言
食品組學(xué)(Foodomics)是食品科學(xué)中的一門新興學(xué)科,它通過運(yùn)用或整合各種先進(jìn)組學(xué)技術(shù)(-Omics)來研究食品與營養(yǎng)學(xué)中的相關(guān)科學(xué)問題,從而改善消費(fèi)者的福祉與健康 [1]。按照研究目的與對象體系的不同,食品組學(xué)能從基因組學(xué)、蛋白組學(xué)與代謝組學(xué)等不同組學(xué)角度實施,可廣泛應(yīng)用于食品產(chǎn)地溯源 / 真實性判別、摻雜打假、轉(zhuǎn)基因分析、食品生產(chǎn)工藝優(yōu)化等領(lǐng)域 [2]。代謝組學(xué)是研究目標(biāo)體系中小分子物質(zhì)群定性定量存在或變化信息的一門組學(xué),它與食品組學(xué)存在著天然直接的關(guān)聯(lián),彼此融通。利用代謝組學(xué)的手段開展食品組學(xué)研究,能描繪食品中營養(yǎng)物質(zhì)群的存在分布規(guī)律,揭示發(fā)酵、烘焙等AN_C_LCMSMS_9_201507Y生產(chǎn)工藝中食品組分的動態(tài)演變趨勢,剖析食品風(fēng)格風(fēng)味的微觀化學(xué)物質(zhì)基礎(chǔ),以及認(rèn)識食品營養(yǎng)與疾病間的關(guān)聯(lián)關(guān)系等等,這都具有重要的應(yīng)用價值 [3]。
食品組學(xué)的開展有賴于大數(shù)據(jù)的高效表征,液相色譜 - 高分辨質(zhì)譜技術(shù)以其準(zhǔn)確靈敏等技術(shù)優(yōu)勢成為了食品組學(xué)研究最為重要的表征技術(shù)手段之一。本文利用 Thermo ScientificTM Q ExactiveTM 四極桿 - 靜電場軌道阱高分辨質(zhì)譜與相關(guān)組學(xué)信息處理軟件產(chǎn)品,開展了基于脂質(zhì)輪廓譜的食用植物油分類研究,可為名貴食用植物油的摻雜打假、油脂的功能營養(yǎng)學(xué)研究提供新的思路。
2. 實驗部分
2.1 樣品采集與制備
大豆油、菜籽油、花生油、亞麻籽油等十余種不同種類的常見食用植物油樣品購自各地超市,部分由客戶采集并提供。取適量植物油原液,用乙腈 - 異丙醇混合溶液稀釋,渦旋混勻后, 15℃ 恒溫下 5,000 g 離心 10 min,取上清液,供分析用。
2.2 脂質(zhì)輪廓譜采集
使用 Thermo ScientificTM DionexTM Ultimate TM 3000 超高效液相色譜串聯(lián) Thermo ScientificTM Q ExactiveTM 高分辨質(zhì)譜采集脂質(zhì)輪廓譜。
色譜條件:反相分離,二元洗脫,進(jìn)樣體積 5 µL,其余條件見下表。
質(zhì)譜條件: Q Exactive 使用 HESI Ⅱ 加熱電噴霧離子源,正離子模式,離子源主要配置參數(shù):噴霧電壓(spray
voltage)3000 V,毛細(xì)管溫度(capillary temp.)350 ℃,氣化溫度(probe heater temp.)300 ℃,鞘氣流速(sheath gas)40 arb,輔助氣流速(aux gas)12 arb, S-Lens level 55%。脂質(zhì)輪廓譜分析采用全掃描模式,質(zhì)量掃描范圍 400–1200m/z, 70,000 FWHM 分辨率, AGC target 3e6, Maximum IT 200 ms。脂質(zhì)分子結(jié)構(gòu)鑒定采用 Full scan-ddMS2 模式,一級 MS 分辨率 70,000 FWHM, MS2 分辨率 17,500 FWHM,AGC target - 1e5, maximum IT - 50 ms, isolation window - 2.0m/z, NCE - 30%, underfill ratio - 1%, Apex trigger - 3~6 s,dynamic exclusion time - 10 s, loop count (TopN) – 5。
2.3 組學(xué)數(shù)據(jù)處理
SIEVE 軟件分析:全掃描脂質(zhì)輪廓譜數(shù)據(jù)處理,包括色譜匹配校正、質(zhì)譜特征提取、分析數(shù)據(jù)質(zhì)量評估,使用Thermo Scientifc SIEVETM 2.2 SP2 無標(biāo)記差異表達(dá)分析軟件完成。質(zhì)譜信號特征提取使用 Small molecule-Component Exctraction算法,主要參數(shù)設(shè)定為: max RT shift - 0.2 min; Background SN – 50; Base peak minimum intensity - 5e6; RT peak isolation - 0.2 min; peak algorithm - PPD。
LipidSearch 軟件分析: LipidSearchTM 是 Thermo Fisher Scientific 專為解決脂質(zhì)組學(xué)高通量數(shù)據(jù)分析中各種科學(xué)問題而研發(fā)的軟件,它龐大的譜圖庫中包含高達(dá)一百七十余萬個lipid species 的 MS2/MS3 預(yù)測譜圖,軟件搜索引擎可通過實測譜圖與理論預(yù)測譜圖間的匹配,實現(xiàn)自動化的脂質(zhì)分子結(jié)構(gòu)注釋。實驗利用ProductSearch_QEX 檢索模式對 Full scanddMS2 數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,主要參數(shù)包括: precursor tolerance -5 ppm; product tolerance - 10 ppm; intensity threshold - 1.0%;m-score threshold - 2.0; ID quality filter - A, B, C, D。
主成分分析(PCA, Principal Component Analysis)與聚類分析:使用 SIEVE 軟件以及 SIMCA-P 軟件完成 [4]。
3. 結(jié)果與討論
3.1 SIEVE 處理與數(shù)據(jù)質(zhì)量評價
圖 2 為實驗采集的各種食用植物油的脂質(zhì)輪廓圖, Q Exactive 定性定量兼得的 Quanfirmation 分析力與穩(wěn)健性為隨后基于 SIEVE 軟件的組學(xué)信息挖掘提供了高質(zhì)量的數(shù)據(jù)基礎(chǔ)。圖 3A 展示了 SIEVE 軟件的色譜匹配效果。同時,由于分析樣本數(shù)目大,實驗采用 Pooled Quality Control 策略進(jìn)行分析性能質(zhì)控。結(jié)果如圖 3B,在 SIEVE 完成的 PCA 分析 3D 主成分得分圖(score plot)中,所有的質(zhì)控樣本均緊密地聚集分布在 3D 得分圖的中心,顯示 Q Exactive 的長期穩(wěn)健性表現(xiàn)出色。如圖 4 所示, SIEVE 軟件可利用 OrbitrapTM 采集的高分辨準(zhǔn)確質(zhì)譜數(shù)據(jù)與精細(xì)同位素模式信息,通過軟件內(nèi)嵌的加合離子數(shù)據(jù)庫與色譜行為評估等一系列迭代,對復(fù)雜的質(zhì)譜譜圖進(jìn)行自
動解卷積,將源自于同一代謝物的數(shù)十個復(fù)雜質(zhì)譜信號特征簡化為一個代謝組分(metabolic component),從而大大改善模式識別數(shù)據(jù)矩陣的信息純度與有效性。
3.2 分類與多元統(tǒng)計結(jié)果
實驗挑選 6 種最為常見的食用植物油進(jìn)行深度的多元統(tǒng)計分析。圖 5 為對 SIEVE 軟件獲得的脂質(zhì)輪廓譜數(shù)據(jù)矩陣進(jìn)行聚類分析的結(jié)果,可見, 6 種食用植物油樣品按照各自的植物基源,分類明確。
隨后,為進(jìn)一步明晰不同脂質(zhì)分子在脂質(zhì)整體輪廓分類中的貢獻(xiàn),實驗又對這 6 種植物油樣本進(jìn)行了無師監(jiān)督(unsupervised)的 PCA 分析。結(jié)果如圖 6A,得分圖中六種植物油樣品大致聚集為 4 大類,分類趨勢與聚類分析結(jié)果相一致。綜合兩種多元統(tǒng)計的結(jié)果,可推知花生油、菜籽油與芝麻油三者之間的脂質(zhì)成分組成譜征間具有更高的類似性,其與大豆油、葵花籽油與亞麻籽油間的整體組間差異更為顯著。
圖 6B 載荷圖中 α、β、γ 區(qū)域內(nèi)的變量對得分圖中的聚類趨勢具有較高的貢獻(xiàn)權(quán)重。利用 Q Exative sub-ppm 的高質(zhì)量精度可準(zhǔn)確推定出這些甘油三酯分子的唯一元素組成,同時結(jié)合 LipidSearch 軟件的自動譜庫檢索(圖 7),可便利地鑒定這些差異脂質(zhì)的分子結(jié)構(gòu),結(jié)果見表 1。載荷圖中 α 域內(nèi),脂肪酸酰鏈富含亞油酸(Linoleic acid)的脂質(zhì)分子在大豆油與葵花籽油中高表達(dá)。同理而言, β 域內(nèi)富含油酸(Oleic acid)的甘油三酯在菜籽油與花生油中高表達(dá),而 γ 域內(nèi)的脂質(zhì)分子具有高度的不飽和性,亞麻酸(Linolenic acid)含量十分豐富。位居于 PC1 方向中心位置處的芝麻油中油酸與亞油酸的含量比例則相對較為均衡。實驗分別選取上述三類中的兩個典型脂質(zhì)分子進(jìn)行統(tǒng)計分析,結(jié)果見圖 8。
聚焦食品與健康間的關(guān)聯(lián)是當(dāng)今食品科學(xué)領(lǐng)域的重要趨勢,鑒于油酸與多不飽和脂肪酸(PUFA)亞油酸、亞麻酸廣泛而具有差異的生物功能,本實驗開展的食品組學(xué)研究對于深入理解膳食中不同植物油的功能營養(yǎng)提供了新的工具。
4. 總結(jié)
• Thermo Scientific Q Exactive 高分辨準(zhǔn)確質(zhì)譜是食品組學(xué)研究中表征功能蛋白與活性小分子物質(zhì)群的有力技術(shù)手段;
• SIEVE 與 LipidSearch 軟件為食品組學(xué)中小分子組學(xué)研究的信息處理提供了高效的解決方案。
致謝: 感謝中國農(nóng)科院武漢油料作物研究所王秀嬪博士在樣品采集上的大力幫助。
參考文獻(xiàn):
[1] Cifuentes A (2009), J. Chromatogr. A, 1216 (43): 7109
[2] García-Cañas V (2012)Anal. Chem., 84 (23), pp 10150-10159
[3] Antignac JP (2011), Trends Anal. Chem., 30, 292-301
[4] http://www.umetrics.com/products/simca