PLoS ONE:鵪鶉PIWI基因的克隆及其結(jié)合小RNA的鑒定
瀏覽次數(shù):2293 發(fā)布日期:2013-1-6
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PIWI 蛋白能通過(guò)與多種內(nèi)源非編碼小RNA結(jié)合在表觀水平和轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控基因的表達(dá)。然而在家禽中,PIWI蛋白的生物學(xué)功能及其結(jié)合小RNA的作用機(jī)制尚不清楚。揚(yáng)州大學(xué)動(dòng)物科學(xué)與技術(shù)學(xué)院陳國(guó)宏教授課題組對(duì)該作用機(jī)理進(jìn)行了研究*,研究成果發(fā)表在2012年12月刊的PLoS ONE上。
PIWI 基因最早在果蠅的生殖干細(xì)胞(Germline Stem Cells,GSCs)中被發(fā)現(xiàn),因其編碼的蛋白質(zhì)能調(diào)節(jié)GSCs的數(shù)量與分化率而得到研究者的進(jìn)一步研究。在果蠅中,PIWI亞家族包含三個(gè)成員:PIWI, AUB, AGOs。對(duì)于PIWI突變個(gè)體,雄性與雌性均表現(xiàn)不育。而在人類中,PIWI蛋白除了參與精子發(fā)生外,同時(shí)也與腫瘤的形成和發(fā)展相關(guān)。
在本研究中,研究者首先克隆得到PIWI基因,隨后利用二代測(cè)序技術(shù)對(duì)鵪鶉的小RNA表達(dá)譜進(jìn)行分析(由聯(lián)川生物承擔(dān)完成),并利用生物信息學(xué)方法預(yù)測(cè)了與其綁定的小RNA,再經(jīng)過(guò)免疫共沉淀與Western Blotting驗(yàn)證,從而闡明了其在精子形成過(guò)程的基因調(diào)控作用。最后研究表明,PIWI能與鵪鶉的rasiRNAs(repeat-associated small interfering RNAs,rasiRNAs)結(jié)合,并與鵪鶉的miRNA相關(guān)。研究表明了在成年鵪鶉睪丸中PIWIL1與小RNA結(jié)合,從而使PIWIL1蛋白特異性表達(dá)。此外,miRNA在成年的睪丸和卵巢中具有表達(dá)差異。
本研究闡明了PIWI蛋白在鵪鶉中的生物學(xué)機(jī)制,為禽類小分子RNA及其結(jié)合蛋白深入研究奠定了分子基礎(chǔ)。
*R Chen., G Chang., Y Zhang, A Dai, T Ma et al.(2012)Cloning of the Quail PIWI Gene and Characterization of PIWI Binding to Small RNAs. PLoS ONE 7(12) e51724.
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