用于檢測和定量分析極性細(xì)胞代謝物的一種新穎的HILIC LC-MS方法
Henry Shion1、John Shockcor1、Evan Bernier2、Stephen Mcdonald2、Kirsten Hartil3、Bhavapriya Vaitheesvaran3、Haitao Lu3、Gustavo Palacios3、Inwin J. Kurland3、Alan L. Millar1
1沃特世公司,美國馬薩諸塞州米爾福德;2沃特世公司,美國馬薩諸塞州貝弗利;3猶太大學(xué)阿爾伯特Ÿ愛因斯坦醫(yī)學(xué)院,美國紐約市布朗克斯區(qū)
引言
復(fù)雜生物樣品通常包含大量可反映有機(jī)體代謝狀態(tài)的內(nèi)源性代謝物。特別是骨骼肌可根據(jù)其是快收縮肌(白色肌肉,糖酵解型)還是慢收縮肌(紅色肌肉,氧化型)而表現(xiàn)出特征性的代謝組“指紋圖譜”。例如,紅色肌肉應(yīng)顯示一種富含線粒體代謝物(如三羧酸循環(huán))的代謝組指紋圖譜;而白色肌肉應(yīng)顯示富含糖酵解代謝物的代謝組指紋圖譜,其線粒體代謝物的濃度大大低于紅色肌肉。雖然很多這類代謝物可具有較強(qiáng)的極性,但這些樣本通常使用反相液相色譜-質(zhì)譜(RP-LC-MS)進(jìn)行分析,由此而來的多是較差的保留。在本研究中,我們開發(fā)了一種用于檢測和定量強(qiáng)極性細(xì)胞代謝物的新穎LC-MS方法。本研究采用了基于亞2微米顆粒BEH酰胺柱的親水作用液相色譜(HILIC),并聯(lián)用了雜化四極桿飛行時(shí)間質(zhì)譜儀和三重四極桿質(zhì)譜。
方法
這些試驗(yàn)借助聯(lián)用了沃特世SynaptTM HDMSTM、沃特世Synapt G2 HDMS和Xevo TQ的一臺UPLC系統(tǒng)而進(jìn)行:
液相色譜條件(1):使用堿性流動相
液相色譜系統(tǒng):沃特世ACQUITY UPLC®系統(tǒng)
- 色譜柱:ACQUITY UPLC BEH Amide 酰胺基柱,2.1×100mm,1.7µm
- 柱溫:45℃
- 流速:500µL/分鐘
- 堿性流動相A:乙腈/水,95/5(v/v),10mM醋酸銨,pH=9.0
- 堿性流動相B:乙腈/水,50/50(v/v),10mM醋酸銨,pH=9.0
- 梯度(采用堿性流動相進(jìn)行分離時(shí)):線性梯度,先用2% B - 85% B洗脫8分鐘,然后在98% B的水平下保持2分鐘,接著返回到2% B的水平進(jìn)行再平衡(5分鐘)
- 進(jìn)樣量:5-20µL
液相色譜條件(2):使用酸性流動相
液相色譜系統(tǒng):沃特世®ACQUITY UPLC®系統(tǒng)
- 色譜柱:ACQUITY UPLC BEH Amide 酰胺基柱,2.1×100mm,1.7µm
- 柱溫:40℃
- 流速:600µL/分鐘
- 酸性流動相A:乙腈/水,95/5(v/v),10mM醋酸銨,pH=3.0
- 酸性流動相B:水,10mM醋酸銨,pH=3.0
- 梯度:先用5% B - 30% B洗脫5分鐘,在第5.5min時(shí)升至60% B并保持7分鐘,接著返回到5% B的水平進(jìn)行再平衡(5分鐘)
- 進(jìn)樣量:20µL滿定量環(huán)
質(zhì)譜分析
Synapt HDMS和Synapt G2 HDMS
該質(zhì)譜儀在正離子MSE模式下運(yùn)行。所用的毛細(xì)管電壓為3.0kV,源溫度和去溶劑化溫度分別被設(shè)定為120℃和400℃。
在MSE采集模式下,儀器交替在低、高碰撞能量狀態(tài)下進(jìn)行交替掃描。這樣可在一次分析內(nèi)同時(shí)收集所有分析物的母離子和碎片離子的信息,消除了諸如DDA等其它常規(guī)方法所帶來的采樣偏差;在常規(guī)方法中,特定的m/z必須在碎片化前被分離出來。
Xevo-TQ質(zhì)譜
Xevo TQ可同時(shí)在正離子和負(fù)離子模式下運(yùn)行。毛細(xì)管電壓為3.0kV,源溫度和去溶劑化溫度分別被設(shè)定為150℃和650℃。去溶劑化氣體流速被設(shè)定為1200L/小時(shí),碰撞氣體(氬)的流速為0.18mL/分鐘(4×10-3毫巴)。MS1/MS2分辨率被設(shè)置為單位質(zhì)量(0.75Da FWHM)。
組織提取物的樣品制備
紅色的比目魚。⊿)用來與白色的腓腸。℅)進(jìn)行比較,肌肉從禁食一整夜的BALB/c小鼠中切下并進(jìn)行了急速冷凍。代謝物通過組織均質(zhì)化的方法在1:1的甲醇:水混合溶劑中進(jìn)行萃取,脂質(zhì)通過將氯仿以1:1的比例添加至甲醇/水萃取液中而得到去除。去脂質(zhì)后的組織萃取樣本分別用400µL和4000µL的90:10乙腈:水混合溶劑進(jìn)行揮干復(fù)溶。由于某些組分的含量高于定量上限,因此也對每份樣本再稀釋10倍進(jìn)行了分析。
結(jié)果和討論
1. 通過聯(lián)用Synapt HDMS的UPLC進(jìn)行HILIC LC-MS方法開發(fā)
圖1. 108種標(biāo)準(zhǔn)強(qiáng)極性細(xì)胞代謝物的總離子色譜圖,其中包括氨基酸、DNA/RNA堿基及其磷酸鹽、輔酶A、B族維生素、有機(jī)酸等。
圖1給出了108種標(biāo)準(zhǔn)強(qiáng)極性細(xì)胞代謝物的總離子色譜圖(TIC),其中包括氨基酸、DNA/RNA堿基及其磷酸鹽、輔酶A、B族維生素、有機(jī)酸等。此項(xiàng)試驗(yàn)通過聯(lián)用沃特世Synapt HDMS(正離子MSE模式下)的沃特世UPLC【液相色譜條件(1)】而進(jìn)行。
圖2. 單一化合物提取離子色譜圖示例(50mDa窗口內(nèi))
圖2給出了關(guān)于單一化合物提取離子色譜圖片段(50mDa窗口)的一些例子。所選取的提取離子色譜圖中的大部分峰寬測定值介于5-15秒之間。然而,也觀察到了拖尾峰,其峰寬長達(dá)60秒。因此,我們考慮修改液相色譜的條件。
2. 使用UPLC/Xevo-TQ聯(lián)用儀器對HILIC LC-MS方法開發(fā)標(biāo)準(zhǔn)品和細(xì)胞萃取物進(jìn)行定量分析
在UPLC優(yōu)化過程中進(jìn)行的標(biāo)準(zhǔn)品分析表明使用酸性pH的流動相緩沖液可提高對氨基酸和有機(jī)酸的分辨率、信噪比和峰對稱性。圖3比較了對一種包含約2µg/mL L-賴氨酸的純氨基酸溶液所得出的兩幅MRM色譜圖。靠上的色譜圖通過使用堿性流動相(液相色譜條件1)所進(jìn)行的分離而得出,而靠下的色譜圖則采用酸性流動相(液相色譜條件2)。
圖3. 比較不同pH下,包含約2µg/mL L-賴氨酸溶液的兩幅MRM色譜圖
圖4. 液相色譜條件(2)得出的MRM色譜圖示例
圖4將酸性流動相(液相色譜條件(2))下1600ng/mL校準(zhǔn)標(biāo)準(zhǔn)品(上圖)和樣本H-S(0090)的MRM色譜圖進(jìn)行了疊加。
在此條件下,我們成功分離并定量分析了28種化合物,其中包括氨基酸、有機(jī)酸和磷酸鹽(圖6)。
圖5. TargetLynx給出的ADP電子報(bào)告示例
43種化合物的定量分析(既包括酸性也包括堿性條件)使用TargetLynxTM進(jìn)行。對于每種化合物,均生成了相應(yīng)的電子報(bào)告;計(jì)算結(jié)果通過線性回歸進(jìn)行確定。圖5是腺苷二磷酸(ADP,在三羧酸循環(huán)中特別重要)的一個(gè)報(bào)告示例。
化合物 |
濃度(ng/mL) |
H-S
(0091) |
H-S
(0092) |
H-G
(0099) |
H-G
(0100) |
AMP |
683 |
615 |
31.1 |
40.8 |
ADP |
1760 |
1542 |
2190 |
3410 |
ATP |
6730 |
5010 |
337 |
297 |
NAD |
2550 |
2400 |
2020 |
2270 |
NADH |
2080 |
1390 |
915 |
1420 |
NADP |
211 |
145 |
93.9 |
82.3 |
α-磷酸甘油 |
469 |
306 |
1810 |
3220 |
6-磷酸葡萄糖 |
0 |
0 |
409 |
608 |
檸檬酸 |
95 |
90 |
44 |
40 |
二羥基丙酮磷酸鹽 |
2.9 |
8.5 |
35 |
67.6 |
果糖-6-磷酸 |
793 |
468 |
1070 |
2210 |
果糖-1,,6-磷酸 |
1080 |
187 |
0 |
166 |
葡萄糖-6-磷酸 |
186 |
91.9 |
374 |
683 |
甘油醛-3-磷酸 |
89.7 |
46.9 |
32.8 |
55.4 |
磷酸烯醇丙酮酸 |
23.1 |
17.3 |
1.3 |
1.5 |
|
化合物 |
濃度(ng/mL) |
H-S
(0089) |
H-S
(0090) |
H-G
(0097) |
H-G
(0098) |
甘氨酸 |
4150 |
4250 |
3130 |
3350 |
L-丙氨酸 |
4520 |
5560 |
3050 |
3290 |
L-精氨酸 |
1800 |
1750 |
50.1 |
48.6 |
L-天冬氨酸 |
1970 |
1300 |
125 |
46.4 |
L-胱氨酸 |
5.3 |
4.4 |
0 |
0 |
L-谷氨酸 |
8680 |
4790 |
1330 |
1270 |
L-組氨酸 |
412 |
455 |
110 |
123 |
L-賴氨酸 |
2910 |
2890 |
0 |
0 |
L-甲硫氨酸 |
261 |
295 |
201 |
213 |
L-苯丙氨酸 |
361 |
400 |
159 |
178 |
L-脯氨酸 |
302 |
281 |
278 |
264 |
L-絲氨酸 |
1300 |
1280 |
410 |
483 |
L-蘇氨酸 |
358 |
398 |
171 |
179 |
L-酪氨酸 |
269 |
363 |
173 |
189 |
L-纈氨酸 |
531 |
524 |
508 |
503 |
亮氨酸 |
219 |
214 |
122 |
119 |
異亮氨酸 |
818 |
820 |
302 |
332 |
谷胱甘肽(還原態(tài)) |
5.2 |
3.8 |
250 |
1090 |
谷胱甘肽(氧化態(tài)) |
541 |
539 |
539 |
544 |
鳥氨酸 |
591 |
839 |
0 |
0 |
瓜氨酸 |
148 |
163 |
105 |
131 |
β-羥基丁酸 |
280 |
501 |
485 |
558 |
反丁烯二酸 |
576 |
1220 |
0 |
0 |
乳酸 |
8830 |
17100 |
6920 |
14900 |
丙酮酸 |
19.7 |
39.2 |
36.6 |
72.4 |
琥珀酸 |
931 |
1720 |
787 |
1410 |
5-磷酸核糖 |
27.1 |
19.9 |
0 |
0 |
5-磷酸木酮糖 |
50.7 |
51.5 |
0 |
0 |
|
圖6. 使用堿性(左表)和酸性(右表)流動相在H-S和H-G組織樣本中所檢出化合物的濃度計(jì)算結(jié)果總合
對在堿性和酸性流動相分離中所檢出的H-S和H-G組織樣本中的每種化合物均計(jì)算了分析物濃度。通過比較紅色比目魚。⊿)和腓腸肌(G)組織樣本中的代謝物濃度證實(shí)了在其相對濃度方面存在顯著差異。
3. 通過聯(lián)用Synapt G2的UPLC對HILIC LC-MS方法的標(biāo)準(zhǔn)品和細(xì)胞萃取物進(jìn)行定量分析
最近開發(fā)的用于Synapt G2的QuanTof技術(shù)[1]以及MSE數(shù)據(jù)采集技術(shù)的應(yīng)用實(shí)現(xiàn)了一種通用型UPLC-MS方法的開發(fā);這種方法可在一次運(yùn)行分析得到提供所有物質(zhì)的定量和定性信息,既包括母離子信息也包括產(chǎn)物離子的信息。對于此項(xiàng)測定而言,系列稀釋標(biāo)準(zhǔn)品以及H-S和H-G樣本的數(shù)據(jù)都進(jìn)行了采集(圖7),所有的數(shù)據(jù)處理工作在采集完成后進(jìn)行。
圖7. 全掃描色譜圖比較。通過UPLC-Synapt G2獲取的S和G細(xì)胞萃取物的數(shù)據(jù)。
圖8. 目標(biāo)化合物的鑒定和定量結(jié)果
首先,自動篩選細(xì)胞萃取物中是否存在目標(biāo)化合物。離子的鑒定和確認(rèn)通過一個(gè)單一處理步驟使用Posit±veTM軟件包得出母離子和子離子的準(zhǔn)確質(zhì)量(2mDa窗口)而實(shí)現(xiàn)(圖8)。
該數(shù)據(jù)表明與Xevo TQ分析結(jié)果具有良好的一致性。圖8給出了一個(gè)示例,化合物L(fēng)-脯氨酸在細(xì)胞萃取物中被明確鑒別出來,并在4個(gè)數(shù)量級中表現(xiàn)出線性的動態(tài)范圍響應(yīng),RMS質(zhì)量誤差為0.57mDa。
結(jié)論
使用新型BEH Amide酰胺柱可開發(fā)出一種用于分離極性組織細(xì)胞代謝物的HILIC LC-MS方法,總運(yùn)行時(shí)間不到15分鐘。
同時(shí)采用Xevo TQ和Synapt G2 HDMS對紅色和白色的肌肉組織萃取物進(jìn)行定量分析,可明顯區(qū)分出其主要代謝物(比如AMP、ADP和ATP、以及瓜氨酸)的顯著不同。
QuanTof技術(shù)實(shí)現(xiàn)了定性和定量試驗(yàn)?zāi)軌蛟赟ynapt G2上同時(shí)進(jìn)行。
參考文獻(xiàn)
1. Wildgoose J.整合了基于ADC新穎檢測技術(shù)的高效、幾何折疊型OA-Tof 質(zhì)量分析儀.第18屆國際質(zhì)譜大會(IMSC)所提交的公告,德國不來梅,2009年。