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                                當前位置 > 首頁 > 技術文章 > 超聲波破碎細胞的常見問題

                                超聲波破碎細胞的常見問題

                                瀏覽次數:10201 發(fā)布日期:2009-3-25  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負

                                    大腸桿菌表達外源蛋白,在超聲破碎的時候,用含有1%triton-X-100的PBS懸浮,然后超聲的效果較

                                好,1%triton-X-100的作用還是很明顯的,對其他的一些細菌同樣起作用,比如鏈霉菌。

                                    細菌沉淀直接加樣品1buffer,再加5ul的巰基乙醇,混勻,離心,煮沸10min,直接上樣,染色脫色步

                                驟如下:將膠放入適量的染色液微波爐里加熱1min(下次適當補點醋酸即可),將染色液換成大量的水(自來水即

                                可)在微波爐煮10min 就可以。

                                    在表達重組蛋白后超聲波破碎細胞,采用冰浴,400w,破2s停1s,但是不一會就產生大量泡沫,影響
                                 
                                了破碎功率,pbs和tris緩沖液都是這樣,最后都是破碎不完全,而我的目的蛋白就在這些未破碎的細胞中。
                                 
                                1*會產生氣泡是因為你的探頭位置沒放好。探頭一定要接近底部,約1cm(我一般是距底部0.5mm)。功
                                 
                                率根據儀器不同會有所不同,但你可以觀察液面,有波動但不要太劇烈就好。
                                 
                                2*破3S停10S,破個二三十次看看。

                                3*變幅桿位置擺放也要注意,聽聲音如果不對的話就要及時調整。另外可以從菌濃度方面考慮。 在破碎時
                                 
                                試著加大體積,強度最好不要超過60%.
                                 
                                4*嘗試超8s停8s,對有些菌體蛋白來說,你的方法很難散熱,導致蛋白變性產生氣泡,最好停頓時間稍長一
                                 
                                些,這種情況多見于包涵體形式的蛋白。

                                鏈霉菌(放線菌)超聲破碎的,用的方法條件是什么?
                                 
                                前處理一般就是配置成一定濃度的菌懸液。

                                使用超聲破碎時采用的具體條件是:

                                (1)取細菌的24 h培養(yǎng)液于5 000 r/min 下離心5 min收集菌體.
                                 
                                (2)用pH 7.5的Na2HPO -NaH2PO 緩沖液洗滌3次,再用該緩沖液將菌體配成1:3的菌懸液.置于40
                                 
                                mL大塑料試管內.
                                 
                                (3)將大塑料試管置于冰浴中,采用超聲波破碎(功率200 W,1/2”探頭,破碎30 s,間歇30 S).
                                 
                                (4)破碎液于12 000 r/min下高速冷凍離心30 min,收集細胞碎片和上清夜.

                                 
                                    超聲破菌流程與 上述基本一致,就是洗滌菌體也可以用預冷的生理鹽水或pH8的Tris-HCl,洗滌一次就
                                 
                                可以。另外,超聲劑量隨樣品量、菌體改變比較大,功率可以到400-600w,超5s,停5s,冰浴,要加終
                                 
                                濃度1 mM的PMSF。為確定合適的超聲強度和次數,有必要隨時鏡檢觀察菌體是否完全破碎。
                                 
                                    放線菌屬于原核生物系統(tǒng)進化樹上的(G+C)摩爾百分含量(mol%)高的革蘭氏陽性菌
                                 
                                (Eubacteria)分枝類群,它雖然具有原核生物特有的分子生物學特性,但在其不同類群中,細胞壁的化學
                                 
                                組分變化很大。

                                    在做大腸桿菌超聲時,采用的是400W,超5停5的方法,效果不錯,但是用在鏈霉菌上,似乎沒什么效
                                 
                                果。會不會就是由于細胞壁組成差異造成的呢,因為大腸桿菌式屬于革蘭氏陰性菌的。

                                    再有鏡檢是檢驗破碎效果,但是細胞破碎程度和我需要的酶獲得之間有正比關系嗎?破碎時間長也會影響到
                                 
                                酶的活性。所以想問問anaisai戰(zhàn)友,你提供的“功率200 W,1/2”探頭,破碎30 s,間歇30 S”的條
                                 
                                件好像是用于破碎鏈霉菌孢子的,也可以用于發(fā)酵離心后的菌泥嗎?如果可以,你破碎的全程時間大概是多
                                 
                                少呢? 

                                    如果你需要的是胞內酶,細胞破碎程度和需要的酶獲得之間基本上有正比關系。破碎時間長的確會影響到
                                 
                                酶的活性。這就需要在最佳的破碎時間和酶活性之間做出判斷,最直接的辦法是先繪制相關曲線(酶活性和
                                 
                                時間的關系曲線)。

                                    實驗中,破碎的是棒狀桿菌(也是很難破壁的G+菌),破碎時間控制在30min左右,酶活較好。

                                 
                                如果是基質菌絲的話,好可以考慮用溶菌酶處理一下.

                                一般來講這幾種方法讀可以的:
                                 
                                一,液氮研磨
                                 
                                二,用french press破碎
                                 
                                三,超聲波破碎
                                四,溶菌酶處理預處理

                                    超聲波是物質介質中的一種彈性機械波,它既是一種波動形式,又是一種能量形式。超聲對細胞的作用主要
                                 
                                有熱效應,空化效應和機械效應。熱效應是當超聲在介質中傳播時,摩擦力阻礙了由超聲引起的分子震動,
                                 
                                使部分能量轉化為局部高熱(42-43℃)?栈窃诔曊丈湎,生物體內形成空泡,隨著空泡震動和
                                 
                                其猛烈的聚爆而產生出機械剪切壓力和動蕩。另外,空化泡破裂時產生瞬時高溫(約5000℃)、高壓(可達
                                 
                                500×104Pa),可使水蒸氣熱解離產生.OH自由基和.H原子,由.OH自由基和.H原子引起的氧化還原反應
                                 
                                可導致多聚物降解、酶失活、脂質過氧化和細胞殺傷。機械效應是超聲的原發(fā)效應,超聲波在傳播過程中介
                                 
                                質質點交替地壓縮與伸張構成了壓力變化,引起細胞結構損傷。損傷作用的強弱與超聲的頻率和強度密切相
                                 
                                關。

                                    100g大腸桿菌溶于1L破碎液里(破碎掖:50mM Tris-Cl(PH8.5) 5mM EDTA 0.14M NaCl),攪
                                 
                                拌,發(fā)現菌液發(fā)粘,菌體不能夠很好分散,用高壓勻質機破碎,加壓后,菌液不能進入勻質機,速度很慢,
                                 
                                請問是何原因?能有好的辦法解決,很好用勻質機快速破碎菌體?
                                 
                                將破碎液的量加大,不能很好分散可能是量太大 。超聲處理5-10分鐘,菌液粘度即可大大降低,也可促進
                                 
                                菌體分散。

                                    不同型號的設備功率不一樣,功率的大小決定了使用變幅桿的大小范圍(直徑2mm至幾十毫米),你使

                                用多大的變幅桿就在設備的上調至該刻度(很簡單的)!變幅桿的大小決定了處理量5ml一下選3mm,5~

                                50ml可選6~8mm,50ml以上選10mm的變幅桿,依此類推!占空比不用關心的,主要是指超聲時間和停

                                頓時間的比值。

                                酵母破碎的問題

                                    一般的PROTOCOL都是用glass beads  破碎酵母細胞sigma G-8772 酵母破碎效果好的我所做過的方
                                 
                                法中還是玻璃珠,效率很高,而且對目的蛋白活性不會有什么影響。一般應該用這個方法。

                                     化學裂解的方法,10g酵母 加1ml的乙酸乙酯,充分攪拌至液體狀。此法的裂解效果不錯的
                                 
                                加尿素裂解液(尿素8mol/L, NaCl 0.5mol/L,Tris 20mmol/L, EDTA 20mmol/L, 2%SDS, PH值
                                 
                                8.0),據說效果可以。
                                 
                                畢氏酵母細胞破碎法
                                 
                                    在破碎遇到的問題是菌體濃度太低,OD620nm在4-6之間。細胞破碎儀的最低破碎體積為4ml左右,這
                                 
                                樣再稀釋一倍,OD就到2-3啦,我們懷疑破碎完溶出蛋白和酶活測定時會測不準。所以請教大家細胞破碎時
                                 
                                最低的菌濃多少為下限?我們的菌是一種棒桿菌。 破碎后,你可將液體放入透析袋中濃縮。
                                 
                                    我們所做的方法是按照1:20的比例將離心后的菌體(e.coli)溶解于超聲緩沖液(50mM 磷酸 pH
                                 
                                8.0 )300w 10s/10s 破碎20分鐘。做了鏡檢!基本全被破碎了!我做蛋白純化的,做的包涵體。實驗中
                                 
                                我們的菌體濃度相對獨立,與培養(yǎng)液中的菌體od無關,不收其限制,便于操作者調控。
                                 
                                一般按每g濕菌體加5-10ml裂菌緩沖液。
                                 
                                超聲肯定會產熱,所以一定要有降溫裝置,除非你需要得成分耐高溫。

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