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基因組測序、質(zhì)粒DNA準(zhǔn)備、DNA測序、PCR 擴(kuò)增、克隆等項(xiàng)目。
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服務(wù)背景:
隨著自然科學(xué)領(lǐng)域?qū)蚪M學(xué)探索的深入及由其催生的蛋白質(zhì)組學(xué)、生物信息學(xué)及系統(tǒng)生物學(xué)等重要學(xué)科的發(fā)展,給整個(gè)生命科學(xué)的研究帶來了前所未有的機(jī)遇和挑戰(zhàn);蚪M學(xué)作為其中一個(gè)重要組成部分,有著廣闊的發(fā)展空間。目前我國基因組學(xué)的研究尚無完整、長期的規(guī)劃,很多科研工作尚處在起步階段。如何充分利用我國豐富的微生物資源和已有的基因組學(xué)研究成果,深入開展微生物基因組研究,以滿足國家在能源、環(huán)境、人口健康與醫(yī)藥、生物新材料、農(nóng)業(yè)等領(lǐng)域的戰(zhàn)略需求是我們面臨的重大課題。為適應(yīng)生命科學(xué)發(fā)展的市場需求,我公司建立起一個(gè)包括基因克隆、模板制備與檢測、測序及分析等技術(shù)領(lǐng)域的高水平人員梯隊(duì)和一個(gè)設(shè)施齊全、技術(shù)先進(jìn)的實(shí)驗(yàn)平臺(tái),并形成了一整套高效、完善的標(biāo)準(zhǔn)化實(shí)驗(yàn)流程和工作制度,具備各類樣品的DNA提取和純化、PCR擴(kuò)增、DNA模板質(zhì)量檢測、DNA序列測定和分析的能力。
技術(shù)實(shí)力:
我公司基因組學(xué)實(shí)驗(yàn)室現(xiàn)已經(jīng)完成了兩株細(xì)菌的全基因組測序,與美國夏威夷大學(xué)合作進(jìn)行“木瓜全基因組測序計(jì)劃”,該計(jì)劃是我國科學(xué)界繼人類基因組和超級雜交水稻全基因組后參與的第三個(gè)大型基因組的破譯。結(jié)合生物信息學(xué)平臺(tái)提供的技術(shù)支持,還可進(jìn)行引物設(shè)計(jì)、序列拼接和修改以及序列比對、基因注釋等進(jìn)一步的分析工作?梢詫(shí)現(xiàn)每天7000份質(zhì)粒DNA的提取、純化和檢測,500份PCR樣品的膠回收純化以及800個(gè)測序反應(yīng)。
基因組學(xué)服務(wù)項(xiàng)目:
服務(wù)內(nèi)容 備注 完成時(shí)間
測序 客戶提供質(zhì)粒、菌液 3-5天
菌株培養(yǎng)及質(zhì)粒純化 客戶提抗性、插入片段長度等信息 2天
PCR 擴(kuò)增 客戶提供有關(guān)樣品來源及DNA提取詳細(xì)信息 3天
PCR 反應(yīng) 客戶提供模板、引物 2天
DNA提取 客戶提供組織、血液等樣本 3天
PCR 產(chǎn)物純化 客戶提供PCR原液 2-3天
分子克隆(PCR產(chǎn)物) 根據(jù)客戶需要對小片段及大片段PCR產(chǎn)物連載體建克隆 12天
引物設(shè)計(jì) 根據(jù)客戶樣品要求設(shè)計(jì)試驗(yàn)用引物 3天
設(shè)計(jì)制備載體 根據(jù)客戶樣品要求設(shè)計(jì)下步試驗(yàn)所需載體 1-2天
特殊引物的合成 客戶提供引物序列 3天
Email提供測序報(bào)告 報(bào)告包括一份測序彩圖,一份序列
通用引物 M13(F20)、M13(R27)、M13(F40)、M13(F41) 、T7 promoter、Sp6 promoter,其他常用引物根據(jù)客戶需求將逐步增加。
定量PCR SYBR Green:客戶需提供模板、引物:Taqman:客戶需提供模板、引物、水解探針、表準(zhǔn)品 3-5 天
測序服務(wù)保障:
1.時(shí)間保障:通常情況下,3-5個(gè)工作日內(nèi)通過E-mail發(fā)送測序結(jié)果(大量樣品除外),隨后可根據(jù)客戶需要提供打印的測序報(bào)告單、彩色峰形圖譜和序列文件(收費(fèi)項(xiàng)目)。如服務(wù)中途出現(xiàn)意外影響完成日期,我們會(huì)提前通知您。
2.質(zhì)量結(jié)果保障:測序結(jié)果,正常情況下一次測序的長度不低于 500bp ,通常達(dá) 700bp 以上。 通常從 20-30bp以后到大約500bp之間的序列是很可靠的,其余序列只能作為參考。序列以峰型圖為準(zhǔn)。保證每一個(gè)反應(yīng)提供不低于500bp的序列及相關(guān)信息;由于樣品種類不同,測序的難度也不同,對于無法判讀的序列,我們保證進(jìn)行重復(fù)試驗(yàn),若仍然無法讀出序列,則免收測序費(fèi)用。由于DNA結(jié)構(gòu)上的原因造成的測序失敗我們要正常收費(fèi);查看測序報(bào)告的常用生物軟件有Chromas、DNAStar等。
測序服務(wù)結(jié)果說明:
由于樣品種類不同,測序的難度也不同,對于無法判讀的序列,我們保證進(jìn)行重復(fù)試驗(yàn),若仍然無法讀出序列,則免收測序費(fèi)用;由于目前測序方法的局限,測序引物后10bp—40bp不一定準(zhǔn)確,500bp后僅供參考;由于DNA結(jié)構(gòu)上的原因造成的測序失敗我們要正常收費(fèi);查看測序報(bào)告的常用生物軟件有Chromas、DNAStar等。
基因組學(xué)技術(shù)服務(wù)設(shè)備 :
儀器名稱及型號 制造商
DNA Sequence Analyzer 3730 Applied Biosystems
Real Time PCR System Applied Biosystems
P/ACEMDQ Capillary Electrophoresis System Beckman Coulter
SpectraMAX190 Molecular Devices
DUSeriers640 UV/VIS Spectrophotometers Beckman Coulter
Microplate Manager Bio-Rad
我公司基因組學(xué)實(shí)驗(yàn)室技術(shù)人員經(jīng)過兩年多的反復(fù)實(shí)踐,在專業(yè)科技帶頭人的指導(dǎo)下, 探索出適用于ABI3730測序儀的測序反應(yīng)模式、PCR產(chǎn)物克隆及純化方法,在發(fā)揮了該測序儀在長度和可靠性方面的優(yōu)勢的同時(shí)保證了測序質(zhì)量。